吉野　知子YOSHINO Tomokoヨシノ　トモコ

業績情報

氏名・連絡先

• 氏名

  ヨシノ　トモコ, 吉野　知子, YOSHINO Tomoko

• eメールアドレス

  y-tomokocc.tuat.ac.jp

主たる所属・職名

• 工学研究院　生命機能科学部門, 教授

その他の所属

• 工学部　生命工学科
• 工学府　生命工学専攻
• グローバルイノベーション研究院

経歴

• -
  東京農工大学大学院共生科学技術研究院　特任助教授
  自 2006年
• -
  早稲田大学生命医療工学研究所　助手
  自 2005年, 至 2006年
• -
  日本学術振興会　特別研究員（DC1）
  自 2002年, 至 2005年
• -
  RNAture Inc.(USA)　研究員
  自 2000年, 至 2001年

学歴

• 東京農工大学
  博士

教育・研究活動状況

• バイオ分析デバイスの開発や微生物を用いたナノマテリアル創製を行い、医工連携・産学連携を推進しています。特にがん患者の血中に流れる希少ながん細胞の遺伝子解析技術・デバイスを開発し、新たながん診断マーカーや創薬ターゲットの探索を目指しています。

研究分野

• A689　ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学）, A27040　バイオ機能応用、バイオプロセス工学
• A689　ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学）, A27040　バイオ機能応用、バイオプロセス工学

研究キーワード

• 分子生物学、生物工学

研究テーマ

• 膜貫通タンパク質解析ツールの開発
  自 9999
• バイオナノ磁性粒子の応用研究
  自 9999

科学研究費助成事業

• 挑戦的研究（萌芽）
  生体内物質輸送に資する磁場制御可能な革新的細胞型キャリアの構築
  自 2023年, 至 2023年
• 基盤研究(B)
  藻類オルガネラ工学に基づく医薬品原料の多段階生合成プロセスの創成
  自 2023年, 至 2023年
• 基盤研究(B)
  藻類オルガネラ工学に基づく医薬品原料の多段階生合成プロセスの創成
  自 2022年, 至 2022年
• 挑戦的研究（萌芽）
  生体内物質輸送に資する磁場制御可能な革新的細胞型キャリアの構築
  自 2022年, 至 2022年
• 挑戦的研究（萌芽）
  細胞外小胞の不均質性を可視化するデジタルMSイメージング
  自 2022年, 至 2022年
• 基盤研究(B)
  藻類オルガネラ工学に基づく医薬品原料の多段階生合成プロセスの創成
  自 2021年, 至 2021年
• 挑戦的研究（萌芽）
  血小板が誘起する血中循環腫瘍細胞の転移性変化の計測技術の確立
  自 2019年, 至 2020年
• 基盤研究(B)
  微細藻類のオイルボディ工学による医薬品生産プロセスの開発
  自 2019年, 至 2019年
• 基盤研究(B)
  微細藻類のオイルボディ工学による医薬品生産プロセスの開発
  自 2018年, 至 2018年
• 基盤研究(B)
  マグネトソーム膜のin vivo改質による膜タンパク質の機能向上
  自 2017年, 至 2020年
• 基盤研究(B)
  微細藻類のオイルボディ工学による医薬品生産プロセスの開発
  自 2017年, 至 2017年
• 基盤研究(B)
  バイオシリカ工学に基づく有用珪藻の革新的な物質生産プロセスの創成
  自 2016年, 至 2016年
• 基盤研究(B)
  バイオシリカ工学に基づく有用珪藻の革新的な物質生産プロセスの創成
  自 2015年, 至 2015年
• 基盤研究(S)
  磁気微粒子合成オルガネラの再構築による有用物質生産磁性細菌の創製
  自 2015年, 至 2015年
• 基盤研究(B)(一部基金)
  ヒト由来膜タンパク質の磁性粒子上での機能発現に向けたIVD法の開発
  自 2014年, 至 2016年
• 基盤研究（Ｂ）
  バイオシリカ工学に基づく有用珪藻の革新的な物質生産プロセスの創成
  自 2014年, 至 2014年
• 基盤研究（Ｓ）
  磁気微粒子合成オルガネラの再構築による有用物質生産磁性細菌の創製
  自 2014年, 至 2014年
• 基盤研究(S)
  磁気微粒子合成オルガネラの再構築による有用物質生産磁性細菌の創製
  自 2013年, 至 2013年
• 基盤研究(S)
  磁気微粒子合成オルガネラの再構築による有用物質生産磁性細菌の創製
  自 2012年, 至 2012年
• 新学術領域研究(公募)
  磁性粒子上のソフト界面制御に向けた刺激応答性人工タンパク質の分子設計
  自 2011年, 至 2012年
• 挑戦的萌芽研究
  幹細胞分化能の網羅的評価に向けた細胞核力学特性計測技術
  自 2011年, 至 2011年
• 基盤研究(S)
  磁気微粒子合成オルガネラの再構築による有用物質生産磁性細菌の創製
  自 2011年, 至 2011年
• 新学術領域研究(研究領域提案型)
  ＮＳポリペプチドの特性解析と細胞磁気ラベリングへの応用
  自 2009年, 至 2010年
• 若手研究(B)
  構造タンパク質を用いたナノ小胞への膜タンパク質集積化技術の開発
  自 2009年, 至 2010年
• 萌芽研究
  オンチップ型フォトセンサアレイを用いた細胞プロファイリング技術の開発
  自 2009年, 至 2009年
• 萌芽研究
  オンチップ型フォトセンサアレイを用いた細胞プロファイリング技術の開発
  自 2008年, 至 2008年
• 特定領域研究
  磁性ドットおよび改質表面磁性膜によるターゲット細胞トラップ技術の開発
  自 2008年, 至 2008年
• 若手研究(B)
  磁性細菌粒子膜への膜貫通タンパク質の発現に向けた粒子膜改編に関する研究
  自 2006年, 至 2007年

