田中　剛TANAKA Tsuyoshiタナカ　ツヨシ

業績情報

氏名・連絡先

• 氏名

  タナカ　ツヨシ, 田中　剛, TANAKA Tsuyoshi

• Fax番号

  042-385-7713

• eメールアドレス

  tsuyocc.tuat.ac.jp

• 個人ホームページ

  http://www.tuat.ac.jp/~matunaga/

主たる所属・職名

• 工学研究院　生命工学部門, 教授

その他の所属

• 工学部　生命工学科
• 工学府　生命工学専攻
• 生物システム応用科学府　共同先進健康科学専攻
• グローバルイノベーション研究院
• グローバル教育院

経歴

• -
  2000-2002　Research Associate, Heriot-Watt University
  自 2000年, 至 2002年03月31日

学歴

• 東京農工大学
  工学部
  物質生物工学科
  至 1995年, 卒業
• 東京農工大学
  大学院工学研究科
  物質生物工学専攻
  至 1997年, 修了, 博士前期
• 東京農工大学
  大学院工学研究科
  物質生物工学専攻
  至 2000年, 修了, 博士後期

教育・研究活動状況

• 自然界には、実に様々な機能を持つ生物が存在し、時として私たちを驚かせることがあります。特に、顕微鏡でしか見えないミクロな 世界の微生物や動植物細胞は、私たちが予想もしないような可能性を持っています。私たちにはその無限ともいうべき種の細胞の中から、一種の宝探しをしていくという楽しみがあるわけです。私たちの研究室では、自然界の微生物の中で、光合成を行う最小の生物である藍藻、光合成細菌といった微生物を、特に海洋から採取して、これらから有用な機能を発見し、利用する研究を行っています。このような海洋生物の総合利用技術は、マリンバイオテクノロジーとよばれ、近年 非常に注目されています。具体的には、炭酸ガス固定や水素、抗ガン、 抗エイズ剤の生産を行っています。さらに、これらの生物がより効率的に物質を生産できるように遺伝子操作を行ったり、リアクターを構築するなどして、実用化を目標とした研究を行っています。 　また、私たちは磁性細菌というユニークな微生物について研究を行っています。この細菌は、体内に小さな磁石をつくります。この磁石は、酸素が少ない自分の生育に適した環境に移動するための、方位磁石の役目を果たしていると考えられていますが、実際にはどうしてこのような磁石を作る必要があるのか、どうやって磁石を作るのかなど、謎の部分が多く、これらを解明するため、研究を行っています。また、この磁性細菌の作る磁気超微粒子を、超高感度計測用担体、磁気記録材料などに応用する研究を行っています。 このほかに、バイオとエレクトロニクスの接点となる、アレルギー測定用バイオセンサの開発や生物の電気化学制御の研究も行っています。このように私たちは実際に微生物や動植物細胞について、あらゆる 角度から、基礎科学研究と同時に工学的な研究を行っています。人間と自然界との接点で調和を図りつつ、自然からの恩恵を最大限に 引き出す研究、それが私たちの目指す生物工学なのです。

研究分野

• A689　ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学）, A27040　バイオ機能応用