論文

• Lipid Membrane Modulated Control of Magnetic Nanoparticles within Bacterial Systems
  Ryoto Tomoe, Kazushi Fujimoto, Tsuyoshi Tanaka, Atsushi Arakaki, David Kisailus, Tomoko Yoshino
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Omega-3 polyunsaturated fatty acids (PUFAs) such as eicosapentaenoic acid (EPA, C20:5 omega-3) are essential for human health and fish growth especially in aquaculture sector. However, with the growing of aquaculture, the demand of PUFA supply also has been increasing. Fistulifera solaris, a marine diatom, is known for its ability to accumulate 65% of lipid content per dry cell weight, and can produce the high content of EPA. Thus, this diatom shows a great potential to be a feedstock of omega-3 PUFAs for fish feeds. In this study, in order to further understand and enhance the metabolism of PUFA biosynthesis in the diatom, the impacts of ketoacyl-ACP synthase (KAS) and ketoacyl-CoA synthase (KCS) inhibition on the PUFA production were analyzed by adding the specific inhibitors. KAS and KCS enzymes both play a role in the fatty acid elongation. As a result, the inhibition of KAS showed an increase in EPA content without arresting the cell growth. On the other hand, inhibition of KCS did not show a significant impact on the PUFA content in F. solaris. Our finding suggests that the specific suppression of KAS function can be a promising way to enhance the omega-3 PUFA production in F. solaris. (C) 2021, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2023年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 136, 3, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 253, 260
• Lipid membrane modulated control of magnetic nanoparticles within bacterial systems
  Tomoe, Ryoto; Fujimoto, Kazushi; Tanaka, Tsuyoshi; Arakaki, Atsushi; Kisailus, David; Yoshino, Tomoko
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Bacterial magnetosomes synthesized by the magnetotactic bacterium Magnetospirillum magneticum are suitable for biomedical and biotechnological applications because of their high level of chemical purity of mineral with well-defined morphological features and a biocompatible lipid bilayer coating. However, utilizations of native magnetosomes are not sufficient for maximum effectiveness in many applications as the appropriate particle size differs. In this study, a method to control magnetosome particle size is developed for integration into targeted technological applications. The size and morphology of magnetosome crystals are highly regulated by the complex interactions of magnetosome synthesis-related genes; however, these interactions have not been fully elucidated. In contrast, previous studies have shown a positive correlation between vesicle and crystal sizes. Therefore, control of the magnetosome vesicle size is tuned by modifying the membrane lipid composition. Exogenous phospholipid synthesis pathways have been genetically introduced into M. magneticum. The experimental results show that these phospholipids altered the properties of the magnetosome membrane vesicles, which yielded larger magnetite crystal sizes. The genetic engineering approach presented in this study is shown to be useful for controlling magnetite crystal size without involving complex interactions of magnetosome synthesis-related genes.& COPY; 2023, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2023年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 136, 3, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 253, 260
• Characterization of oil body-associated proteins obtained from oil bodies with different sizes in oleaginous diatom Fistulifera solaris.
  Marshila Kaha, Masayoshi Noda, Yoshiaki Maeda, Yumika Kaneko, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Omega-3 polyunsaturated fatty acids (PUFAs) such as eicosapentaenoic acid (EPA, C20:5 omega-3) are essential for human health and fish growth especially in aquaculture sector. However, with the growing of aquaculture, the demand of PUFA supply also has been increasing. Fistulifera solaris, a marine diatom, is known for its ability to accumulate 65% of lipid content per dry cell weight, and can produce the high content of EPA. Thus, this diatom shows a great potential to be a feedstock of omega-3 PUFAs for fish feeds. In this study, in order to further understand and enhance the metabolism of PUFA biosynthesis in the diatom, the impacts of ketoacyl-ACP synthase (KAS) and ketoacyl-CoA synthase (KCS) inhibition on the PUFA production were analyzed by adding the specific inhibitors. KAS and KCS enzymes both play a role in the fatty acid elongation. As a result, the inhibition of KAS showed an increase in EPA content without arresting the cell growth. On the other hand, inhibition of KCS did not show a significant impact on the PUFA content in F. solaris. Our finding suggests that the specific suppression of KAS function can be a promising way to enhance the omega-3 PUFA production in F. solaris. (C) 2021, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2023年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 135, 5, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 359, 368
• Characterization of oil body-associated proteins obtained from oil bodies with different sizes in oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Kaha, Marshila; Noda, Masayoshi; Maeda, Yoshiaki; Kaneko, Yumika; Yoshino, Tomoko; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Oil body-associated proteins from the oleaginous diatom Fistulifera solaris were identified by proteomic analysis of oil bodies of various sizes (small, middle, and large) by time-dependent culturing upon nutrient-starvation at 36, 96 and 168 h. This diatom strain has the capability to accumulate neutral lipids and triacylglycerol. Liquid chromatography -tandem mass spectrometry analysis revealed 662 proteins in all oil body sizes. Among these, 132 proteins were pre-dicted to be localized to the endoplasmic reticulum. Seventeen proteins that exhibited a positive correlation with gene expression and the oil body size were selected as novel candidates for oil body-associated proteins. Among the 17 protein candidates, two proteins encoded by fso:g8246 and fso:g10200 were confirmed to be localized on the surface of the oil body and endoplasmic reticulum. A protein encoded by fso:g2514, which is involved in sterol biosynthesis, was also identified. This protein was likely to localize to mitochondria; however, inhibitor assays suggested that it might play a role in lipid degradation. Our work provides new insights into the proteomics of microalgae and provides a valuable strategy for boosting lipid productivity in microalgae.(c) 2023, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2023年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 135, 5, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 359, 368
• Chromosome-Scale Genome Assembly of the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  Maeda, Yoshiaki; Kobayashi, Ryosuke; Watanabe, Kahori; Yoshino, Tomoko; Bowler, Chris; Matsumoto, Mitsufumi; Tanaka, Tsuyoshi
  MARINE BIOTECHNOLOGY
  SPRINGER
  Microalgae including diatoms are of interest for environmentally friendly manufacturing such as production of biofuels, chemicals, and materials. The highly oil-accumulating marine diatom Fistulifera solaris has been studied as a promising host organism to be employed for these applications. Recently reported large-scale genetic engineering based on episomal vectors for diatoms could be useful to further enhance the potential of F. solaris, whereas we need to understand more the mode-of-action of diatom centromeres to rationally design the episomal vectors for stable extrachromosomal maintenance. Our previous genome analysis with pyrosequencing (short read sequencing) had generated the fragmented scaffolds which were not useful to predict centromeres on each chromosome. Here, we report the almost complete chromosomal structure of the genome of F. solaris using a long-read nanopore sequencing platform MinION. From just one single run using a MinION flow-cell, the chromosome-scale assembly with telomere-to-telomere resolution was achieved for 41 out of 44 chromosomes. Putative centromere regions were predicted from the 16 chromosomes, and we discovered putative consensus motifs in the predicted centromeres. Similar motif search had been performed in model diatoms, but no consensus motif was found. Therefore, this is the first study to successfully estimate consensus motifs in diatom centromeres. The chromosome-scale assembly also suggests the potential existence of multi-copy mini-chromosomes and tandemly repeated lipogenesis genes related to the oleaginous phenotype of F. solaris. Findings of this study are useful to understand and further engineer the oleaginous phenotype of F. solaris.
  2022年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 24, 4, 1436-2228, DOI(公開)(r-map), 788, 800
• Single-cell genotyping of phytoplankton from ocean water by gel-based cell manipulation
  Yoshino, Tomoko; Mao, Yihao; Maeda, Yoshiaki; Negishi, Ryo; Murata, Satoshi; Moriya, Seiichiro; Shimada, Hirofumi; Arakaki, Atsushi; Kobayashi, Kenichi; Hagiwara, Yoshitsugu; Okamoto, Kazutoshi; Tanaka, Tsuyoshi
  BIOTECHNOLOGY JOURNAL
  WILEY-V C H VERLAG GMBH
  A comprehensive understanding of phytoplankton diversity is valuable for assessing an environment of interest as phytoplankton are primary producers in various aquatic food webs. Microscopic analyses are useful for diversity assessment based on characteristic cell morphologies. However, phylogenetic classification based solely on morphology requires an extremely high level of expertise. The genetic approach is another option for evaluating phytoplankton diversity; however, it cannot reveal morphological information. To integrate these two approaches, an original technology was developed, that is referred to as microcavity array (MCA)/gel-based cell manipulation (GCM). The model experiments using monocultures of various phytoplankton indicated that the efficiencies of cell recovery and isolation of single-cell plankton were dependent on cell size and shape. Cells with widths larger than the cavity width showed high level of recovery and isolation efficiency. Subsequent whole-genome amplification (WGA) of isolated single-cell plankton provided a sufficient amount (approximate to 30 mu g) of WGA products for genetic analyses. Furthermore, it is showed that MCA/GCM could directly analyze phytoplankton in ocean water obtained from Suruga Bay, Japan, without any cumbersome pretreatment. These results indicate that MCA/GCM technology is a powerful tool for elucidating the phytoplankton diversity in marine environment.
  2022年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 17, 6, 1860-6768, DOI(公開)(r-map)
• Direct Ink Write Printing of Chitin-Based Gel Fibers with Customizable Fibril Alignment, Porosity, and Mechanical Properties for Biomedical Applications
  Montroni, Devis; Kobayashi, Takeru; Hao, Taige; Lublin, Derek; Yoshino, Tomoko; Kisailus, David
  JOURNAL OF FUNCTIONAL BIOMATERIALS
  MDPI
  A fine control over different dimensional scales is a challenging target for material science since it could grant control over many properties of the final material. In this study, we developed a multivariable additive manufacturing process, direct ink write printing, to control different architectural features from the nano- to the millimeter scale during extrusion. Chitin-based gel fibers with a water content of around 1500% were obtained extruding a polymeric solution of chitin into a counter solvent, water, inducing instant solidification of the material. A certain degree of fibrillar alignment was achieved basing on the shear stress induced by the nozzle. In this study we took into account a single variable, the nozzle's internal diameter (NID). In fact, a positive correlation between NID, fibril alignment, and mechanical resistance was observed. A negative correlation with NID was observed with porosity, exposed surface, and lightly with water content. No correlation was observed with maximum elongation (similar to 50%), and the scaffold's excellent biocompatibility, which appeared unaltered. Overall, a single variable allowed a customization of different material features, which could be further tuned, adding control over other aspects of the synthetic process. Moreover, this manufacturing could be potentially applied to any polymer.
  2022年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 13, 2, DOI(公開)(r-map)
• Effects of fatty acid synthase-inhibitors on polyunsaturated fatty acid production in marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580
  Suhaimi, Noraiza; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Omega-3 polyunsaturated fatty acids (PUFAs) such as eicosapentaenoic acid (EPA, C20:5 omega-3) are essential for human health and fish growth especially in aquaculture sector. However, with the growing of aquaculture, the demand of PUFA supply also has been increasing. Fistulifera solaris, a marine diatom, is known for its ability to accumulate 65% of lipid content per dry cell weight, and can produce the high content of EPA. Thus, this diatom shows a great potential to be a feedstock of omega-3 PUFAs for fish feeds. In this study, in order to further understand and enhance the metabolism of PUFA biosynthesis in the diatom, the impacts of ketoacyl-ACP synthase (KAS) and ketoacyl-CoA synthase (KCS) inhibition on the PUFA production were analyzed by adding the specific inhibitors. KAS and KCS enzymes both play a role in the fatty acid elongation. As a result, the inhibition of KAS showed an increase in EPA content without arresting the cell growth. On the other hand, inhibition of KCS did not show a significant impact on the PUFA content in F. solaris. Our finding suggests that the specific suppression of KAS function can be a promising way to enhance the omega-3 PUFA production in F. solaris. (C) 2021, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2022年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 133, 4, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 340, 346
• Recent advances in research on biointerfaces: From cell surfaces to artificial interfaces
  Hori, Katsutoshi; Yoshimoto, Shogo; Yoshino, Tomoko; Zako, Tamotsu; Hirao, Gen; Fujita, Satoshi; Nakamura, Chikashi; Yamagishi, Ayana; Kamiya, Noriho
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Biointerfaces are regions where biomolecules, cells, and organic materials are exposed to environmental media or come in contact with other biomaterials, cells, and inorganic/organic materials. In this review article, six research topics on biointerfaces are described to show examples of state-of-art research approaches. First, biointerface design of nanoparticles for molecular detection is described. Functionalized gold nanoparticles can be used for sensitive detection of various target molecules, including chemical compounds and biomolecules, such as DNA, proteins, cells, and viruses. Second, the interaction between bacterial cell surfaces and material surfaces, including the introduction of advances in analytical methods and theoretical calculations, are explained as well as their applications to bioprocesses. Third, bioconjugation technologies for localizing functional proteins at biointerfaces are introduced, in particular, by focusing the potential of enzymes as a catalytic tool for designing different types of bioconjugates that function at biointerfaces. Forth topics is focusing on lipid-protein interaction in cell membranes as natural biointerfaces. Examples of membrane lipid engineering are introduced, and it is mentioned how their compositional profiles affect membrane protein functions. Fifth topic is the physical method for molecular delivery across the biointerface being developed currently, such as highly efficient nanoinjection, electroporation, and nanoneedle devices, in which the key is how to perforate the cell membrane. Final topic is the chemical design of lipid-or polymer-based RNA delivery carriers and their behavior on the cell interface, which are currently attracting attention as RNA vaccine technologies targeting COVID-19. Finally, future directions of biointerface studies are presented. (c) 2021, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2022年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 133, 3, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 195, 207
• Signaling probe design for amplification-free detection of bacterial genes using DNA microarray
  Uno, Haruka; Takeuchi, Hiyori; Yoshino, Tomoko; Tadenuma, Takashi; Hirakawa, Yuko; Maeda, Yoshiaki; Taguchi, Tomoyuki; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  DNA microarrays are useful to detect microorganisms for various purposes including clinical testing and food safety. However, conventional DNA microarrays need complicated operations such as amplification, fluorescence labeling, and washing steps. To address this issue, we previously developed the signaling probe-based DNA microarray system that can eliminate these steps, and demonstrated a direct detection of bacterial genes. Nonetheless, this system requires well designed probe sets due to the fluorescence resonance energy transfer (FRET)-based mode of action. Up to date, the probe design was highly dependent on the trial-and-error processes. In this study, we propose a strategy to rationally design the sequences of signaling probes based on the thermodynamic analysis. This analysis aided to improve the probe performance approximately 2.8 times, without experiments, by suppressing the secondary structure formation of the probes. We successfully demonstrated the specific and amplification-free detection of 5S rRNA from total RNA extracted from Escherichia coli within 30 min. (c) 2021, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2022年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 133, 2, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 133, 139
• Transcriptomic profiling of single circulating tumor cells provides insight into human metastatic gastric cancer
  Negishi, Ryo; Yamakawa, Hitomi; Kobayashi, Takeru; Horikawa, Mayuko; Shimoyama, Tatsu; Koizumi, Fumiaki; Sawada, Takeshi; Oboki, Keisuke; Omuro, Yasushi; Funasaka, Chikako; Kageyama, Akihiko; Kanemasa, Yusuke; Tanaka, Tsuyoshi; Matsunaga, Tadashi; Yoshino, Tomoko
  COMMUNICATIONS BIOLOGY
  NATURE PORTFOLIO
  Transcriptome analysis of circulating tumor cells (CTCs), which migrate into blood vessels from primary tumor tissues, at the single-cell level offers critical insights into the biology of metastasis and contributes to drug discovery. However, transcriptome analysis of single CTCs has only been reported for a limited number of cancer types, such as multiple myeloma, breast, hepatocellular, and prostate cancer. Herein, we report the transcriptome analysis of gastric cancer single-CTCs. We utilized an antigen-independent strategy for CTC isolation from metastatic gastric cancer patients involving a size-dependent recovery of CTCs and a single cell isolation technique. The transcriptomic profile of single-CTCs revealed that a majority of gastric CTCs had undergone epithelial-mesenchymal transition (EMT), and indicated the contribution of platelet adhesion toward EMT progression and acquisition of chemoresistance. Taken together, this study serves to employ CTC characterization to elucidate the mechanisms of chemoresistance and metastasis in gastric cancer. Ryo Negishi et al. utilize a size-dependent recovery method with gel-based cell manipulation to isolate single circulating tumor cells (CTCs) for transcriptomic analysis. They demonstrate the utility of this approach by analyzing the transcriptomic profile of CTCs from human gastric cancer patients.
  2022年01月11日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 5, 1, DOI(公開)(r-map)
• Amplification-free detection of bacterial genes using a signaling probe-based DNA microarray
  Taguchi, Tomoyuki; Ishikawa, Machi; Ichikawa, Momoko; Tadenuma, Takashi; Hirakawa, Yuko; Yoshino, Tomoko; Maeda, Yoshiaki; Takeuchi, Hiyori; Nojima, Daisuke; Tanaami, Takeo; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
  ELSEVIER ADVANCED TECHNOLOGY
  In this study, we developed a novel DNA microarray system that does not require fluorophore-labeling, amplification, or washing of the target nucleic acid fragments. Two types of DNA probes (so-called signaling probes) labeled with a fluorescence dye (Cy3) and quencher molecule (BHQ2) were spotted on the DNA microarray such that fluorescent signals of Cy3 could be quenched by BHQ2 due to duplex formation between the probes. The addition of the target DNA or RNA fragments disrupted the duplex formed by the probes, resulting in the generation of fluorescence signals. We examined the assay conditions of the signaling probe-based DNA microarray, including the design of the probes, hybridization temperatures, and methods for fragmentation of target molecules. Since this approach does not require time-consuming processes, including labeling, amplification, and washing, the assay achieved specific detection of 16S rDNA and 16S rRNA extracted from Escherichia coli within 60 min, which was significantly rapid compared to conventional PCR-dependent DNA microarrays.
  2021年12月15日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 194, 0956-5663, DOI(公開)(r-map)
• Lensless imaging-based discrimination between tumour cells and blood cells towards circulating tumour cell cultivation
  Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Kogiso, Atsushi; Negishi, Ryo; Takabayashi, Tomohiro; Tago, Hikaru; Lim, Tae-Kyu; Harada, Manabu; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  ANALYST
  ROYAL SOC CHEMISTRY
  Circulating tumour cells (CTCs) are recognized as important markers for cancer research. Nonetheless, the extreme rarity of CTCs in blood samples limits their availability for multiple characterization. The cultivation of CTCs is still technically challenging due to the lack of information of CTC proliferation, and it is difficult for conventional microscopy to monitor CTC cultivation owing to low throughput. In addition, for precise monitoring, CTCs need to be distinguished from the blood cells which co-exist with CTCs. Lensless imaging is an emerging technique to visualize micro-objects over a wide field of view, and has been applied for various cytometry analyses including blood tests. However, discrimination between tumour cells and blood cells was not well studied. In this study, we evaluated the potential of the lensless imaging system as a tool for monitoring CTC cultivation. Cell division of model tumour cells was examined using the lensless imaging system composed of a simple setup. Subsequently, we confirmed that tumour cells, JM cells (model lymphocytes), and erythrocytes exhibited cell line-specific patterns on the lensless images. After several discriminative parameters were extracted, discrimination between the tumour cells and other blood cells was demonstrated based on linear discriminant analysis. We also combined the highly efficient CTC recovery device, termed microcavity array, with the lensless-imaging to demonstrate recovery, monitoring and discrimination of the tumour cells spiked into whole blood samples. This study indicates that lensless imaging can be a powerful tool to investigate CTC proliferation and cultivation.
  2021年11月22日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 146, 23, 0003-2654, DOI(公開)(r-map), 7327, 7335
• Algal biomass production by phosphorus recovery and recycling from wastewater using amorphous calcium silicate hydrates
  Aketo, Tsuyoshi; Waga, Kentaro; Yabu, Yusuke; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Hanada, Akiko; Sano, Koki; Kamiya, Takashi; Takano, Hiroyuki; Tanaka, Tsuyoshi
  BIORESOURCE TECHNOLOGY
  ELSEVIER SCI LTD
  The phosphorous supply crisis is a major challenge for a sustainable society, and the algal industry is not un-related to this crisis. Recycling phosphorus from sewage wastewater is a potential way to address this issue. We previously developed amorphous calcium silicate hydrates (aCSH) as excellent phosphorus recovery materials. In this study, we designed a phosphorus recovery process using aCSH in a pilot-scale facility connected to a sewage wastewater treatment plant, and demonstrated the production of microalgal biomass using phosphorous-containing aCSH (P_aCSH). As a result, high phosphorous recovery rates (>80%) were obtained throughout the year. The carbohydrate-rich microalga Pseudoneochloris sp. NKY372003 was cultivable with P_aCSH. The biomass and carbohydrate productivity of this microalga with P_aCSH was comparable to that with conventional media. Approximately 94% of the phosphorus in P_aCSH was recycled into the biomass. This study successfully demonstrated the recycling the phosphorus recovered from wastewater for microalgal cultivation by aCSH.
  2021年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 340, 0960-8524, DOI(公開)(r-map)
• Assessment on the oil accumulation by knockdown of triacylglycerol lipase in the oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Maeda, Yoshiaki; Watanabe, Kahori; Kaha, Marshila; Yabu, Yusuke; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Tanaka, Tsuyoshi
  SCIENTIFIC REPORTS
  NATURE PORTFOLIO
  Microalgae are promising producers of biofuel due to higher accumulation of triacylglycerol (TAG). However, further improvement of the lipid metabolism is critical for feasible application of microalgae in industrial production of biofuel. Suppression of lipid degradation pathways is a promising way to remarkably increase the lipid production in model diatoms. In this study, we established an antisense-based knockdown (KD) technique in the marine oleaginous diatom, Fistulifera solaris. This species has a capability to accumulate high content of lipids. Tgl1 KD showed positive impact on cell growth and lipid accumulation in conventional culture in f/2 medium, resulting in higher oil contents compared to wild type strain. However, these impacts of Tgl1 KD were slight when the cells were subjected to the two-stage growth system. The Tgl1 KD resulted in slight change of fatty acid composition; increasing in C14:0, C16:0 and C16:1, and decreasing in C20:5. This study indicates that, although Tgl1 played a certain role in lipid degradation in F. solaris, suppression of only a single type of TAG lipase was not significantly effective to improve the lipid production. Comprehensive understanding of the lipid catabolism in this microalga is essential to further improve the lipid production.
  2021年10月22日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 11, 1, 2045-2322, DOI(公開)(r-map)
• Magnetosome membrane engineering to improve G protein-coupled receptor activities in the magnetosome display system
  Yoshino, Tomoko; Tayama, Sayaka; Maeda, Yoshiaki; Fujimoto, Kazushi; Ota, Shuhei; Waki, Shunya; Kisailus, David; Tanaka, Tsuyoshi
  METABOLIC ENGINEERING
  ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE
  Magnetotactic bacterium, Magnetospirillum magneticum, produces biogenic magnetic nanoparticles termed magnetosomes, which are primarily composed of a magnetite core and a surrounding lipid bilayer membrane. We have fabricated human transmembrane protein-magnetosome complexes by genetic engineering with embedding the transmembrane proteins of interest, in particular G protein-coupled receptors (GPCRs), in the magnetosome membrane. The magnetosomes provide a promising platform for high throughput ligand screening towards drug discovery, and this is a critical advantage of the magnetosome display system beyond conventional membrane platforms such as liposomes and lipid nano-discs. However, the human GPCRs expressed on the magnetosomes were not fully functionalized in bacterial membranes the most probably due to the lack of essential phospholipids such as phosphatidylcholine (PC) for GPCR functionalization. To overcome this issue, we expressed two types of PC-producing enzymes, phosphatidylcholine synthase (PCS) and phosphatidylethanolamine N-methyltransferase (PMT) in M. magneticum. As a result, generation and incorporation of PC in cell- and magnetosome-membranes were demonstrated. To the best of our knowledge, M. magneticum is the second bacterial species which had the PC-incorporated lipid membrane by genetic engineering. Subsequently, a GPCR, thyroid-stimulating hormone receptor (TSHR) and PCS were simultaneously expressed. We found that PC in the magnetosome membrane assisted the binding of TSHR and its ligand, indicating that the genetic approach demonstrated in this study is useful to enhance the function of the GPCRs displayed on the magnetosomes.
  2021年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 67, 1096-7176, DOI(公開)(r-map), 125, 132
• Prostaglandin production by the microalga with heterologous expression of cyclooxygenase
  Maeda, Yoshiaki; Tsuru, Yuki; Matsumoto, Nana; Nonoyama, Tomomi; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Tanaka, Tsuyoshi
  BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING
  WILEY
  Prostaglandins (PGs) are the physiologically active compounds synthesized from C20 polyunsaturated fatty acids (PUFAs) by cyclooxygenase (COX) and a series of PG synthases, and are utilized as pharmaceuticals. Currently, commercialized PGs are mainly produced by chemical synthesis under harsh conditions. By contrast, bioproduction of PGs can be an alternative, environmental-friendly, and inexpensive process with genetic engineering of model plants, although these conventional host organisms contain a limited quantity of PG precursors. In this study, we established an efficient PG production process using the genetically engineered microalga Fistulifera solaris which is rich in C20 PUFAs. A cox gene derived from the red alga Agarophyton vermiculophyllum was introduced into F. solaris. As a result, a transformant clone with high cox expression produced PGs (i.e., PGD(2), PGE(2), PGF(2 alpha), and 15-ketoPGF(2 alpha) derived from arachidonic acid, and PGD(3), PGE(3), and PGF(3 alpha) derived from eicosapentaenoic acid) as revealed by liquid chromatography/mass spectrometry. The total content of PGs was 1290.4 ng/g of dry cell weight, which was higher than that produced in the transgenic plant reported previously. The results obtained in this study indicate that the C20 PUFA-rich microalga functionally expressing COX is a promising host for PG bioproduction.
  2021年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 118, 7, 0006-3592, DOI(公開)(r-map), 2734, 2743
• Intron-mediated enhancement of transgene expression in the oleaginous diatom Fistulifera solaris towards bisabolene production
  Tanaka, Tsuyoshi; Maeda, Yoshiaki; Suhaimi, Noraiza; Tsuneoka, Chiharu; Nonoyama, Tomomi; Yoshino, Tomoko; Kato, Naohiro; Lauersen, Kyle J.
  ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
  ELSEVIER
  Microalgae have been widely recognized as promising hosts for production of various valuable compounds. However, low expression or silencing of transgenes in most microalgae species have hindered their broader implementation in biotechnological applications. In many eukaryotes, intron mediated enhancement (IME) of gene expression by inclusion of introns in heterologous sequences has resulted in a significant increase in transgene expression. This phenomenon has been found in a broad range of eukaryotic organisms including animals, plants, yeasts, and more recently green microalgae. However, no investigation has been conducted in diatoms. Here, we present findings of IME in the oleaginous diatom, Fistulifera solaris. Inclusion of a native intron found in glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) gene into a bleomycin-resistance gene (shble) resulted in enhancement of the mRNA level of shble, leading to increase in resistance and selection. We tested this IME in a heterologous plant sesquiterpene synthase gene construct (AgBS), leading to expression approximately double that of non-intron containing cassettes. The heterologous AgBS lead to accumulation of the sesquiterpene (E)-alpha-bisabolene, indicating that native precursors were amenable to manipulation and available in the cytoplasm of this diatom. To the best of our knowledge, this is the first study to investigate the effect of IME in diatoms.
  2021年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 57, 2211-9264, DOI(公開)(r-map)
• Engineered chlorophyll catabolism conferring predator resistance for microalgal biomass production
  Kashiyama, Yuichiro; Ishizuka, Yuki; Terauchi, Issei; Matsuda, Toshiki; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Yabuki, Akinori; Bowler, Chris; Tanaka, Tsuyoshi
  METABOLIC ENGINEERING
  ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE
  Production of valuable compounds including biofuels and pharmaceutical precursors derived from microalgae has garnered significant interest. Stable production of algal biomass is essential to make the microalgal industry commercially feasible. However, one of the largest issues is severe biological contamination by predators grazing the algal biomass, resulting in the crash of outdoor cultures. In the present study, we propose a novel engineering strategy for microalgae to cope with predators. The overexpression of plant chlorophyllase (CLH) in a microalga resulted in the enhancement of resistance to the predator. This result supported our hypothesis that CLH promotes chlorophyll breakdown in the chloroplasts of the microalgae when they are digested by the predator, generating the phototoxic catabolite chlorophyllide that damages the predator. To the best of our knowledge, this is the first study to establish predator-resistant microalgae by enhancing the CLH activity.
  2021年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 66, 1096-7176, DOI(公開)(r-map), 79, 86
• The Effects of Solvents and Solid-to-Solvent Rations on Ultrasound-Assisted Extracition of Carotenoids from Chlorella vulgaris
  Dianursanti, Arisyah Siregar, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  International Journal of Technology
  2020年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, １１, ５, DOI(公開)(r-map)
• Radular stylus of Cryptochiton stelleri: A multifunctional lightweight and flexible fiber-reinforced composite
  Pohl, Anna; Herrera, Steven A.; Restrepo, David; Negishi, Ryo; Jung, Jae-Young; Salinas, Chris; Wuhrer, Richard; Yoshino, Tomoko; McKittrick, Joanna; Arakaki, Atsushi; Nemoto, Michiko; Zavattieri, Pablo; Kisailus, David
  JOURNAL OF THE MECHANICAL BEHAVIOR OF BIOMEDICAL MATERIALS
  ELSEVIER
  Chitons are herbivorous invertebrates that use rows of ultrahard magnetite-based teeth connected to a flexible belt (radula) to rasp away algal deposits growing on and within rocky outcrops along coastlines around the world. Each tooth is attached to the radula by an organic structure (stylus) that provides mechanical support during feeding. However, the underlying structures within the stylus, and their subsequent function within the chiton have yet to be investigated. Here, we investigate the macrostructural architecture, the regional material and elemental distribution and subsequent nano-mechanical properties of the stylus from the Northern Pacific dwelling Cryptochiton stelleri. Using a combination of mu-CT imaging, optical and electron microscopy, as well as elemental analysis, we reveal that the stylus is a highly contoured tube, mainly composed of alpha-chitin fibers, with a complex density distribution. Nanoindentation reveals regiospecific and graded mechanical properties that can be correlated with both the elemental composition and material distribution. Finite element modeling shows that the unique macroscale architecture, material distribution and elemental gradients have been optimized to preserve the structural stability of this flexible, yet robust functionally-graded fiber-reinforced composite tube, providing effective function during rasping. Understanding these complex fiber-based structures offers promising blueprints for lightweight, multifunctional and integrated materials.
  2020年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 111, 1751-6161, DOI(公開)(r-map)
• Performance evaluation of a high-throughput separation system for circulating tumor cells based on microcavity array
  Negishi, Ryo; Saito, Hyuga; Iwata, Reito; Tanaka, Tsuyoshi; Yoshino, Tomoko
  ENGINEERING IN LIFE SCIENCES
  WILEY
  Circulating tumor cells (CTCs) are widely known as useful biomarkers in the liquid biopsies of cancer patients. Although single-cell genetic analysis of CTCs is a promising diagnostic tool that can provide detailed clinical information for precision medicine, the capacity of single-CTC isolation for genetic analysis requires improvement. To overcome this problem, we previously developed a multiple single-cell encapsulation system for CTCs using hydrogel-encapsulation, which allowed for the high-throughput isolation of single CTCs. However, isolation of a single cell from adjacent cells remained difficult and often resulted in contamination by neighboring cells due to the limited resolution of the generated hydrogel. We developed a novel multiple single-cell encapsulation system equipped with a high magnification lens for high throughput and a more accurate single-cell encapsulation. The multiple single-cell encapsulation system has sufficient sensitivity to detect immune-stained CTCs, and could also generate a micro-scaled hydrogel that can isolate a single cell from adjacent cells within 10 mu m, with high efficiency. The proposed system enables high throughput and accurate single-cell manipulation and genome amplification without contamination from neighboring cells.
  2020年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 20, 11, 1618-0240, DOI(公開)(r-map), 485, 493
• CTC回収技術の開発とシングルセル核酸解析
  吉野 知子、根岸 諒
  Pharma Medica
  2020年07月, 研究論文（その他学術会議資料等）, 共同, 38, 7, DOI(公開)(r-map), 13, 17
• Characterization of a novel marine unicellular alga, Pseudoneochloris sp. strain NKY372003 as a high carbohydrate producer
  Aketo, Tsuyoshi; Hashizume, Rina; Yabu, Yusuke; Hoshikawa, Yumiko; Nojima, Daisuke; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Takano, Hiroyuki; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Production of biofuels and fine chemicals from biomass-derived carbohydrates through biorefinery attracts much attention because it is recognized as an environmentally friendly process. Microalgae can serve as promising carbohydrate producers for biorefinery rather than woody and crop biomass due to high biomass productivity, high CO2 fixation, and no competition with food production. However, microalgae with high carbohydrate productivity have not been well investigated despite intensive studies of microalgal lipid production. In this study, the carbohydrate production of Pseudoneochloris sp. strain NKY372003 isolated as a high carbohydrate producer, was investigated. Cultivation conditions with various combinations of nutrient contents and photon flux density were examined to maximize the biomass and carbohydrate productivities. At the optimal condition, the biomass and carbohydrate production of this strain reached 8.11 +/- 0.37 g/L and 5.5 +/- 0.2 g/L, respectively. As far as we know, this is the highest carbohydrate production by microalgae among ever reported. Cell staining with Lugol's solution visualized intracellular starch granules. Because algal starch can be converted to biofuels and building blocks of fine chemicals, Pseudoneochloris sp. NKY372003 will be a promising candidate for production of fermentable carbohydrates towards biofuels and fine chemicals production. (C) 2020, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2020年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 129, 6, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 687, 692
• Selection and characterization of microalgae with potential for nutrient removal from municipal wastewater and simultaneous lipid production
  Aketo, Tsuyoshi; Hoshikawa, Yumiko; Nojima, Daisuke; Yabu, Yusuke; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Takano, Hiroyuki; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Wastewater treatment, along with the simultaneous production of valuable chemical compounds, including lipids by microalgae is a challenging but attractive study. Towards this goal, the candidate microalgae were selected from culture collections or isolated from wastewater in this study. The initial screening test using microalgae revealed that various eukaryotic as well as prokaryotic microalgae showed steady growth in municipal wastewater samples. Among them, Tetraselmis sp. NKG400013 and Parachlorella kessleri NKG021201 from culture collections, and Chloroidium saccharophilum NKH13 from the wastewater sample exhibited high biomass productivity. Furthermore, P. kessleri NKG021201 and C. saccharophilum NKH13 showed high lipid productivity (56 +/- 1 mg/L/day for NKG021201, 35 +/- 10 mg/L/day for NKH13). During this cultivation, 99% of nitrogen and 82% of phosphorous compounds were removed from the wastewater sample by the strain NKG021201. Analysis of fatty acid compositions of P. kessleri NKG021201 and C. saccharophilum NKH13 revealed that lipids derived from these microalgae were suitable for the application of bio-diesel fuels, indicating that these microalgae were promising for wastewater treatment and lipid production. (C) 2019, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2020年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 129, 5, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 565, 572
• Analysis of UV irradiation -induced cell settling of an oleaginous diatom, Fistulifera solaris , for efficient biomass recovery
  Arakaki, Atsushi; Matsumoto, Takuya; Shimura, Nobumitsu; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Kisailus, David; Tanaka, Tsuyoshi
  ALGAL RESEARCH
  ELSEVIER
  2020年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 47, 2211-9264, DOI(公開)(r-map)
• Rapid discrimination of fungal species by the colony fingerprinting
  Maeda, Yoshiaki; Sugiyama, Yui; Lim, Tae-Kyu; Harada, Manabu; Yoshino, Tomoko; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
  ELSEVIER ADVANCED TECHNOLOGY
  The contamination of foods and beverages by fungi is a severe health hazard. The rapid identification of fungi species in contaminated goods is important to avoid further contamination. To this end, we developed a fungal discrimination method based on the bioimage informatics approach of colony fingerprinting. This method involves imaging and visualizing microbial colonies (referred to as colony fingerprints) using a lens-less imaging system. Subsequently, the quantitative image features were extracted as discriminative parameters and subjected to analysis using machine learning approaches. Colony fingerprinting has been previously found to be a promising approach to discriminate bacteria. In the present proof-of-concept study, we tested whether this method is also useful for fungal discrimination. As a result, 5 fungi belonging to the Aspergillus, Peniciliwn, Eurottum, Alternaria, and Fusarium genera were successfully discriminated based on the extracted parameters, including the number of hyphae and their branches, and their intensity distributions on the images. The discrimination of 6 closely-related Aspergillus spp. was also demonstrated using additional parameters. The cultivation time required to generate the fungal colonies with a sufficient size for colony fingerprinting was less than 48 h, shorter than those for other discrimination methods, including MALDI-TOF-MS. In addition, colony fingerprinting did not require any cumbersome pre-treatment steps prior to discrimination. Colony fingerprinting is promising for the rapid and easy discrimination of fungi for use in the ensuring the safety of food manufacturing.
  2019年12月15日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 146, 0956-5663, DOI(公開)(r-map)
• Proteomics analysis of lipid droplets indicates involvement of membrane trafficking proteins in lipid droplet breakdown in the oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Nonoyama, Tomomi; Nojima, Daisuke; Maeda, Yoshiaki; Noda, Masayoshi; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Bowler, Chris; Tanaka, Tsuyoshi
  ALGAL RESEARCH
  ELSEVIER
  Microalgae store triacylglycerol (TAG) in a specialized intracellular compartment called the lipid droplet. Its dynamics are believed to be controlled by various lipid droplet-associated proteins, although studies of micro-algal lipid droplet-associated proteins are still limited. In the present study, proteomics analysis was carried out to identify novel lipid droplet-associated protein candidates in the oleaginous marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580. Lipid droplets were extracted from diatom cells, followed by washing with urea solution to decrease contaminants. Subsequently, proteins were identified from the urea-treated lipid droplet fraction. Comparisons between the present study and previous proteomic research on other microalgae revealed that the lipid droplet fraction extracted from diverse microalgae commonly contained membrane trafficking-related proteins such as vesicle coat proteins and heat shock proteins, some of which could potentially be involved in autophagy. Autophagy is known to degrade lipid droplets in other organisms (i.e. mammalian cells and yeasts), and this process is termed lipophagy. Thus, the membrane trafficking-related proteins which were detected from the proteome in this study might play a role in TAG hydrolysis via lipophagy. In order to confirm this hypothesis, we utilized inhibitors of membrane trafficking-related proteins and lipophagy. The addition of the inhibitors to F. solaris during lipid droplet breakdown suppressed TAG hydrolysis, supporting the idea that lipophagy may participate in TAG hydrolysis in F. solaris. The phenomenon was also observed in another model pennate diatom, Phaeodactylum tricornutum, implying that lipophagy-mediated lipid droplet breakdown could be a common feature, at least in pennate diatoms. These findings shed light on novel aspects of lipid metabolism in microalgae, and this can be applied to new approaches for increasing the oil productivity of biofuel production using microalgae in the future.
  2019年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 44, 2211-9264, DOI(公開)(r-map)
• Taming chlorophylls by early eukaryotes underpinned algal interactions and the diversification of the eukaryotes on the oxygenated Earth
  Kashiyama, Yuichiro; Yokoyama, Akiko; Shiratori, Takashi; Hess, Sebastian; Not, Fabrice; Bachy, Charles; Gutierrez-Rodriguez, Andres; Kawahara, Jun; Suzaki, Toshinobu; Nakazawa, Masami; Ishikawa, Takahiro; Maruyama, Moe; Wang, Mengyun; Chen, Man; Gong, Yingchun; Seto, Kensuke; Kagami, Maiko; Hamamoto, Yoko; Honda, Daiske; Umetani, Takahiro; Shihongi, Akira; Kayama, Motoki; Matsuda, Toshiki; Taira, Junya; Yabuki, Akinori; Tsuchiya, Masashi; Hirakawa, Yoshihisa; Kawaguchi, Akane; Nomura, Mami; Nakamura, Atsushi; Namba, Noriaki; Matsumoto, Mitsufumi; Tanaka, Tsuyoshi; Yoshino, Tomoko; Higuchi, Rina; Yamamoto, Akihiro; Maruyama, Tadanobu; Yamaguchi, Aika; Uzuka, Akihiro; Miyagishima, Shinya; Tanifuji, Goro; Kawachi, Masanobu; Kinoshita, Yusuke; Tamiaki, Hitoshi
  ISME JOURNAL
  NATURE PUBLISHING GROUP
  Extant eukaryote ecology is primarily sustained by oxygenic photosynthesis, in which chlorophylls play essential roles. The exceptional photosensitivity of chlorophylls allows them to harvest solar energy for photosynthesis, but on the other hand, they also generate cytotoxic reactive oxygen species. A risk of such phototoxicity of the chlorophyll must become particularly prominent upon dynamic cellular interactions that potentially disrupt the mechanisms that are designed to quench photoexcited chlorophylls in the phototrophic cells. Extensive examination of a wide variety of phagotrophic, parasitic, and phototrophic microeukaryotes demonstrates that a catabolic process that converts chlorophylls into nonphotosensitive 13(2),17(3)-cyclopheophorbide enols (CPEs) is phylogenetically ubiquitous among extant eukaryotes. The accumulation of CPEs is identified in phagotrophic algivores belonging to virtually all major eukaryotic assemblages with the exception of Archaeplastida, in which no algivorous species have been reported. In addition, accumulation of CPEs is revealed to be common among phototrophic microeukaryotes (i.e., microalgae) along with dismantling of their secondary chloroplasts. Thus, we infer that CPE-accumulating chlorophyll catabolism (CACC) primarily evolved among algivorous microeukaryotes to detoxify chlorophylls in an early stage of their evolution. Subsequently, it also underpinned photosynthetic endosymbiosis by securing close interactions with photosynthetic machinery containing abundant chlorophylls, which led to the acquisition of secondary chloroplasts. Our results strongly suggest that CACC, which allowed the consumption of oxygenic primary producers, ultimately permitted the successful radiation of the eukaryotes throughout and after the late Proterozoic global oxygenation.
  2019年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 13, 8, 1751-7362, DOI(公開)(r-map), 1899, 1910
• 特集 バイオインダストリー奨励賞受賞業績 がんゲノム医療に向けた単一細胞解析システムの構築
  吉野知子
  バイオサイエンスとインダストリー
  2019年07月, 単独, 77, 4, 328, 329
• Gel-based cell manipulation method for isolation and genotyping of single-adherent cells
  Negishi, Ryo; Iwata, Reito; Tanaka, Tsuyoshi; Kisailus, David; Maeda, Yoshiaki; Matsunaga, Tadashi; Yoshino, Tomoko
  ANALYST
  ROYAL SOC CHEMISTRY
  Genetic analysis of single-cells is widely recognized as a powerful tool for understanding cellular heterogeneity and obtaining genetic information from rare populations. Recently, many kinds of single-cell isolation systems have been developed to facilitate single-cell genetic analysis. However, these systems mainly target non-adherent cells or cells in a cell suspension. Thus, it is still challenging to isolate single-adherent cells of interest from a culture dish using a microscope. We had previously developed a single-cell isolation technique termed ”gel-based cell manipulation” (GCM). In GCM, single-cells could be visualized by photopolymerizable-hydrogel encapsulation that made it easier to isolate the single-cells. In this study, GCM-based isolation of single-adherent cancer cells from a culture dish was demonstrated. Single-adherent cells were encapsulated in a photopolymerizable hydrogel using a microscope and isolated with high efficiency. Furthermore, whole genome amplification and sequencing for the isolated single-adherent cell could be achieved. We propose that the GCM-based approach demonstrated in this study has the potential for efficient analysis of single-adherent cells at the genetic level.
  2019年02月07日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 144, 3, 0003-2654, DOI(公開)(r-map), 990, 996
• Colony Fingerprint-Based Discrimination of Staphylococcus species with Machine Learning Approaches
  Maeda, Yoshiaki; Sugiyama, Yui; Kogiso, Atsushi; Lim, Tae-Kyu; Harada, Manabu; Yoshino, Tomoko; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  SENSORS
  MDPI
  Detection and discrimination of bacteria are crucial in a wide range of industries, including clinical testing, and food and beverage production. Staphylococcus species cause various diseases, and are frequently detected in clinical specimens and food products. In particular, S. aureus is well known to be the most pathogenic species. Conventional phenotypic and genotypic methods for discrimination of Staphylococcus spp. are time-consuming and labor-intensive. To address this issue, in the present study, we applied a novel discrimination methodology called colony fingerprinting. Colony fingerprinting discriminates bacterial species based on the multivariate analysis of the images of microcolonies (referred to as colony fingerprints) with a size of up to 250 mu m in diameter. The colony fingerprints were obtained via a lens-less imaging system. Profiling of the colony fingerprints of five Staphylococcus spp. (S. aureus, S. epidermidis, S. haemolyticus, S. saprophyticus, and S. simulans) revealed that the central regions of the colony fingerprints showed species-specific patterns. We developed 14 discriminative parameters, some of which highlight the features of the central regions, and analyzed them by several machine learning approaches. As a result, artificial neural network (ANN), support vector machine (SVM), and random forest (RF) showed high performance for discrimination of theses bacteria. Bacterial discrimination by colony fingerprinting can be performed within 11 h, on average, and therefore can cut discrimination time in half compared to conventional methods. Moreover, we also successfully demonstrated discrimination of S. aureus in a mixed culture with Pseudomonas aeruginosa. These results suggest that colony fingerprinting is useful for discrimination of Staphylococcus spp.
  2018年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 18, 9, 1424-8220, DOI(公開)(r-map)
• High-Throughput Manipulation of Circulating Tumor Cells Using a Multiple Single-Cell Encapsulation System with a Digital Micromirror Device
  Negishi, Ryo; Takai, Kaori; Tanaka, Tsuyoshi; Matsunaga, Tadashi; Yoshino, Tomoko
  ANALYTICAL CHEMISTRY
  AMER CHEMICAL SOC
  Circulating tumor cells (CTCs) are potential precursors of metastatic cancer, and genomic information obtained from CTCs have the potential to provide new insights into the biology of cancer metastasis. We previously developed a technique for single-cell manipulation based on the encapsulation of a single cell in a photopolymerized hydrogel that can be used for subsequent genetic analysis. However, this technique has limitations in terms of throughput because light irradiation must be performed on each individual cell from the confocal laser-scanning microscopy. Here, we present a high-throughput cell manipulation technique using a multiple single-cell encapsulation system with a digital micromirror device. This system enables rapid cell imaging within a microcavity array, a microfilter for the recovery of CTCs from blood samples, as well as the simultaneous encapsulation of several CTCs with hydrogels photopolymerized using a multiple light-irradiation system. Furthermore, single-cell labeling using two differently shaped hydrogels was examined to distinguish between NCI-H1975 cells and A549 cells, demonstrating the utility of the system for single-cell gene mutation analysis. In addition to CTCs, our system can be widely applied for analyses of mammalian cells and microorganisms.
  2018年08月21日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 90, 16, 0003-2700, DOI(公開)(r-map), 9734, 9741
• Comprehensive Analysis of Triacylglycerol Lipases in the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 with Transcriptomics under Lipid Degradation
  Tatsuhiro Nomaguchi, Yoshiaki Maeda, Yue Liang, Tomoko Yoshino, Toru Asahi, Tsuyoshi Tanaka
  J. Biosci. Bioeng.
  2018年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 126, DOI(公開)(r-map), 258, 265
• Homoeolog expression bias in allopolyploid oleaginous marine diatom Fistulifera solaris
  Nomaguchi, Tatsuhiro; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Asahi, Toru; Tirichine, Leila; Bowler, Chris; Tanaka, Tsuyoshi
  BMC GENOMICS
  BMC
  Background: Allopolyploidy is a genomic structure wherein two or more sets of chromosomes derived from divergent parental species coexist within an organism. It is a prevalent genomic configuration in plants, as an important source of genetic variation, and also frequently confers environmental adaptability and increased crop productivity. We previously reported the oleaginous marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 to be a promising host for biofuel production and that its genome is allopolyploid, which had never previously been reported in eukaryotic microalgae. However, the study of allopolyploidy in F. solaris was hindered by the difficulty in classifying the homoeologous genes based on their progenitor origins, owing to the shortage of diatom genomic references. Results: In this study, the allopolyploid genome of F. solaris was tentatively classified into two pseudo-parental subgenomes using sequence analysis based on GC content and codon frequency in each homoeologous gene pair. This approach clearly separated the genome into two distinct fractions, subgenome Fso_h and Fso_l, which also showed the potency of codon usage analysis to differentiate the allopolyploid subgenome. Subsequent homoeolog expression bias analysis revealed that, although both subgenomes appear to contribute to global transcription, there were subgenomic preferences in approximately 61% of homoeologous gene pairs, and the majority of these genes showed continuous bias towards a specific subgenome during lipid accumulation. Additional promoter analysis indicated the possibility of promoter motifs involved in biased transcription of homoeologous genes. Among these subgenomic preferences, genes involved in lipid metabolic pathways showed interesting patterns in that biosynthetic and degradative pathways showed opposite subgenomic preferences, suggesting the possibility that the oleaginous characteristics of F. solaris derived from one of its progenitors. Conclusions: We report the detailed genomic structure and expression patterns in the allopolyploid eukaryotic microalga F. solaris. The allele-specific patterns reported may contribute to the oleaginous characteristics of F. solaris and also suggest the robust oleaginous characteristics of one of its progenitors. Our data reveal novel aspects of allopolyploidy in a diatom that is not only important for evolutionary studies but may also be advantageous for biofuel production in microalgae.
  2018年05月04日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 19, 1471-2164, DOI(公開)(r-map)
• Biosynthesis of Thermoresponsive Magnetic Nanoparticles by Magnetosome Display System
  Tomoko Yoshino, Takumi Shimada, Yasuhito Ito, Toru Honda, Yoshiaki Maeda, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Bioconjugate Chem.
  2018年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 29, DOI(公開)(r-map), 1756, 1762
• Marine Microalgae for Production of Biofuels and Chemicals
  Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Mitsufumi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka
  Curr. Opin. Biotechnol.
  2018年04月, 共同, 50, DOI(公開)(r-map), 111, 120
• Production of Eicosapentaenoic Acid by High Cell Density Cultivation of the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  Tsuyoshi Tanaka, Takashi Yabuuchi, Yoshiaki Maeda, Daisuke Nojima, Mitsufumi Matsumoto, Tomoko Yoshino
  Bioresour. Technol.
  2017年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 245, 567, 572
• UV-C Irradiation Accelerates Neutral Lipid Synthesis in the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  Atsushi Arakaki, Takuya Matsumoto, Takuma Tateishi, Mitsufumi Matsumoto, Daisuke Nojima, Yoshino Tomoko, Tsuyoshi Tanaka
  Bioresour. Technol.
  2017年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 245, 1520, 1526
• Structure and properties of oil bodies in diatoms
  Maeda, Yoshiaki; Nojima, Daisuke; Yoshino, Tomoko; Tanaka, Tsuyoshi
  PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES
  ROYAL SOC
  Diatoms accumulate triacylglycerols in spherical organelles called oil bodies when exposed to nutrient deprivation conditions. Oil body biology in diatoms has attracted significant attention due to the complexity of the intracellular organelles and the unique combination of genes generated by the evolutionary history of secondary endosymbiosis. The demand for biofuel production has further increased the interest in and importance of a better understanding of oil body biology in diatoms, because it could provide targets for genetic engineering to further enhance their promising lipid accumulation. This review describes recent progress in studies of the structure and properties of diatom oil bodies. Firstly, the general features of diatom oil bodies are described, in particular, their number, size and morphology, as well as the quantity and quality of lipids they contain. Subsequently, the diatom oil body-associated proteins, which were recently discovered through oil body proteomics, are introduced. Then, the metabolic pathways responsible for the biogenesis and degradation of diatom oil bodies are summarized. During biogenesis and degradation, oil bodies interact with other organelles, including chloroplasts, the endoplasmic reticulum and mitochondria, suggesting their dynamic nature in response to environmental changes. Finally, the functions of oil bodies in diatoms are discussed. This article is part of the themed issue 'The peculiar carbon metabolism in diatoms'.
  2017年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 372, 1728, 0962-8436, DOI(公開)(r-map)
• Production of omega 3 fatty acids in marine cyanobacterium Synechococcus sp strain NKBG 15041c via genetic engineering
  Yoshino, Tomoko; Kakunaka, Natsumi; Liang, Yue; Ito, Yasuhito; Maeda, Yoshiaki; Nomaguchi, Tatsuhiro; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  SPRINGER
  Omega-3 fatty acids (omega 3 FAs) have attracted attention because they have various health benefits for humans. Fish oils are currently major sources of omega 3 FAs, but a sustainable supply of omega 3 FAs based on fish oils is problematic because of the increasing demand. In this study, the production potential of a genetically engineered marine cyanobacterium, Synechococcus sp. strain NKBG 15041c, was examined as an alternative source of omega 3 FAs. A change in fatty acid composition of this cyanobacterium was successfully induced by the expression of a heterologous Delta 6-desaturase, and the transformants synthesized stearidonic acid, which the wild type cannot produce. As a result of optimization of culture conditions, maximal contents of stearidonic acid and total omega 3 FAs reached 12.2 +/- 2.4 and 118.1 +/- 3.5 mg/g, respectively. The maximal omega 3 FA productivity was 4.6 +/- 0.7 mg/(Lai...day). These are the highest values of the contents of stearidonic acid and omega 3 FAs in genetically engineered cyanobacteria reported thus far. Therefore, genetically engineered Synechococcus sp. strain NKBG 15041c may be a promising sustainable source of omega 3 fatty acids.
  2017年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 101, 18, 0175-7598, DOI(公開)(r-map), 6899, 6905
• Production of ω3 Fatty Acids in Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG 15041c via Genetic Engineering
  Tomoko Yoshino, Natsumi Kakunaka, Yue Liang, Yasuhito Ito, Yoshiaki Maeda, Tatsuhiro Nomaguchi, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Appl. Microbiol. Biotechnol.
  2017年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 101, 6899, 6905
• Enhancement of Biomass and Lipid Productivities of Water Surface-Floating Microalgae by Chemical Mutagenesis
  Nojima, Daisuke; Ishizuka, Yuki; Muto, Masaki; Ujiro, Asuka; Kodama, Fumito; Yoshino, Tomoko; Maeda, Yoshiaki; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  MARINE DRUGS
  MDPI AG
  Water surface-floating microalgae have great potential for biofuel applications due to the ease of the harvesting process, which is one of the most problematic steps in conventional microalgal biofuel production. We have collected promising water surface-floating microalgae and characterized their capacity for biomass and lipid production. In this study, we performed chemical mutagenesis of two water surface-floating microalgae to elevate productivity. Floating microalgal strains AVFF007 and FFG039 (tentatively identified as Botryosphaerella sp. and Chlorococcum sp., respectively) were exposed to ethyl methane sulfonate (EMS) or 1-methyl-3-nitro-1-nitrosoguanidine (MNNG), and pale green mutants (PMs) were obtained. The most promising FFG039 PM formed robust biofilms on the surface of the culture medium, similar to those formed by wild type strains, and it exhibited 1.7-fold and 1.9-fold higher biomass and lipid productivities than those of the wild type. This study indicates that the chemical mutation strategy improves the lipid productivity of water surface-floating microalgae without inhibiting biofilm formation and floating ability.
  2017年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 15, 6, 1660-3397, DOI(公開)(r-map)
• 血中循環腫瘍細胞の回収技術と遺伝子解析への応用
  根岸諒、吉野知子
  PHARM STAGE
  2017年05月, 共同, 17, 2, 29, 36
• Rapid imaging and detection of circulating tumor cells using a wide-field fluorescence imaging system
  Yoshino, Tomoko; Takai, Kaori; Negishi, Ryo; Saeki, Tatsuya; Kanbara, Hisashige; Kikuhara, Yoshihito; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  ANALYTICA CHIMICA ACTA
  ELSEVIER SCIENCE BV
  Circulating tumor cells (CTCs) provide potentially accessible in vivo sources of metastatic cancer cells. As such, considerable focus has been placed on analyzing the genetics of single-CTCs. Prior to these analyses, however, CTCs must first be detected within the blood samples of cancer patients. Current methods for detection of CTCs by fluorescence microscopy require the analysis of hundreds of images per blood sample, making this a time-consuming process that creates a bottleneck in CTC analysis. In this study, we therefore developed a wide-field fluorescence imaging system for rapid CTC detection. For these analyses, CTCs were first isolated using the microcavity array (MCA), a micro-sized filter for CTC recovery that separates cells based on differences in cell size and deformability. Notably, the proposed imaging system enabled rapid (similar to 10 s) visualization of all stained cells within the 6 mm x 6 mm MCA field via one-shot imaging. Furthermore, the morphology of the cells in the resulting images accurately reflected that observed by conventional microscopy. In total, isolation and detection of CTCs using the MCA combined with our novel wide-field fluorescence imaging system was achieved within 1 h. Thus, our proposed system will provide rapid CTC detection system. (C) 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.
  2017年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 969, 0003-2670, DOI(公開)(r-map), 1, 7
• Enhanced NADPH production in the pentose phosphate pathway accelerates lipid accumulation in the oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Osada, Kyoko; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Nojima, Daisuke; Bowler, Chris; Tanaka, Tsuyoshi
  ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
  ELSEVIER SCIENCE BV
  As a consequence of the environmental concerns linked with the exploitation of fossil fuel reserves, biofuel production using microalgae has been widely considered because of their higher productive capacity compared with land plants. However, genetic modifications will likely be required to further improve the lipid productivity of native microalgae and to tailor it to the compositions required for different fuel types. In this study, genes encoding two NADPH-producing enzymes in the pentose phosphate pathway (PPP), glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) and phosphogluconate dehydrogenase (PGD), were overexpressed in the oleaginous diatom Fistulifera solaris. The native expression levels of the PGD and G6PD selected in this study were not up-regulated but constant and down-regulated, respectively. By overexpression of the genes encoding these enzymes, NADPH enhancement was confirmed in the transformant cells as compared to wild type cells, as was the acceleration of lipid accumulation. The promotion effect of G6PD (oil content: 37.2 +/- 5.6%) on neutral lipid accumulation was higher than that of PGD (26.1 +/- 3.32%) at early stages (24 h after nutrient depletion, 20.5 +/- 4.3% for wild type), although the final lipid content at 60 h was not significantly different between wild type and transformant cells (47.5 +/- 2.9%, 48.6 +/- 3.8%, 52.2 +/- 2.9% forwild type, PGD, and G6PD, respectively). Overexpression of G6PD elevated lipid productivity by 1.5-fold. We therefore propose that NADPH-producing enzymes in PPP can contribute to lipid synthesis in F. solaris, indicating that their further manipulation may provide breakthroughs for an even more effective biodiesel fuel production with this diatom. (C) 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.
  2017年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 23, 2211-9264, DOI(公開)(r-map), 126, 134
• Colony Fingerprint for Discrimination of Microbial Species based on Lensless Imaging of Microcolonies
  Yoshiaki Maeda, Hironori Dobashi, Yui Sugiyama, Tatsuya Saeki, Tae-kyu Lim, Manabu Harada, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  PLoS One
  2017年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, e0174723
• Outdoor Cultivation of Marine Diatoms for Year-Round Production of Biofuels
  Mitsufumi Matsumoto, Daisuke Nojima, Tomomi Nonoyama, Kiichi Ikeda, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2017年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 15, 94
• Evaluation of cancer cell deformability by microcavity array
  Yoshino, Tomoko; Tanaka, Tsuyoshi; Nakamura, Seita; Negishi, Ryo; Shionoiri, Nozomi; Hosokawa, Masahito; Matsunaga, Tadashi
  ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE
  A cell entrapment device consisting of a microcavity array was used to analyze the deformability of MCF-10 human breast epithelial and MCF-7 human breast cancer cell lines by confocal laser scanning microscopy. Entrapment of up to 8 x 10(3) cells was achieved within 3 min. Protrusions were formed at the bottom surface of the array with a pore size of 3 mu m. Protrusion length increased at higher filtration pressures and could be used to distinguish between MCF-7 and MCF-10 cells. These results indicate that our system is useful for high-throughput deformability analysis of cancer cells, which can provide insight into the mechanisms underlying tumor cell malignancy. (C) 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.
  2017年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 520, 0003-2697, DOI(公開)(r-map), 16, 21
• 単一細胞アレイ化技術を用いた血中循環腫瘍細胞検出法の開発
  根岸諒、吉野知子
  Chemical Sensors
  2017年03月, 共同, 33, 1, 2, 7
• Potential of Water Surface-Floating Microalgae for Biodiesel Production: Floating-Biomass and Lipid Productivities
  Masaki Muto, Daisuke Nojima, Liang Yue, Hideyuki Kanehara, Hideaki Naruse, Asuka Ujiro, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  J. Biosci. Bioeng.
  2017年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 123, 314, 318
• 磁性細菌が生合成する磁気微粒子のインターフェイス設計
  吉野知子
  生物工学会誌
  2016年11月, 共同, 94, 11, 690, 692
• Manipulation of a Single Circulating Tumor Cell Using Visualization of Hydrogel Encapsulation toward Single-Cell Whole-Genome Amplification
  Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka, Seita Nakamura, Ryo Negishi, Masahito Hosokawa, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chem.
  2016年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 88, 7230, 7237
• DNA Recovery from a Single Bacterial Cell Using Charge-reversible Magnetic Nanoparticles
  Yoshiaki Maeda, Takahiro Toyoda, Takeyuki Mogi, Tomoyuki Taguchi, Takeo Tanaami, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Colloids Surf. B: Biointerfaces.
  2016年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 139, 117, 122
• マイクロキャビティァレイ方式に基づいた血中循環腫瘍細胞の回収技術
  吉野知子、根岸諒、松永是
  バイオサイエンスとインダストリー
  2016年02月, 共同, 74, 2, 107, 110
• Peptide-mediated Microalgae Harvesting Method for Efficient Biofuel Production
  Yoshiaki Maeda, Takuma Tateishi, Yuta Niwa, Masaki Muto, Tomoko Yoshino, David Kisailus, Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnol. Biofuels
  2016年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, 10
• Stoichiometrically Controlled Immobilization of Multiple Enzymes on Magnetic Nanoparticles by the Magnetosome Display System for Efficient Cellulose Hydrolysis
  Toru Honda, Tsuyoshi Tanaka, Tomoko Yoshino
  Biomacromolecules
  2015年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 16, 3863, 3868
• Dynamic Oil Body Generation in the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris in Response to Nutrient Limitation as Revealed by Morphological and Lipidomic Analysis
  Yue Liang, Kyoko Osada, Yoshihiko Sunaga, Tomoko Yoshino, Chris Bowler, Tsuyoshi Tanaka
  Algal Res.
  2015年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 359, 367
• 磁性細菌を用いたナノ磁性粒子の創製と医療分野への応用
  吉野知子、本多亨
  まぐね
  2015年06月, 共同, 10, 3, 134, 139
• Development of the Automated Circulating Tumor Cell Recovery System with Microcavity Array
  Ryo Negishi, Masahito Hosokawa, Seita Nakamura, Hisashige Kanbara, Masafumi Kanetomo, Yoshihito Kikuhara, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Biosens. Bioelectron.
  2015年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 67, 438, 442
• Simple and Rapid CD4 Testing Based on Large-field Imaging System Composed of Microcavity Array and Two-dimensional Photosensor
  Tatsuya Saeki, Yuriko Sugamura, Masahito Hosokawa, Tomoko Yoshino, Tae-kyu Lim, Manabu Harada, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanak
  Biosens. Bioelectron.
  2015年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 67, 350, 355
• タンパク質ー磁性粒子複合体の in vivo 合成と創薬への展開
  吉野知子、本多亨
  BIO　INDUSTRY
  2015年04月, 共同, 32, 4, 65, 70
• Novel Designs of Single-chain MHC I/peptide Complex for the Magnetosome Display System
  Toru Honda, Yoshiaki Maeda, Takayuki Yasuda, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Protein Eng. Des. Sel.
  2015年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 28, 53, 58
• Functional Expression of Full-Length TrkA in the Prokaryotic Host Magnetospirillum magneticum AMB-1 by Using a Magnetosome Display System
  Toru Honda, Takayuki Yasuda, Tsuyoshi Tanaka, Koji Hagiwara, Tohru Arai, Tomoko Yoshino
  Appl. Environ. Microbiol.
  2015年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 81, 1472, 1476
• Alkane Production by the Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. NKBG15041c Possessing the α-olefin Biosynthesis Pathway
  Tomoko Yoshino, Yue Liang, Daichi Arai, Yoshiaki Maeda, Toru Honda, Masaki Muto, Natsumi Kakunaka, Tsuyoshi Tanaka
  Appl. Microbiol. Biotechnol.
  2015年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 99, 1521, 1529
• Oil Accumulation by the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris as Revealed by the Genome and Transcriptome
  Tsuyoshi Tanaka, Yoshiaki Maeda, Alaguraj Veluchamy, Michihiro Tanaka, Heni Abida, Eric Maréchal, Chris Bowler, Masaki Muto, Yoshihiko Sunaga, Masayoshi Tanaka, Tomoko Yoshino, Takeaki Taniguchi, Yorikane Fukuda, Michiko Nemoto, Mitsufumi Matsumoto, Pui Shan Wong, Sachiyo Aburatani, Wataru Fujibuchi
  Plant Cell
  2015年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 27, 162, 176
• Enhancement of Glycerol Metabolism in the Oleaginous Marine Diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 to Improve Triacylglycerol Productivity
  Masaki Muto, Masayoshi Tanaka, Yue Liang, Tomoko Yoshino, Mitsufumi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnol. Biofuels
  2015年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 8
• Chloroplast-Targeting Protein Expression in the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 toward Metabolic Engineering
  Yoshihiko Sunaga, Yoshiaki Maeda, Takashi Yabuuchi, Masaki Muto, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  J. Biosci. Bioeng.
  2015年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 119, 28, 34
• Inducible Expression System for the Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG 15041c
  Yoshiaki Maeda, Yasuhito Ito, Toru Honda, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Int. J. Hydrogen Energy
  2014年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 39, 19382, 19388
• 微生物を用いたタンパク質-ナノ磁性粒子複合体の生合成
  吉野知子、前田義昌
  オレオサイエンス
  2014年10月, 共同, 14, 10, 433, 438
• Morphological and Molecular Phylogenetic Analysis of the High-triglyceride Producing Marine Diatom, Fistulifera solarissp. nov. (Bacillariophyceae)
  Mitsufumi Matsumoto, Shigeki Mayama, Michiko Nemoto, Yorikane Fukuda, Masaki Muto, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Phycol. Res.
  2014年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 62, 257, 268
• Profiling of Fatty Acid Methyl Esters from the Oleaginous Diatom Fistulifera sp. Strain JPCC DA0580 under Nutrition-Sufficient and-Deficient Conditions
  Yue Liang, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Mitsufumi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka
  J. Appl. Phycol.
  2014年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 26, 2295, 2302
• Tracking Difference in Gene Expression in a Time-course Experiment Using Gene Set Enrichment Analysis
  Pui Shan Wong, Michihiro Tanaka, Yoshihiko Sunaga, Masayoshi Tanaka, Takeaki Taniguchi, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka, Wataru Fujibuchi, Sachiyo Aburatani
  PLoS One
  2014年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, e107629
• In VivoLive Cell Imaging for the Quantitative Monitoring of Lipids by Using Raman Microspectroscopy
  Masahito Hosokawa, Masahiro Ando, Shoichiro Mukai, Kyoko Osada, Tomoko Yoshino, Hiro-o Hamaguchi, Tsuyoshi Tanaka
  Anal. Chem.
  2014年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 86, 8224, 8230
• Identification of a Frustule-Associated Protein of the Marine Pennate Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  Michiko Nemoto, Yoshiaki Maeda, Masaki Muto, Masayoshi Tanaka, Tomoko Yoshino Shigeki Mayama, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Genomics
  2014年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 6, 39, 44
• Draft Genome Sequence of Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG042902, the Strain Harboring a Homogeneous Plasmid Available for Metabolic Engineering
  Toru Honda, Yue Liang, Daichi Arai, Yasuhito Ito, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Genome Announc.
  2014年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 2, e00704, 14
• Oleosome-Associated Protein of the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris Contains an Endoplasmic Reticulum-Targeting Signal Sequence
  Yoshiaki Maeda, Yoshihiko Sunaga, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2014年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 3892, 3903
• Profiling of Polar Lipids in Marine Oleaginous Diatom Fistuliferasolaris JPCC DA0580: Prediction of the Potential Mechanism for Eicosapentaenoic Acid-incorporation into Triacylglycerol
  Yue Liang, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Mitsufumi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2014年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 3218, 3230
• Seasonal Variation of Biomass and Oil Production of the Oleaginous Diatom Fistulifera sp. in Outdoor Vertical Bubble Column and Raceway-type Bioreactors
  Reiko Sato, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino and Tsuyoshi Tanaka, Mitsufumi Matsumoto
  J. Biosci. Bioeng.
  2014年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 117, 720, 724
• Functional Expression of an scFv on Bacterial Magnetic particles by in Vitro Docking
  Yasuhiro Sugamata, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Biochem. Biophy. Res. Commun.
  2014年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 445, 1, 5
• Monitoring of Cellular Behaviors by Microcavity Array-Based Single-Cell Patterning
  Kyoko Osada, Masahito Hosokawa, Tomoko Yoshino and Tsuyoshi Tanaka
  Analyst
  2014年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 139, 425, 430
• Biosynthesis of Polyunsaturated Fatty Acids in the Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. Strain JPCC DA0580
  Yue Liang, Yoshiaki Maeda, Yoshihiko Sunaga, Masaki Muto, Mitsufumi Matsumoto, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2013年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 11, 12, 5008, 5023
• Draft Genome Sequence of Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG15041c
  Tomoko Yoshino, Toru Honda, Masayoshi Tanaka, Tsuyoshi Tanaka
  Genome Announc.
  2013年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 1, e00954, 13
• Proteomics analysis of oil body-associated proteins in the oleaginous diatom
  Daisuke Nojima, Tomoko Yoshino, Yoshiaki Maeda, Masayoshi Tanaka, Michiko Nemoto, Tsuyoshi Tanaka
  J. Proteome Res.
  2013年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 5293, 5301
• Identification and Functional Analysis of Delta-9 Desaturase, a Key Enzyme in PUFA Synthesis, Isolated from the Oleaginous Diatom Fistulifera
  Masaki Muto, Chihiro Kubota, Masayoshi Tanaka, Akira Satoh, Mitsufumi Matsumoto, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  PLoS ONE
  2013年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 8, e73507
• Functional expression of thyroid-stimulating hormone receptor on nano-sized bacterial magnetic particles in Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Yasuhiro Sugamata, Ryo Uchiyama, Toru Honda, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Int J Mol Sci.
  2013年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 14, 14426, 14438
• Enhanced heterologous protein display on bacterial magnetic particles using a Lon protease deletion mutant in Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Yuka Kanetsuki, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  J. Biosci. Bioeng.
  2013年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 116, 65, 70
• 磁性細菌を用いた分子設計による機能性ナノ磁性粒子の創製
  吉野 知子、本多 亨
  バイオサイエンスとインダストリー
  2013年06月, 共同, 71, 6, 508, 511
• Size-Based Isolation of Circulating Tumor Cells in Lung Cancer Patients Using a Microcavity Array System
  Masahito Hosokawa, Hirotsugu Kenmotsu, Yasuhiro Koh, Tomoko Yoshino, Takayuki Yoshikawa, Tateaki Naito, Toshiaki Takahashi, Haruyasu Murakami, Yukiko Nakamura, Asuka Tsuya, Takehito Shukuya, Akira Ono, Hiroaki Akamatsu, Reiko Watanabe, Sachiyo Ono, Keita Mori, Hisashige Kanbara, Ken Yamaguchi, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Nobuyuki Yamamoto
  PLoS ONE
  2013年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 8, e67466
• Microcavity Array System for Size-Based Enrichment of Circulating Tumor Cells from the Blood of Patients with Small-Cell Lung Cancer
  Masahito Hosokawa, Takayuki Yoshikawa, Ryo Negishi, Tomoko Yoshino, Yasuhiro Koh, Hirotsugu Kenmotsu, Tateaki Naito, Toshiaki Takahashi, Nobuyuki Yamamoto, Yoshihito Kikuhara, Hisashige Kanbara, Tsuyoshi Tanaka, Ken Yamaguchi, and Tadashi Matsunaga
  Anal. Chem.
  2013年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 85, 5692, 5698
• A process design and productivity evaluation for oil productionby indoor mass cultivation of a marine diatom, Fistulifera sp. JPCC DA0580
  Akira Satoh, Kyonosuke Ichii, Mitsufumi Matsumoto, Chihiro Kubota, Michiko Nemoto, Masayoshi Tanaka, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Bioresource Technology
  2013年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 137, 132, 138
• 海洋バイオマスからのバイオディーゼル生産
  田中剛、吉野知子、武藤正記
  化学と生物
  2013年03月, 共同, 51, 3, 183, 188
• Establishment of a genetic transformation system for the marine pennate diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 - a high triglyceride producer
  Masaki Muto, Yorikane Fukuda, Michiko Nemoto, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Marine Biotech.
  2013年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 15, 48, 55
• Monitoring of Benzene-induced Hematotoxicity in Mice by Serial Leukocyte Counting Using a Microcavity Array
  Masahito Hosokawa, Marie Asami, Tomoko Yoshino, Noriyuki Tsujimura, Masayuki Takahashi, Satoshi Nakasono, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Biosens. Bioelectron.
  2013年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 40, 110, 114
• 2030年への挑戦　“藻類を燃料に”
  田中 剛、根本　理子、吉野 知子
  太陽エネルギー
  2013年01月, 共同, 39, 1, 27, 35
• Assessment of benzene-induced hematotoxicity using a human-like hematopoietic lineage in NOD/Shi-scid/IL-2Rγnull mice
  Masayuki Takahashi, Noriyuki Tsujimura, Tomoko Yoshino, Masahito Hosokawa, Kensuke Otsuka, Tadashi Matsunaga, Satoshi Nakasono
  Plos One
  2012年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 7, e50448
• Effective expression of human proteins on bacterial magnetic particles in an anchor gene deletion mutant of Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Yuka Kanetsuki, Masayoshi Tanaka, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Biochem. Biophys. Res. Commun.
  2012年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 426, 7, 11
• Leukocyte Counting from a Small Amount of Whole Blood Using a Size-Controlled Microcavity Array
  Masahito Hosokawa, Marie Asami, Seita Nakamura, Tomoko Yoshino, Noriyuki Tsujimura, Masayuki Takahashi, Satoshi Nakasono, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Biotechnol. Bioeng.
  2012年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 109, 2017, 2024
• Comprehensive Evaluation of Leukocyte Lineage Derived from Human Hematopoietic Cells in Humanized Mice
  Masayuki Takahashi, Noriyuki Tsujimura, Kensuke Otsuka, Tomoko Yoshino, Tetsuhsi Mori, Tadashi Matsunaga, Satoshi Nakasono
  J. Biosci. Bioeng.
  2012年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 113, 4, 529, 535
• High-throughput pyrosequencing of the chloroplast genome of a highly neutral-lipid-producing marine pennate diatom, Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  Tsuyoshi Tanaka, Yorikane Fukuda, Tomoko Yoshino, Yoshiaki Maeda, Masaki Muto, Mitsufumi Matsumoto, Shigeki Mayama and Tadashi Matsunaga
  Photosynth. Res.
  2011年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 109, 1-3, 223, 229
• Microfluidic Device with Chemical Gradient for Single-Cell Cytotoxicity Assays
  Masahito Hosokawa, Takuma Hayashi, Tetsushi Mori, Tomoko Yoshino, Satoshi Nakasono, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chem.
  2011年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 83, 10, 3648, 3654
• Bioengineering of Bacterial Magnetic Particles and their Applications in Biotechnology
  Tomoko Yoshino, Yoshiaki Maeda, Tadashi Matsunaga
  Recent Patents on Biotechnology
  2010年11月, 共同, 4, 2, 214, 225
• In vivo biotinylation of bacterial magnetic particles by a truncated form of Escherichia coli biotin ligase and biotin acceptor peptide
  Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga
  Appl. Environ. Microbiol.
  2010年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 76, 17, 5785, 5790
• Size-selective microcavity array for rapid and efficient detection of circulating tumor cells
  Masahito Hosokawa, Taishi Hayata, Yorikane Fukuda, Atsushi Arakaki, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chem.
  2010年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 82, 15, 6629, 6635
• Surface modification of magnetic nanoparticles using asparagines-serine polypeptide designed to control interactions with cell surfaces
  Masayuki Takahashi, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga
  Biomaterials
  2010年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 31, 18, 4952, 4957
• 磁性ビーズを利用した生体分子の分析技術
  田中剛、吉野知子、松永是
  ぶんせき
  2010年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 3, 133, 138
• Inducible expression of transmembrane proteins on bacterial magnetic particles in Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Tomoko Yoshino, Akiko Shimojo, Yoshiaki Maeda, Tadashi Matsunaga
  Appl. Environ. Microbiol.
  2010年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 76, 4, 1152, 1157
• Protein display onto nano-sized bacterial magnetic particles for receptor analysis
  Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga
  Yakugaku Zasshi
  2009年11月, 共同, 129, 11, 1319, 1325
• Novel nanocomposites consisting of in vivo-biotinylated bacterial magnetic particles and quantum dots for magnetic separation and fluorescent labeling of cancer cells
  Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, and Tadashi Matsunaga
  J. Mater. Chem.
  2009年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 19, 6361, 6366
• A Stable human Progesterone Receptor expressing HeLa reporter cell line as a tool in chemical evaluation at the different cell-cycle phases
  19) Tetsushi Mori, Mai Murata, Tomoko Yoshino, Satoshi Nakasono, Fumiyo Saito, Haruko Takeyama, and Tadashi Matsunaga
  Toxicol. Lett.
  2009年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 186, 2, 123, 129
• Magnetic separation of human podocalyxin-like protein 1 (hPCLP1)-positive cells from peripheral blood and umbilical cord blood using anti-hPCLP1 monoclonal antibody and protein A expressed on bacterial magnetic particles
  Motoki Kuhara, Tomoko Yoshino, Miho Shiokawa, Tomoya Okabe, Shinji Mizoguchi, Akihiko Yabuhara, Haruko Takeyama, and Tadashi Matsunaga
  Cell Struct. Funct.
  2009年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 34, 23, 30
• Nano-sized bacterial magnetic particles displaying pyruvate phosphate dikinase for pyrosequencing
  Tomoko Yoshino, Taisei Nishimura, Tetsushi Mori, Shigeya Suzuki, Hideki Kambara, Haruko Takeyama and Tadashi Matsunaga
  Biotechnol. Bioeng.
  2009年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 103, 130, 137
• Magnetic separation of melanoma-specific cytotoxic T lymphocytes from a vaccinated melanoma patient's blood using MHC/peptide complex-conjugated bacterial magnetic particles
  Masayuki Takahashi, Yasuto Akiyama, Junpei Ikezumi, Takeshi Nagata, Tomoko Yoshino, Akira Iizuka, Ken Yamaguchi, and Tadashi Matsunaga
  Bioconjug. Chem.
  2009年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 20, 304, 309
• Direct magnetic separation of immune cells from whole blood using bacterial magnetic particles displaying protein G
  Masayuki Takahashi, Tomoko Yoshino, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Biotechnol. Prog.
  2009年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 25, 219, 226
• Magnetic cell separation using nano-sized bacterial magnetic particles with reconstructed magnetosome membrane
  Tomoko Yoshino, Hisashi Hirabe, Masayuki Takahashi, Motoki Kuhara, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Biotechnol. Bioeng.
  2008年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 101, 470, 477
• Novel method for evaluation of chemicals based on ligand-dependent recruitment of GFP labeled coactivator to estrogen receptor displayed on bacterial magnetic particles
  Tomoko Yoshino, Chihiro Kaji, Makoto Nakai, Fumiyo Saito, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chim. Acta.
  2008年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 626, 71, 77
• Noncovalent immobilization of streptavidin on in vitro and in vivo biotinylated bacterial magnetic particles
  Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Masaaki Takahashi, Harumi Ginya, Junko Asahina, Hideji Tajima, Tadashi Matsunaga
  Appl. Environ. Microbiol.
  2008年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 74, 16, 5139, 5145
• バイオナノ磁気ビーズの医療応用
  松永是、吉野知子
  表面技術
  2008年06月, 共同, 59, 6, 377, 381
• Site-selective immobilization of streptavidin on enzymatically biotinylated bacterial magnetic particles
  Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Haruko Takeyama, Masaaki Takahashi, Harumi Ginya, Junko Asahina, Hideji Tajima, Tadashi Matsunaga
  Mater. Res. Soc. Symp. Proc.
  2008年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 1094E, Warrendale, PA, 1094, DD07-18
• One-step separation of CD20+ cells from whole blood using bacterial magnetic particles displaying protein G
  Masayuki Takahashi, Tomoko Yoshino, Haruko Takeyama, and Tadashi Matsunaga
  Mater. Res. Soc. Symp. Proc.
  2008年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 1094E, Warrendale, PA, 1094, DD04-19
• Bioengineering of bacterial magnetic particles and its application to estrogen receptor-ligand binding assay
  Tomoko Yoshino, Chihiro Kaji and Tadashi Matsunaga
  Mater. Res. Soc. Symp. Proc.
  2008年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 1094E, Warrendale, PA, 1094, DD04-03
• 微生物を用いたバイオナノ磁性粒子の作製技術
  吉野知子、松永是
  化学と教育
  2008年04月, 共同, 56, 192, 195
• Reporter gene assay against lipophilic chemicals based on site-specific genomic recombination of a nuclear receptor gene, its response element, and a luciferase reporter gene within a stable hela cell line
  Tetsushi Mori, Fumiyo Saito, Tomoko Yoshino, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Biotechnol. Bioeng.
  2008年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 99, 1453, 1461
• Fully automated immunoassay for detection of prostate-specific antigen using nano-magnetic beads and micro-polystyrene bead composites, 'Beads on Beads'
  Matsunaga, T., Maeda, Y., Yoshino, T., Takeyama, H., Takahashi, M., Ginya, H., Aasahina, J., Tajima, H.
  Anal. Chim. Acta
  2007年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 597, 2, 331, 339
• Magnetic Separation of CD14+ Cells Using Antibody Binding with Protein A Expressed on Bacterial Magnetic Particles for Generation of Dendritic Cells
  Tadashi Matsunaga, Masayuki Takahashi, Tomoko Yoshino, Motoki Kuhara, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama
  Biochem. Biophys. Res. Commun.
  2006年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 350, 1019, 1025
• Automated DNA Extraction from Genetically Modified Maize Using Aminosilane-modified Bacterial Magnetic Particles
  Hiroyuki Ota, Tae-Kyu Lim, Tsuyoshi Tanaka, Tomoko Yoshino, Manabu Harada, Tadashi Matsunaga
  J. Biotechnol.
  2006年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 125, 361, 368
• Efficient and Stable Display of Functional Proteins on Bacterial Magnetic Particles Using Mms13 as a Novel Anchor Molecule
  Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga
  Appl. Environ. Microbiol.
  2006年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 72, 465, 471
• Development of Efficient Expression System for Protein Display on Bacterial Magnetic Particles
  Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga
  Biochem. Biophys. Res. Commun.
  2005年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 338, 1678, 1681
• Magnetic nanotube fabrication by using magnetic bacteria
  5) Ipsita A. Banerjee, Lingtao Yu, Mutsuhiro Shima, Ipsita A. Banerjee, Lingtao Yu, Mutsuhiro Shima, Tomoko Yoshino, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga, Hiroshi Matsui
  Advanced Materials
  2005年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 17, 9, 1128, 1131
• Development of a novel method for screening of estrogenic compounds using nano-sized bacterial magnetic particles displaying estrogen receptor
  Tomoko Yoshino, Fukuichi Kato, Haruko Takeyama, Makoto Nakai, Yoshikuni Yakabe, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chim. Acta
  2005年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 532, 101, 111
• Assembly of G protein-coupled receptors onto nano-sized bacterial magnetic particles using Mms16 as an anchor molecule
  Tomoko Yoshino, Masayoshi Takahashi, Haruko Takeyama, Yoshiko Okamura, Fukuichi Kato, Tadashi Matsunaga
  Appl. Environ. Microbiol.
  2004年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 70, 2880, 2885
• Single nucleotide polymorphism genotyping of aldehyde dehydrogenase 2 gene using a bacterial magnetic particle
  Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama and Tadashi Matsunaga
  Biosens. Bioelectron.
  2003年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 18, 661, 666
• Gene expression analysis from nuclear poly(A)+ RNA
  Keiji Matsuda, Shigeru Tomozawa, Shinobu Fukusho, Tomoko Yoshino, Taku Murakami, and Masato Mitsuhashi
  Biotechniques
  2002年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 32, 1014, 1016, 1018, 1020
• Single nucleotide polymorphism analysis using a bacterial magnetic particle microarray
  Tomoko Yoshino, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Electrochemistry
  2001年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 69, 1008, 1012

著書

• 臨床実装が進む次世代がんバイオマーカー
  吉野 知子、中澤胡桃
  腫瘍内不均一性解明に向けた血中循環腫瘍細胞のシングルセル核酸解析技術の開発
  羊土社
  2022年06月03日
• バイオインダストリー　39巻 3号
  吉野知子、鈴木智加良
  単一細胞アレイ化技術と希少細胞解析への応用
  シーエムシー出版
  2022年03月12日, 978-4-7581-0383-1
• 先端の分析法
  吉野知子、根岸諒
  血中循環腫瘍細胞の分析技術
  エヌ・ティ・エス
  2022年01月29日
• DOJIN BIOSCIENCE SERIES 34 シングルセル解析で何がわかるか
  吉野知子、根岸諒
  第2章 希少細胞を標的としたシングルセル解析技術
  化学同人
  2020年06月19日
• 実験医学 Vol.37 No.20 (増刊) シングルセルゲノミクス 組織の機能、病態が1細胞レベルで見えてきた！
  吉野知子、根岸諒
  第2章 14 リキッドバイオプシーの実現に向けた血中循環腫瘍細胞のシングルセル解析
  羊土社出版
  2019年12月10日, 978-4-7581-0383-1
• バイオイノベーションに向けて -バイオテクノロジーの新技術からの新しい視点-
  第4章 マイクロデバイスの視点から
  シーエムシー出版
  2019年03月
• 生命科学概論 第2版
  第8章 食品・医薬品と生物
  朝倉書店
  2019年03月
• Biological Magnetic Materials and Applications
  Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Springer
  2018年
• シングルセル解析プロトコール
  根岸諒、吉野知子
  羊土社
  2017年10月
• リキッドバイオプシー ―体液中腫瘍マーカーの検出・解析技術―
  根岸諒、吉野知子
  シーエムシー出版
  2017年
• 微細藻類によるエネルギー生産と事業展望
  田中　剛、吉野知子
  シーエムシー
  2012年07月
• 遺伝子工学
  吉野知子
  化学同人
  2012年03月
• Biomedical Engineering / Book 4
  Tomoko Yoshino, Yuka Kanetsuki and Tadashi Matsunaga
  INTECH
  2011年09月
• シングルセル解析の最前線
  竹山春子、吉野知子、岡村好子、神原秀記
  シーエムシー
  2010年03月
• バイオプロセスハンドブック
  松永　是、吉野知子
  エヌ・ティー・エス
  2007年03月
• ナノマテリアル技術大系　第2巻　ナノ金属編
  松永　是、吉野知子
  フジ・テクノシステム
  2006年01月

研究発表、招待講演等

• 希少細胞を対象とした単一細胞遺伝子解析のプラットフォーム開発と応用展開
  第61回日本生物物理学会年会
  2023年11月, 口頭発表（招待・特別）
• 希少細胞のトランスクリプトミクスを可能とする細胞操作技術
  JASIS 2023　
  2023年09月, 口頭発表（招待・特別）
• 血中循環腫瘍細胞のシングルセルオミクス解析技術の開発と創薬研究への可能性
  第166回日本獣医学会
  2023年09月, 口頭発表（招待・特別）
• 希少細胞を対象とした単一細胞解析技術の開発と応用
  第 75 回日本生物工学会大会
  2023年09月, 口頭発表（招待・特別）
• 固形がん患者由来CTCのプロファイリングに向けたアプローチ
  第63回日本肺癌学会
  2022年12月, 口頭発表（招待・特別）
• ダイバーシティを生かした生物工学のシナリオ作り
  第 74 回日本生物工学会大会
  2022年10月, 口頭発表（招待・特別）
• 膜脂質組成改変によるマグネトソーム上の膜受容体の活性制御
  森本啓太, 巴瞭斗, 脇駿也, 田中剛, 吉野知子
  2022年10月, 口頭発表（一般）
• 血小板が結合した血中循環腫瘍細胞の3Dイメージング解析
  第74回日本生物工学会大会
  2022年10月, 口頭発表（一般）
• 血中循環腫瘍細胞のトランスクリプトーム解析に基づいた新規マーカー探索
  第42 回日本分子腫瘍マーカー研究会
  2022年09月, 口頭発表（招待・特別）
• イヌ尿路上皮がん由来 CTC 検出に向けたプロトコル確立
  第16回バイオ関連化学シンポジウム
  2022年09月, ポスター発表
• シクロオキシゲナーゼを利用した海洋微細藻類におけるプロスタグランジンの生合成
  第16回バイオ関連化学シンポジウム
  2022年09月, ポスター発表
• 単一細胞トランスクリプトーム解析による胃がんCTCの薬剤耐性因子の探索
  第16回バイオ関連化学シンポジウム
  2022年09月, ポスター発表
• エピソーマルベクターの開発に向けたオイル高生産珪藻Fisturifela solarisにおけるセントロメア配列の自律複製機能の解析
  第22回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2022年05月, ポスター発表
• クロロフィル異化酵素の発現による海洋珪藻Fistulifera solarisの捕食耐性株の創製
  第22回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2022年05月, ポスター発表
• 海洋珪藻Fistulifera solarisにおけるシクロオキシゲナーゼを用いたプロスタグランジン生産
  菊地美穂, 松本奈々, 前田義昌, 吉野知子, 田中剛
  2022年05月, ポスター発表
• Establishment of an efficient genetic transformation system for the marine diatom Fistulifera solaris
  第22回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2022年05月, 口頭発表（一般）
• ラインイメージングセンサを用いたCFP法に基づく食品混入微生物の高精度菌種判別モデルの開発
  電気化学会第89回大会
  2022年03月, 口頭発表（一般）
• シグナリングプローブ方式DNAマイクロアレイのハイブリダイゼーション挙動解析
  電気化学会第89回大会
  2022年03月, 口頭発表（一般）
• Technologies for Single-cell Transcriptomics of Circulating Tumor Cells
  The SPIRITS International Symposium -Materials and Methodology toward Unraveling Biological Systems
  2022年03月, 口頭発表（招待・特別）
• MCA/GCM法を用いた尿路上皮がん患者由来CTC及びCTCクラスターの遺伝子解析
  第6回Liquid biopsy研究会
  2022年01月, ポスター発表
• 膵臓がん患者由来 CTC の単一細胞トランスクリプトーム解析
  第6回Liquid biopsy研究会
  2022年01月, ポスター発表
• 固形がん患者由来CTCを対象としたシングルセルオミクス解
  第6回Liquid Biopsy研究会
  2022年01月, 口頭発表（招待・特別）
• 磁性細菌におけるマグネトソーム膜改変とマグネタイト形成能への影響評価
  第73日本生物工学大会
  2021年10月, 口頭発表（一般）
• エピソーマルベクターを用いたオイル高生産珪藻Fistulifera solarisの形質転換法の確立
  第73日本生物工学大会
  2021年10月, 口頭発表（一般）
• シグナリングプローブ方式DNAマイクロアレイによる簡易迅速な微生物検出法の開発
  第73日本生物工学大会
  2021年10月, 口頭発表（一般）
• MCA/GCM法により回収した胃がん患者由来CTCの単一細胞トランスクリプトーム解析
  第73日本生物工学大会
  2021年10月, 口頭発表（一般）
• ラインイメージングセンサを用いたコロニーフィンガープリンティングによる近縁微生物の判別
  2021年電気化学会秋季大会
  2021年09月, 口頭発表（一般）
• 熱力学的解析によるDNAマイクロアレイのシグナリングプローブ設計
  2021年電気化学会秋季大会
  2021年09月, 口頭発表（一般）
• がん細胞分泌タンパク質の単一細胞解析に向けたシリカビーズ充填型細胞捕捉デバイスの開発
  第15回バイオ関連化学シンポジウム
  2021年09月, ポスター発表
• ラインセンサーイメージングを用いたコロニーフィンガープリント法による食品混入微生物の迅速判別
  第15回バイオ関連化学シンポジウム
  2021年09月, ポスター発表
• Microcavity arrayを用いた細胞アレイ化におけるメカニカルストレスの影響評価
  第15回バイオ関連化学シンポジウム
  2021年09月, ポスター発表
• Bioengineering of magnetic nanoparticles produced by magnetotactic bacteria
  women in synthetic biology symposium
  2021年09月, 口頭発表（招待・特別）
• Microfluidic platform for single cell genetic analysis of rare cells
  INDO-JAPAN SAKURA SCIENCE CAFE
  2021年08月, 口頭発表（招待・特別）
• 海洋珪藻Fistulifera solarisにおける分岐鎖アミノ酸合成酵素の細胞内局在解析
  第21回マリンバイオロジー学会大会
  2021年05月, ポスター発表
• 海洋珪藻Fistulifera solarisのゲノム編集における内在性マーカー遺伝子の有効性評価
  第21回マリンバイオロジー学会大会
  2021年05月, ポスター発表
• オイル分解時の海洋珪藻Fistulifera solarisにおけるミトコンドリアの役割
  第21回マリンバイオロジー学会大会
  2021年05月, ポスター発表
• ホスファチジルコリン合成磁性細菌のマグネトソーム形成能の解析
  第21回マリンバイオロジー学会大会
  2021年05月, ポスター発表
• 森屋 星一郎, 野々山 智美, 野島 大祐, 野田 将礼, 前田 義昌, 吉野 知子, 田中 剛,
  第21回マリンバイオロジー学会大会
  2021年05月, 口頭発表（一般）
• Identification of novel oil body-associated proteins in the marine diatom Fistulifera solaris based on the proteomic analysis of the oil bodies with different sizes
  第21回マリンバイオロジー学会大会
  2021年05月, ポスター発表
• 磁性細菌を用いた機能性ナノ磁気微粒子の創製
  令和３年電気学会全国大会
  2021年03月, 口頭発表（招待・特別）
• 希少細胞のシングルセル遺伝子解析技術の開発と応用展開 ～血中循環腫瘍細胞から環境微生物の解析まで～
  2020年度第4回ExCELLSセミナー
  2020年12月, 口頭発表（招待・特別）
• Characterization of circulating tumor cells in gastric cancer patients based on single-cell transcriptome analysis
  The 29th Hot Spring Harbor International Symposium on Coexistence of Biology and Nanodevices
  2020年02月, 口頭発表（招待・特別）
• 単一細胞核酸解析に基づく血中循環腫瘍細胞のキャラクタリゼーション
  第413回CBI学会研究講演会
  2020年01月, 口頭発表（招待・特別）
• 腫瘍内不均一性の解析に向けたCTC のシングルセル核酸解析技術
  第4回Liquid Biopsy研究会
  2020年01月, 口頭発表（招待・特別）
• 液体生検を実現する単一がん細胞のプロファイリング技術
  第80回応用物理学会秋季学術講演会
  2019年09月, 口頭発表（招待・特別）
• 希少細胞を対象としたシングルセル遺伝子解析技術の確立と応用展開
  JPrOS JES 合同大会 シンポジウム
  2019年07月26日, 口頭発表（招待・特別）
• Structure and functions of the allopolyploid genome of the oleaginous diatom Fistulifera solaris
  5th Molecular Life of Diatoms
  2019年07月, 口頭発表（一般）
• Lipid droplet degradation mechanism in oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 suggested by lipid droplet proteome
  5th Molecular Life of Diatoms
  2019年07月, ポスター発表
• Improvement of lipid productivity in oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 by knocking-down of triacylglycerol lipase
  5th Molecular Life of Diatoms
  2019年07月, ポスター発表
• Suppression of grazers of the marine diatom Fistulifera solaris by enhancement of chlorophyllase activity
  5th Molecular Life of Diatoms
  2019年07月, ポスター発表
• Integrated system for manipulation and genetic analysis of single circulating tumor cells
  12th International workshop on approaches to single cell analysis
  2019年03月, 口頭発表（一般）
• DEVELOPMENT OF SINGLE-CELL MANIPULATION TECHNIQUE FOR GENE MUTATION ANALYSIS OF RARE CELL
  12th International workshop on approaches to single cell analysis
  2019年03月, ポスター発表
• Microfluidic platform for single cell analysis of circulating tumor cells
  The Second International Workshop by the 174th Committee on Coexistence of Biology and Nanodevices
  2019年01月, 口頭発表（招待・特別）
• MCA/GCM法を用いたCTCの単一細胞トランスクリプトーム解析
  第3回Liquid Biopsy研究会
  2019年01月, 口頭発表（招待・特別）
• Single-Cell Transcriptome Analysis For Circulating Tumor Cells based on Microcavity Array
  Circulating Biomarkers, Exosomes & Liquid Biopsy Europe 2019
  2018年10月, 口頭発表（招待・特別）
• 光応答性ゲルを用いた単一がん細胞の分離と核酸解析への応用
  第70回 日本生物工学会　大会シンポジウム
  2018年09月07日, 口頭発表（招待・特別）
• コロニーフィンガープリントの機械学習に基づく真菌 Aspergillus 属の菌種判別法の開発
  2018年電気化学秋季大会
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• Modification of phospholipids composition of magnetosomes by employing phosphatidylcholine synthase in magnetotactic bacteria
  The 6th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
  2018年09月, ポスター発表
• Functional Expression of Transmembrane Receptors on Magnetic Nanoparticles Through a Magnetosome-display System
  The 6th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
  2018年09月, ポスター発表
• Bioengineering of Magnetic Nanoparticles Produced by Magnetospirillum magneticum AMB-1 for Extensive Applications
  The 6th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• シグナリングアレイ方式のDNAチップを用いた微生物ゲノムDNAの検出
  第12回バイオ関連化学シンポジウム
  2018年09月, ポスター発表
• MCA/GCM法を用いた転移性がん患者由来血中循環腫瘍細胞の単一細胞遺伝子発現解析
  第12回バイオ関連化学シンポジウム
  2018年09月, ポスター発表
• 血中循環腫瘍細胞の遺伝子解析に向けたハイスループット単一細胞分離システムの開発
  第12回バイオ関連化学シンポジウム
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• Gel-based cell manipulation法に基づく環境微生物の単一細胞解析技術の開発
  第70回 日本生物工学会大会
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変による高付加価値脂肪酸の効率的生産
  第70回 日本生物工学会大会
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• 工学研究に基づいた単一 CTC の遺伝子発現プロファイル解析
  第３回 CTC 研究フォーラム 2018
  2018年08月29日, 口頭発表（招待・特別）
• マイクロ流体デバイスを活用した単一がん細胞の遺伝子解析
  2018年度京都バイオ計測センターシンポジウム
  2018年08月01日, 口頭発表（招待・特別）
• Process design for the mass production of biofuels from the marine oleaginous diatom Fistulifera solaris with the use of wastewater as nutrients
  The 8th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2018年06月, ポスター発表
• Improvement of valuable fatty acid production in the marine oleaginous diatom Fistrulifera solaris
  The 8th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2018年06月, ポスター発表
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変に基づくプロスタグランジンの高効率生産
  第20回マリンバイオテクノロジー学会
  2018年05月, 口頭発表（一般）
• 珪藻細胞内におけるトリアシルグリセロールの凝固挙動の解析
  第20回マリンバイオテクノロジー学会
  2018年05月, ポスター発表
• オートファジー阻害剤を用いた珪藻オイルボディ形成への影響評価
  第20回マリンバイオテクノロジー学会
  2018年05月, ポスター発表
• 磁性細菌 Magnetospirillum magneticum におけるホスファチジルコリン合成酵素の発現による磁気微粒子の膜改変
  日本化学会第98春季年会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris におけるシクロオキシゲナーゼ発現によるプロスタグランジンの生物
  日本化学会第98春季年会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• 微生物ゲノムDNAの検出に向けたシグナリングアレイの開発
  第85回電気化学会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• コロニーフィンガープリントの機械学習に基づく真正細菌の高精度判別
  第85回電気化学会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• 単一CTCの遺伝子発現解析を目指したプラットフォーム構築
  第２回 Liquid Biopsy研究会
  2018年01月, 口頭発表（招待・特別）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris における高付加価値脂肪酸の生産向上
  第4回分子珪藻研究会
  2017年12月, 口頭発表（一般）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変によるプロスタグランジンの生産
  第4回分子珪藻研究会
  2017年12月, 口頭発表（一般）
• Techniques for Genomic and Morphological Characterization of Environmental Microbes at Single-Cell Level via Gel-based Cell Manipulation
  IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions 2017
  2017年11月, ポスター発表
• In vivo Modification of Membrane Composition of Magnetosomes via Expression of Phosphatidylcholine Synthase in Magnetotactic Bacteria
  IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions 2017
  2017年11月, ポスター発表
• Molecular desigh of magnetic nanoparticle surfaces in magnetotactic bacteria and its application
  IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions 2017
  2017年11月, 口頭発表（招待・特別）
• レンズレスイメージングに基づく血中循環腫瘍細胞の培養モニタリングシステムの開発
  第62回化学センサ研究発表会
  2017年09月11日, その他
• 血中循環腫瘍細胞の遺伝子変異検出に向けたハイスループット単一細胞単離システムの構築
  第62回化学センサ研究発表会
  2017年09月11日, その他
• Hydrogel-based cell manipulation 法に基づく環境微生物のシングルセルゲノム解析技術の開発
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris JPCC DA0580 株を用いた CRISPR/Cas9 法によるゲノム編集技術の確立
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• ホスファチジルコリン合成酵素の発現による磁性細菌 Magnetospirillum magneticumAMB-1の磁気微粒子膜の組成改変
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• 磁性細菌 Magnetospirillum magneticum AMB-1 を用いたポリヒドロキシブタン酸の生産 と磁気回収の検討
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• 脂質高蓄積珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変によるプロスタグランジンの高効率生産
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月07日, ポスター発表
• 細胞高集積化デバイスを用いたがん細胞分泌タンパク質のシングルセル解析
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月07日, その他
• バイオ燃料生産への利用に向けた水面浮遊性微細藻類におけるオイル生産性向上
  第69回 日本生物工学会大会
  2017年09月, ポスター発表
• Microcavity array方式に基づく血中循環腫瘍細胞の迅速な遺伝子発現解析
  第69回 日本生物工学会大会
  2017年09月, ポスター発表
• 細胞高集積化デバイスを用いた単一がん細胞からの分泌タンパク質の免疫測定
  第69回 日本生物工学会大会
  2017年09月, ポスター発表
• Single cell analysis of diatoms based on microcavity array system
  The 73rd Fujihara Seminar International Conference “Molecular Life of Diatoms”
  2017年07月12日, 口頭発表（招待・特別）
• Functional analysis of microalgal oil body-associated proteins identified from oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580
  The 73rd Fujihara Seminar International Conference “Molecular Life of Diatoms”
  2017年07月11日, ポスター発表
• Homoeolog expression bias in allopolyploid oleaginous marine diatom Fistulifera solaris
  The 73rd Fujihara Seminar International Conference “Molecular Life of Diatoms”
  2017年07月10日, その他
• Eicosapentaenoic acid production from oleaginous microalga Fistulifera solaris by high cell density cultivation
  7th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2017年06月21日, ポスター発表
• Evaluation of the potential of water surface-floating microalgae for biofuel production
  7th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2017年06月19日, その他
• 海洋珪藻 Fistulifera solarisの高密度培養による多価不飽和脂肪酸生産
  第19回マリンバイオテクノロジー学会
  2017年06月04日, その他
• Genome editing of marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 using CRISPR/Cas9 system
  The 11th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2017年05月23日, その他
• Identification and functional analysis of oil body-associated proteins of oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580
  The 11th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2017年05月23日, その他
• Biased contribution of the homoeologous subgenomes to lipid metabolisms in the marine allodiploid diatom Fistulifera solaris
  The 11th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2017年05月23日, その他
• 光硬化性ハイドロゲルを利用した単一微生物の単離・培養法の開発
  化学とマイクロ・ナノシステム学会第35回研究会
  2017年05月23日, ポスター発表
• 単一細胞の高効率分離を目指したマルチ光照射システムの構築
  化学とマイクロ・ナノシステム学会第35回研究会
  2017年05月23日, ポスター発表
• マイクロキャビティアレイ方式に基づく血中循環腫瘍細胞の自動回収・培養技術の開発
  化学とマイクロ・ナノシステム学会第35回研究会
  2017年05月22日, ポスター発表
• コロニーフィンガープリントに基づく簡易・迅速な黄色ブドウ球菌の判別
  電気化学会第84回大会
  2017年03月27日, その他
• シグナリングアレイプローブを用いた病原性微生物の簡易遺伝子検出法の開発
  電気化学会第84回大会
  2017年03月27日, その他
• 磁性粒子上へのセルラーゼ複合体共局在によるセルロース分解能の向上
  日本化学会 第97春季年会
  2017年03月18日, その他
• 海洋性珪藻Fistulifera solaris におけるω3 desaturase の強発現によるエイコサペンタエン酸 (EPA)の高生産
  日本化学会 第97春季年会
  2017年03月18日, その他
• Development of single-cell genetic analysis system for circulating tumor cells based on microcavity array
  日本化学会 第97春季年会
  2017年03月18日, その他
• 血中循環腫瘍細胞の遺伝子解析技術の開発
  JMAC　第94回ワーキンググループ会議
  2016年12月, 口頭発表（招待・特別）
• Fabrication of a single-cell gel manipulation system based on multiple light illumination
  International Conference on Single Cell Research 2016
  2016年11月17日, ポスター発表
• Hydrogel-based single-cell manipulation towards genetic analysis of single circulating tumor cell
  International Conference on Single Cell Research 2016
  2016年11月17日, ポスター発表
• HIGH-THROUGHPUT SINGLE-CELL MANIPULATION TOWARDS CIRCULATING TUMOR CELL SEQUENCING
  International Conference on Single Cell Research 2016
  2016年11月17日, 口頭発表（一般）
• 血中循環腫瘍細胞の回収技術と遺伝子解析への応用
  技術情報協会セミナー：がんの早期診断を可能にする最新のリキッドバイオプシー技術
  2016年11月, 口頭発表（招待・特別）
• 細胞マイクロアレイ技術を活用した血中循環腫瘍細胞の単一細胞解析
  先端医工学研究センター第3回学術交流会
  2016年10月, 口頭発表（招待・特別）
• 水面浮遊性微細藻類FFG039株における遺伝子組換え技術の確立
  第68回 日本生物工学会大会
  2016年09月30日, ポスター発表
• 都市排水を利用した微細藻類のバイオ燃料生産に向けた新規候補株の探索
  第68回 日本生物工学会大会
  2016年09月30日, ポスター発表
• オイル高蓄積海洋珪藻Fistulifera solarisにおけるオイルボディタンパク質の解析
  第68回 日本生物工学会大会
  2016年09月30日, ポスター発表
• マルチ光照射システムを用いた単一細胞のゲルマニピュレーション技術の開発
  第10回バイオ関連化学シンポジウム
  2016年09月08日, ポスター発表
• レンズレスイメージングにより取得したコロニーフィンガープリントに基づくStaphyrococcus族の菌種判別
  第10回バイオ関連化学シンポジウム
  2016年09月08日, その他
• 単一細胞高集積化デバイス上におけるがん細胞分泌タンパク質の免疫測定法の開発
  第10回バイオ関連化学シンポジウム
  2016年09月07日, ポスター発表
• Bioproduction of prostaglandins in the marine diatom Fistulifera solaris expressing cyclooxygenase
  Malaysia-Japan Joint international
  2016年09月06日, その他
• Metabolic Analysis of Fatty Alcohol in a Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. NKBG 15041c
  Malaysia-Japan Joint international
  2016年09月06日, その他
• Production of functional biomaterials using genetically engineered microbes
  Malaysia-Japan Joint international conference
  2016年09月06日, その他
• EXPLORATION OF COLD TOLERANT FACTORS IN OLEAGINOUS DIATOM MAYAMAEA SP. JPCC CTDA0820 BY ANALYZING DRAFT GENOME
  11th International Marine Biotechnology Conference
  2016年08月31日, ポスター発表
• CHARACTERIZATION OF A WATER-SURFACE FLOATING GREEN MICROALGA TOWARD BIOFUEL PRODUCTION
  11th International Marine Biotechnology Conference
  2016年08月31日, ポスター発表
• Nutrient removal and oil production by an oleaginous microalga, chlorella sp. NKG 021201 using municipal wastewater
  6th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2016年06月28日, ポスター発表
• Characterization of the psychrotolerant and oleaginous diatom, Mayamaea sp. JPCC CTDA0820 towards biodiesel fuel production in cool climates in Japan
  6th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2016年06月27日, ポスター発表
• オイル高蓄積耐冷性珪藻Mayamaea属JPCCCTDA0820株の培養特性評価及びその関連因子の解析
  第18回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2016年05月29日, その他
• シクロオキシゲナーゼ発現海洋珪藻Fistulifera solarisにおけるプロスタグランジンの生産
  第18回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2016年05月29日, その他
• Colony fingerprinting toward rapid detection and classification of microbial species
  BIOSENSORS2016
  2016年05月25日, ポスター発表
• マイクロコロニーのレンズレスイメージングに基づく簡易・迅速な菌種判別法の開発
  電気化学会第83回大会
  2016年03月29日, その他
• 単一細胞解析に向けた光硬化性ハイドロゲルを利用した細胞単離方法の開発
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• 機能性ペプチドをディスプレイした珪藻珪殻上における無機ナノ結晶の合成
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• 自己抗体計測に向けた甲状腺刺激ホルモン受容体-ナノ磁性粒子複合体の開発
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• Single Bacterial Cell Detection based on the Efficient DNA Recovery Technique with Charge-reversible Magnetic Nanoparticles
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• Cell-surface display of interactive proteins on the oleaginous diatom Fistulifera solaris for biomass harvesting
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Dynamic oil body generation in the marine oleaginous diatom Fistrulifera solaris JPCC DA0580 following in response to nutrient limitation revealed by morphological and lipidomic analysis
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Characterization of the cold-tolerant oleaginous diatom, Mayamaea sp. JPCC CTDA0820 as potential source for biodiesel production
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Alkane production by genetically engineered marine cyanobacterium Synechococcus sp. NKBG 15041c
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Proteome analysis of the oil body-associated proteins in the marine oleaginous diatom Fistrulifera solaris JPCC DA0580
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Enhancement of biomass productivity in marine oleaginous diatom Fistulifera solaris by silencing of fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein gene
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Development of techniques for single circulating tumor cell analysis based on microcavity array
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月18日, 口頭発表（一般）
• Single cancer cell isolation on the microcavity array platform using photopolymerizable hydrogel
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月18日, ポスター発表
• Microcavity array 技術に基づく血中循環腫瘍細胞の分離及び核酸解析への応用
  化学とマイクロ・ナノシステム学会 第32回研究会
  2015年11月27日, ポスター発表
• Rapid identification of bacterial microcolonies based on lens-less imaging
  11th Asian Conference on Chemical Sensors
  2015年11月16日, ポスター発表
• マグネトソームディスプレイによる磁性粒子上へのセルラーゼ複合体の固定化制御
  第67回　日本生物工学大会
  2015年10月27日, ポスター発表
• 混合栄養培養による耐冷性珪藻Mayamaea属のオイル生産性の向上
  第67回　日本生物工学大会
  2015年10月26日, ポスター発表
• 血中循環腫瘍細胞の迅速かつ高精度検出に向けた広視野一括撮像システムの構築
  第59回化学センサ研究発表会
  2015年09月11日, その他
• 光硬化性ハイドロゲルを利用した単一細胞ソーティング技術の開発
  第9回バイオ関連化学シンポジウム
  2015年09月11日, ポスター発表
• 表面機能化珪藻の珪殻における酸化チタンの合成
  第9回バイオ関連化学シンポジウム
  2015年09月11日, ポスター発表
• Cell surface　display　of　heterologous　protein　onto　the　surface　of　Fistulifera　solaris　for　the　recovery　of　cells
  5th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2015年06月09日, ポスター発表
• Screening of highly lipid-producing microlagae with potential for biofuel produation using municipal wastewater
  5th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2015年06月09日, ポスター発表
• Molecular insights into　oil　accumulation　in　the　oleaginous　diatom　Fistulifera　solaris　as　revealed　by　the　multi-omics　approach
  5th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2015年06月08日, その他
• 海洋藍藻Synechococcus sp. NKBG 15041c株へのアルカン合成関連遺伝子の導入とアルカン合成に関わる脂肪族化合物の解析
  第17回 マリンバイオテクノロジー学会大会
  2015年05月30日, ポスター発表
• Genetic Transformation System for an Oleaginous and Cold-tolerant Diatom, Mayamaea sp. JPCC CTDA0820
  第17回 マリンバイオテクノロジー学会大会
  2015年05月30日, ポスター発表
• Imaging analysis of biomolecules in a living microalga cell using confocal Raman microspectroscopy
  日本化学会 第95回春季年会
  2015年03月28日, その他
• リガンドハンティングに向けた神経成長因子受容体-ナノ磁性粒子の開発
  日本化学会 第95回春季年会
  2015年03月27日, その他
• 細胞マイクロアレイを利用した血中循環腫瘍細胞の解析技術の開発
  化学工学会 第80年会
  2015年03月20日, 口頭発表（招待・特別）
• In vivo imaging of biomolecules in a living microalga cell using confocal Raman microspectroscopy
  2nd International Workshop of Cyanofactory
  2015年03月06日, 口頭発表（招待・特別）
• Biofuel Production from the Floating Microalgal Biofilm: an Easy Method to Harvest the Microalgal Biomass
  Korean Ministry of Science, ICT and Future Planning, Advanced Biomass R&D Center (ABC) and AOAIS International Organizing Committee
  2014年11月19日, ポスター発表
• Isolation of Psychrophilic and Cold-Tolerant Diatoms for Stable Biodiesel Production
  3rd Asia-Oceania Algae Innovation Summit
  2014年11月18日, ポスター発表
• Rate-Limiting Factors of Lipid Accumulation in the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 as Revealed by the Transcriptome Analysis
  3rd Asia-Oceania Algae Innovation Summit
  2014年11月18日, ポスター発表
• Incorporation of titanium into the diatom cell wall towards biosynthesis of photocatalytic materials
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Effects of electrochemical treatment on the inactivation of feline calicivirus, a surrogate for norovirus
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Investigation of the wide-field fluorescent imaging system using a 2D photosensor toward rapid detection of circulating tumor cells
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• A simple method for single cell manipulation using photopolymerizable hydrogel and microcavity array
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Surface modification of magnetic nanoparticles using designed polypeptides towards biomedical applications
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Kinetic analysis of intracellular molecules in microalgae by in vivo cell imaging
  Institute for Protein Research (IPR) International Seminar
  2014年10月24日, 口頭発表（招待・特別）
• 2次元フォトセンサを用いたマイクロコロニー形成モニタリング法の開発
  2014年電気化学秋季大会
  2014年09月28日, その他
• オイル高蓄積珪藻Fistulifera solaris JPCC DA0580株のオイルボディのプロテオーム解析
  第8回バイオ関連化学シンポジウム
  2014年09月13日, その他
• in vitro docking法による単鎖抗体の磁性細菌粒子上への機能発現
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月11日, ポスター発表
• Lipid profiling of an EPA producing oleaginous marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 to predict the EPA incorporation into glycerolipid
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月11日, ポスター発表
• オイル高蓄積珪藻Fistulifera solaris JPCC DA0580株の遺伝子サイレンシング技術の確立
  第8回バイオ関連化学シンポジウム
  2014年09月11日, ポスター発表
• 耐冷性珪藻Mayamaea属JPCC CTDA0820株の高密度培養条件の検討
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月10日, ポスター発表
• オイル高生産微生物藻類Fistulifera solaris JPCC DA0580株のglycerol資化能の向上
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月09日, ポスター発表
• Lipid compositional analysis of marine diatom Fistulifera solaris strain JPCC DA0580 using Raman microspectroscopy
  The Second Taiwan International Symposium on Raman Spectroscopy
  2014年06月23日, ポスター発表
• Understanding of the Eicosapentaenoic Acid (EPA) synthesis and its incorporation into Triacylglycerol (TAG) in marine oleaginous diatom Fistulifera sp. JPCC DA0580
  4th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2014年06月16日, ポスター発表
• Identification of novel oleosome-associated proteins from the olegainous diatom Fistulifera sp. JPCC DA0580
  4th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2014年06月15日, その他
• 栄養枯渇条件下におけるFistulifera solarisのトランスクリプトーム解析
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年06月01日, その他
• 油脂高蓄積珪藻からの新規珪殻タンパク質の同定
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年06月01日, その他
• 油脂高蓄積珪藻の葉緑体への外来タンパク質輸送技術の確立
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年05月31日, ポスター発表
• 海洋藍藻Synechococcus sp. NKBG 15041c株におけるテトラサイクリン発現誘導システムの構築
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年05月31日, ポスター発表
• Rapid CD4+ cell counting based on single image capture using a microcavity array
  24th Anniversary World Congress on Biosensors
  2014年05月29日, ポスター発表
• Development of automated microcavity array system toward isolation and detection of circulating tumor cells
  24th Anniversary World Congress on Biosensors
  2014年05月29日, ポスター発表
• Microcavity array 方式による血中循環腫瘍細胞自動回収装置の開発
  電気化学会第81回大会
  2014年03月29日, その他
• 海洋微生物を活用した環境調和型の有用物質生産
  東京農工大学・上智大学 共催シンポジウム
  2014年03月, 口頭発表（一般）
• タンパク質－ナノ磁性粒子複合体のin vivo合成と医療への応用
  先端錯体工学研究会シンポジウム
  2013年12月03日, 口頭発表（招待・特別）
• Engineering marine diatom Fistulifera sp. JPCC DA0580 toward biodiesel fuel production
  International Symposium on Microalgal Biofuels and Bioproducts
  2013年11月21日, ポスター発表
• Modification of fatty acid composition by gene silencing of Δ9 desaturase in oleaginous diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  10th International Marine Biotechnology Conference
  2013年11月, ポスター発表
• Time-lapse analysis of oleaginous diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 during the triglyceride accumulation using single-cell patterning
  10th International Marine Biotechnology Conference
  2013年11月, ポスター発表
• Functional analysis of a key enzyme in PUFA synthesis, Δ9 desaturase, identified from the oleaginous diatom Fistulifera
  10th International Marine Biotechnology Conference
  2013年11月, その他
• MICROCAVITY ARRAY SYSTEM FOR SIZE-BASED ENRICHMENT OF CIRCULATING TUMOR CELLS FROM SMALL CELL LUNG CANCER PATIENTS
  Fronties of Single Cell Analysis (The 7th International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis)
  2013年09月, ポスター発表
• 顕微ラマン分光法による海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株の脂質解析
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月, ポスター発表
• Microcavity array 技術に基づく血中循環がん細胞自動回収装置の開発
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月, ポスター発表
• 温度応答性MHC分子-ナノ磁性粒子複合体を用いたペプチドプールからのがん抗原ペプチドのスクリーニング
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月, ポスター発表
• Global lipidomic analysis for high neutral lipids and EPA producing marine diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 toward the understanding of lipid metabolism under nutrition depletion
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月, ポスター発表
• in silicoスクリーニングによるFistuliferasp.からの新規珪殻タンパク質の探索
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月, ポスター発表
• Discovery of novel proteins localized on　oil bodies of the oleaginous diatom Fistulifera sp.
  EMBO Workshop on The molecular life of diatoms
  2013年06月, ポスター発表
• 単一細胞パターニングによる海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株のオイル蓄積過程のタイムラプス解析
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月, ポスター発表
• 分子育種による海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株のグリセロール資化能の向上
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月, その他
• 海洋珪藻Fistulifera.sp JPCC DA0580株の油滴局在タンパク質の分離と同定
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月, その他
• 顕微ラマン分光法による海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580 株の脂質イメージング解析
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月, その他
• 磁性細菌粒子上への抗原ペプチド-MHC class I融合タンパク質の機能発現と細胞分離への応用
  日本化学会第93春季年会
  2013年03月, その他
• 磁性細菌Magnetospirillum magneticum AMB-1プロテアーゼ欠損株を用いた外来タンパク質高発現磁性粒子の開発
  日本化学会第93春季年会
  2013年03月, その他
• 高オイル生産海洋珪藻 Fistulifera sp. JPCC DA0580 株におけるΔ9 desaturase 遺伝子の機能解析
  日本化学会第93春季年会
  2013年03月, その他
• 医療分野への応用を目指した磁性細菌による磁性粒子エンジニアリング
  日本生物工学会　東日本支部　賀詞交換会
  2013年01月, 口頭発表（招待・特別）
• タンパク質-ナノ磁性ビーズ複合体
  ソフトインターフェースの分子科学「新技術発表会」
  2012年11月, 口頭発表（一般）
• Microcavity Array-Based Living Cell Patterning for Tracking Cellular Behavior at the Single-Cell Level
  International Joint Symposium on Single-Cell Analysis
  2012年11月, ポスター発表
• Novel Method for Measuring of Cancer Cell Deformability Using a High-Density Microcavity Array
  International Joint Symposium on Single-Cell Analysis
  2012年11月, ポスター発表
• 微生物改変による高機能性バイオナノ磁性粒子の創製
  酵素工学研究会第68回講演会
  2012年10月, 口頭発表（招待・特別）
• アルカン合成関連遺伝子の導入による海洋藍藻Synechococcus sp. NKBG 15041c株の炭化水素の生産
  第64回日本生物工学会大会
  2012年10月, その他
• がん抗原ペプチド探索の効率化に向けた温度応答性MHC分子-ナノ磁性粒子複合体の開発
  第64回日本生物工学会大会
  2012年10月, その他
• 海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株からの効率的な油滴分画法の確立及び油滴局在タンパク質の解析
  第64回日本生物工学会大会
  2012年10月, その他
• Development of cell analysis method by using CMOS sensor for high-throughput blood cell profiling
  PRiME 2012
  2012年10月, ポスター発表
• Development of microcavity array system for isolation and detection of circulating tumor cells
  第71回 日本癌学会学術総会
  2012年09月, 口頭発表（招待・特別）
• Microcavity arrayを用いたがん細胞変形能の網羅的計測
  第6回バイオ関連化学シンポジウム
  2012年09月, ポスター発表
• 抗原特異的T細胞の磁気分離に向けた単鎖MHC class I 発現ナノ磁性粒子の開発
  第6回バイオ関連化学シンポジウム
  2012年09月, ポスター発表
• Hydrocarbon Production in Synechococcus sp. Strain NKBG 15041c through the Expression of Heterogeneous Alkane Synthesis Genes
  The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2012年07月, ポスター発表
• Comprehensive Gene Expression Analysis during Triglyceride Accumulation in Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2012年07月, その他
• Enhanced Display of Heterologous Proteins Onto Bacterial Magnetic Particles Using Lon Deletion Mutant in Magnetospirillum Magneticum AMB-1
  American Society for Microbiology 112th General Meeting
  2012年06月, ポスター発表
• Establishment of Gene Transfoemation Technique of Marine Pennate Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 for Effective Biodiesel Production
  American Society for Microbiology 112th General Meeting
  2012年06月, ポスター発表
• Transcriptomic Analysis of the Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA 0580 toward Biodiesel Productio
  The 2nd International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2012年06月, その他
• Development of Microcavity Array System for Enumeration of Circulating Tumor Cells from Whole Blood
  Biosensors 2012
  2012年05月, ポスター発表
• Development of Thermoresponsive MHC Molecule-conjugated Magnetic Particles for Screening of Cancer Antigen Peptides
  The 2012 MRS Spring Meeting
  2012年04月, ポスター発表
• Development of microcavity array system for size- and deformability-based isolation of circulating tumor cells
  AACR Annual Meeting 2012
  2012年04月, ポスター発表
• 活性酸素種を利用したネコカリシウイルスの不活化の解析
  電気化学会第79回大会
  2012年03月, その他
• 細胞集積化基板を用いた浮遊細胞のタイムラプス解析
  日本化学会第９２春季年会
  2012年03月, その他
• 温度応答性MHC 分子-ナノ磁性粒子複合体を用いた抗原ペプチド探索技術の開発
  日本化学会第９２春季年会
  2012年03月, その他
• RNA-seqに基づく海洋珪藻Fistulifera sp. solaris株のオイル蓄積機構の解析
  日本化学会第９２春季年会
  2012年03月, その他
• 血液から標的細胞を取り出すナノ磁石の魅力
  第1回CSJ化学フェスタ －2011世界化学年記念大会
  2011年11月14日, 口頭発表（招待・特別）
• 遺伝子融合技術による機能性ナノ磁性粒子の創製と応用展開
  第63回生物工学会
  2011年09月27日, 口頭発表（一般）
• Size- and deformability-based isolation of circulating tumor cell using a microcavity array
  62nd Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry in Niigata, Japan
  2011年09月, ポスター発表
• 全血からの循環腫瘍細胞濃縮に向けたマイクロフィルター構造の最適化
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月, その他
• がん抗原ペプチド探索に向けたMHC分子発現磁性細菌粒子の開発
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月, その他
• 海洋珪藻 Fistulifera sp. JPCC DA0580株における油滴局在タンパク質のプロテオーム解析
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月, その他
• 異種タンパク質分解に関与する磁性細菌由来プロテアーゼの解析
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月, その他
• 遺伝子融合技術によるナノ磁性粒子表面の機能創生と応用展開
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月, 口頭発表（一般）
• 発現誘導システムを用いた磁性細菌粒子上への甲状腺刺激ホルモン受容体のディスプレイ
  第5回バイオ関連化学シンポジウム
  2011年09月, ポスター発表
• 単一浮遊細胞の経時観察に向けた細胞捕捉基板の開発
  第5回バイオ関連化学シンポジウム
  2011年09月, ポスター発表
• Microcavity arrayを用いた微量血液からの白血球ポピュレーション解析技術の確立
  第5回バイオ関連化学シンポジウム
  2011年09月, その他
• ナノ磁性粒子界面のタンパク質発現制御とその有効利用
  ナノテク部会第41回研究会
  2011年07月20日, 口頭発表（招待・特別）
• 微生物を利用したナノ磁性粒子の分子設計
  第10回バイオテクノロジー国際会議
  2011年06月, 口頭発表（一般）
• 脂肪酸組成改変に向けた海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株の形質株の形質転換法の確立
  第14回マリンバイオテクノロジー学会
  2011年05月, その他
• デジタル遺伝子発現解析に基づく海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株のmRNA動態解析
  第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2011年05月, その他
• 濃度勾配形成流路を配した単一細胞アレイによる細胞毒性評価法の開発
  電気化学会第78回大会
  2011年03月, その他
• 医療応用を目指したバイオナノ磁性粒子の分子設計
  第７回農工大・電通大合同シンポジウム
  2010年12月, 口頭発表（招待・特別）
• Rapid and efficient detection of circulating tumor cells from whole blood using a microfluidic device equipped with a size selective microcavity array
  Pacifichem
  2010年12月, その他
• Characterization of NS polypeptides and its interactions with cell surfaces
  Pacifichem
  2010年12月, ポスター発表
• 濃度勾配形成マイクロデバイスを用いた単一細胞毒性評価システムの構築
  第62回日本生物工学会大会
  2010年10月, 口頭発表（一般）
• バイオナノ磁性粒子上への外来タンパク質ディスプレイ量増大に向けたホスト細胞の改変
  第62回日本生物工学会大会
  2010年10月, 口頭発表（一般）
• 濃度勾配形成マイクロデバイスを用いた単一細胞毒性評価システムの構築
  第62回日本生物工学会大会
  2010年10月, ポスター発表
• 細胞への非特異吸着の低減を目指したバイオナノ磁性粒子の分子設計
  第62回日本生物工学会大会
  2010年10月, ポスター発表
• Microcavity arrayを用いた微量血液からの白血球ポピュレーションの解析
  第4回バイオ関連化学シンポジウム
  2010年09月, ポスター発表
• 循環腫瘍細胞の迅速検出に向けたマイクロデバイスの開発
  電気化学秋季大会（第50回化学センサ研究会）
  2010年09月, その他
• バイオナノ磁性粒子を用いた血清中の自己抗体検出技術の開発
  電気化学秋季大会（第50回化学センサ研究会）
  2010年09月, その他
• Prediction of metabolic pathways in marine pennate diatom strain JPCC DA0580 based on genome analysis
  The VIIth International Symposium on Inorganic Carbon Utilization by Aquatic Photosynthetic Organisms
  2010年09月, 口頭発表（一般）
• Surface modification of magnetic nanoparticles using a polypeptide designed to control interactions with cell surfaces
  MRS 2010 Spring　Meeting
  2010年04月, ポスター発表
• A single-cell based microfluidic gradient device for the screening and evaluation of cytotoxic chemicals
  電気化学77回大会（化学センサ研究会）
  2010年03月, その他
• 単一細胞に対する濃度依存的な毒性評価のためのマイクロデバイスの開発
  日本化学会第90春季年会
  2010年03月, その他
• 全血からの循環腫瘍細胞高効率検出デバイスの開発
  日本化学会第90春季年会
  2010年03月, その他
• Nanocomposites Consisting of in vivo-biotinylated Bacterial Magnetic Particles and Quantum Dots for Magnetic and Fluorescent Labeling of Cancer Cells.”
  19 th MRS-J Symposium
  2009年12月, ポスター発表
• Magnet microarray for single cell entrapment and culture
  APBioChEC'09
  2009年11月, ポスター発表
• A single-cell based biosensing device directed for lipophilic chemical screening and evaluation.
  APBioChEC'09
  2009年11月, 口頭発表（一般）
• バイオナノ磁性粒子膜上への効率的な膜タンパク質ディスプレイに向けた発現誘導システムの構築
  第61回日本生物工学会大会
  2009年09月, その他
• 大腸菌ビオチンリガーゼによるバイオナノ磁性粒子のin vivoビオチン標識
  第61回日本生物工学会大会
  2009年09月, その他
• 甲状腺刺激ホルモン受容体発現バイオナノ磁性粒子を用いた自己抗体検出法の開発
  第61回日本生物工学会大会
  2009年09月, その他
• 細胞への非特異吸着の低減を目指したバイオナノ磁性粒子の分子設計
  第12回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2009年09月, 口頭発表（一般）
• バイオナノ磁性粒子上への嗅覚受容体ディスプレイに向けた発現方法の検討
  第12回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2009年09月, ポスター発表
• Microcavity arrayを用いた血液からのcirculating tumor cells検出技術の開発
  第12回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2009年09月, その他
• ヒトプロゲステロン受容体安定発現株を用いた異なる細胞周期における化学物質評価
  第12回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2009年09月, その他
• 微生物を利用した高機能ナノ磁性粒子の設計と生産技術
  新技術説明会
  2009年06月26日, 口頭発表（一般）
• 受容体解析に向けたバイオナノ磁性粒子上へのディスプレイ技術
  日本薬学会第129年会
  2009年03月26日, 口頭発表（招待・特別）
• 癌細胞の蛍光・磁気標識のための量子ドット-磁性細菌粒子ナノ複合体の構築
  電気化学76回大会
  2009年03月, その他
• 化学物質評価に向けた単一細胞によるバイオセンシングデバイスの開発
  電気化学76回大会
  2009年03月, その他
• 高橋正行, 秋山靖人, 吉野知子,　竹山春子, 松永是
  日本化学会第89春季年会
  2009年03月, その他
• 脂溶性化学物質スクリーニング・評価に向けたバイオセンシングデバイスの開発
  日本化学会第89春季年会
  2009年03月, その他
• バイオナノ磁性粒子を用いたメラノーマ細胞特異的キラーT 細胞分離技術の開発
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会　合同大会
  2008年12月, ポスター発表
• Metabolic biotinylation of bacterial magnetic particles for assembly of functional nanomaterials
  The 8th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2008年11月, ポスター発表
• Development of a comprehensive reporter gene assay against lipophilic chemicals using a genetically modified stable HeLa cell line
  The 3nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
  2008年09月, ポスター発表
• リン脂質を用いたバイオナノ磁性粒子膜再構築技術の開発
  第3回バイオ関連化学合同シンポジ
  2008年09月, ポスター発表
• 腫瘍マーカー検出をめざした脂質膜被覆磁気微粒子の開発
  第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  2008年09月, ポスター発表
• バイオナノ磁性粒子上への機能性マテリアルの部位選択的固定化
  第60回日本生物工学会大会
  2008年08月, その他
• 微生物を用いたバイオナノ磁性粒子の生産と医療応用への展開
  第26回ナノバイオ磁気工学専門研究会
  2008年07月, 口頭発表（招待・特別）
• バイオナノ磁性粒子上でのエストロゲン受容体の効率的な二量体化
  日本化学会第88春季年会
  2008年03月, その他
• Direct Cell Separation from Whole Blood using Bacterial Magnetic Particles Expression Protein G
  MRS 2008 Spring　Meeting
  2008年03月, ポスター発表
• Novel method for construction of streptavidin-immobilized bacterial magnetic particles via in vivo biotinylation
  MRS 2008 Spring　Meeting
  2008年03月, ポスター発表
• Bioengineering of bacterial magnetic particles and its application to ligand screening
  MRS 2008 Spring　Meeting
  2008年03月, その他
• バイオナノ磁性粒子上への部位特異的ビオチン化技術の開発
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会　合同大会
  2007年12月, ポスター発表
• Development of a comprehensive GR reporter gene assay using a genetically modified stable HeLa cell line.
  第59回日本生物工学会大会
  2007年09月, その他
• パイロシークエンス技術の効率化に向けた2種窒素固定化バイオナノ磁性粒子の開発
  第59回日本生物工学会大会
  2007年09月, その他
• バイオナノ磁性粒子上でのエストロゲン受容体－コアクチベーター複合体形成を指標とした化学物質評価法の開発
  第59回日本生物工学会大会
  2007年09月, その他
• バイオナノ磁性粒子膜改変による新規マテリアルの創製と細胞分離への応用
  第59回日本生物工学会大会
  2007年09月, その他
• 2種酵素固定化バイオナノ磁性粒子の開発とパイロシークエンスへの応用
  第10回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2007年09月, その他
• Development of a novel technique for a single-cell trapping by using magnet microarray.
  The 2nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
  2007年09月, その他
• Measurement of single mRNA with nano-sized biomagnetic beads.
  The 2nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
  2007年09月, その他
• 磁気細胞分離システムへの効率化に向けたバイオナノ磁性粒子膜改変技術の開発
  日本化学会第87春季年会
  2007年03月, その他
• バイオナノ磁性ビーズ－マイクロポリスチレンビーズ複合体 ‘Beads on Beads’ を用いた前立腺特異抗原の全自動免疫測定システムの開発
  日本化学会第87春季年会
  2007年03月, その他
• Development of nano-magnetic beads and Micro-polystyrene beads composites, 'Beads on Beads'.
  The Eleventh Biological Sciences Graduate Congress
  2006年12月, その他
• 磁性細菌粒子表面ディスプレイ技術におけるMms13アンカー分子のキャラクタリゼーション
  第58回日本生物工学会大会
  2006年09月, その他
• プロテインA発現磁性細菌粒子を用いた樹状細胞の獲得
  第58回日本生物工学会大会
  2006年09月, その他
• 抹消血からの樹状細胞の高効率回収に向けた磁性細菌粒子を用いた磁気細胞分離システムの開発
  日本化学会年会第86春季年会
  2006年03月, その他
• 膜貫通タンパク質Mms13をアンカーとしたProtein A発現磁性細菌粒子の膜改変技術の開発
  日本化学会年会第86春季年会
  2006年03月, その他
• Efficient preparation of dendritic cells from peripheral blood using antibody-introduced bacterial magnetic particles.
  Pacifichem
  2005年12月, その他
• Molecular assembly of IgG-binding domains of protein A onto nano-sized bacterial magnetic particles using novel molecular anchor.
  Pacifichem
  2005年12月, その他
• 全自動免疫測定システムの構築に向けたBeads on Beadsの開発
  第57回日本生物工学会大会
  2005年11月, その他
• 磁気ペプチドナノチューブの創製とその応用
  第57回日本生物工学会大会
  2005年11月, その他
• 機能性ナノ磁性粒子の創製と医療分野へのアプローチ
  早稲田大学ナノテクフォーラム情報機能性材料部会
  2005年11月, 口頭発表（招待・特別）
• タンパク発現ナノ磁気微粒子による自動免疫測定
  免疫化学測定法研究会・第１０回学術集会
  2005年07月, その他
• プロテインＡ発現バイオナノ磁性粒子を用いた抹消血からの形質細胞様樹状細胞の高効率回収
  日本化学会年会第85春季年会
  2005年03月, その他
• バイオナノ磁性粒子膜上への効率的な外来タンパク質アセンブル技術の開発
  日本化学会年会第85春季年会
  2005年03月, その他
• バイオナノ磁性粒子上への膜タンパク質アセンブリング技術における発現調節因子の解析
  日本化学会年会第84春季年会
  2004年03月, その他
• ヒト、魚類エストロゲンレセプター発現バイオナノ磁性粒子を用いた各種エストロゲン様化学物質のレセプター結合解析
  日本化学会年会第84春季年会
  2004年03月, その他
• Expression and characterization of G protein coupled receptors on nano-sized bacterial magnetic particles.
  MRS　FALL　MEETING
  2003年12月, その他
• 流加培養によるGタンパク共役レセプター発現磁性細菌粒子の大量生産
  生物工学会
  2003年10月, その他
• バイオナノ磁性粒子上にディスプレイしたＧタンパク質共役受容体のキャラクタリゼーション
  生体機能関連化学部会・バイオテクノロジー部会合同シンポジウム
  2003年10月, その他
• Assembling of G protein-coupled receptors onto nano-sized bacterial magnetic particles through genetic engineering.
  US-Japan Symposium on Nanotechnology in Advanced Therapy and Diagnosis
  2003年10月, その他
• Genetic engineering of bio-nanomagnetite for display of G protein coupled receptors.
  The First International Congress on Bio-Nanointerface
  2003年05月, その他
• 大学発バイオベンチャーの産業界への挑戦　～医療・環境分野へのアプローチ～
  第１回バイオシーズ・マッチング会
  2003年04月, 口頭発表（招待・特別）
• Ｇタンパク質共役受容体をセルフアセンブリングしたバイオナノ磁気微粒子のリガンドスクリーニング技術への応用
  日本化学会年会第83春季年会
  2003年03月, その他
• Ｇタンパク質共役受容体の磁性細菌粒子表面ディスプレイ
  第6回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2002年09月, その他
• SNP detection in aldehyde dehydrogenase 2 using bacterial magnetic particles.
  The Seventh World Congress on Biosensors
  2002年05月, その他
• Display of estrogen receptor on biomagnetite and detection of estrogen-like chemicals.
  MRS　SPRING　MEETING
  2002年04月, その他
• ヘマグルチニンタグ標識磁性細菌粒子膜特異的タンパク質Mms16の局在評価
  日本化学会年会第81春季年会
  2002年03月, その他
• 磁性細菌粒子マイクロアレイを用いた一塩基多型解析
  電気化学秋季大会
  2001年09月, その他
• DNA高集積型磁性ナノ粒子を用いた遺伝子多型解析
  日本生物工学会大会
  2000年08月, その他
• DNAプローブ修飾磁性ナノデバイスを用いたSNPの検出
  日本化学会第78春季年会
  2000年03月, その他

外部研究資金等

• CTC核酸解析プラットフォームの構築
  受託研究, 自 2016年04月01日, 至 2017年03月31日
• CTC核酸解析プラットフォームの構築
  受託研究, 自 2015年04月01日, 至 2016年03月31日
• CTC核酸解析プラットフォームの構築
  受託研究, 自 2014年10月01日, 至 2015年03月31日
• マイクロキャビティアレイ方式による高精度血中循環がん細胞計測装置の開発
  受託研究, 自 2014年04月01日, 至 2015年01月31日

委員歴

• 日本生物工学会
  代議員
  自 202104, 至 202303
• JST
  ACT-X 領域アドバイザー
  自 202004, 至 202503
• 日本化学会　バイオテクノロジー部会
  幹事
  自 202004, 至 202403
• 日本化学会
  春季年会　プログラム編成委員
  自 201910, 至 201912
• 日本生物工学会
  理事
  自 201905, 至 202304
• 文部科学省
  学術調査官
  自 201808, 至 201907
• 日本化学会
  春季年会　プログラム編成委員
  自 2017, 至 0000
• International Conference on Single Cell Research 2016
  自 2016, 至 0000
• 日本化学会
  生体機能関連化学・バイオテクノロジー　ディビジョン　幹事
  自 201603, 至 202002
• 日本生物工学会
  Journal of Bioscience and Bioengineering (Elsevier) Editor
  自 2015, 至 2019
• 独立行政法人日本学術振興会
  特別研究員等審査会専門委員
  自 2015, 至 2017
• 日本生物工学会
  日本生物工学会 実行委員
  自 2011, 至 0000
• 日本電気化学会
  電気化学秋季大会　実行委員
  自 2009, 至 0000
• 日本生物工学会
  代議員
  自 2009, 至 2016

所属学協会

• 日本化学会
• 日本生物工学会

受賞

• 公益社団法人 日本生物工学会
  第59回生物工学奨励賞（斎藤賞）
  「希少細胞を対象とした単一細胞解析技術の開発と応用」
  生物工学奨励賞（斎藤賞）は、日本生物工学会が生物工学分野の基礎学の進歩に寄与した功績者1名に、年に一度審査の上で授与される
  2023年05月30日
• マリンバイオテクノロジー学会
  マリンバイオテクノロジー学会　令和4年度論文賞
  Chromosome Scale Genome Assembly of the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  マリンバイオテクノロジー学会論文賞は、各年度に発行された学会誌 Marine Biotechnology 誌（No.1～6）に掲載されたものの中で優れた論文に対して授与される賞で、論文「Chromosome Scale Genome Assembly of the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris」が選ばれ、受賞した。
  2023年03月14日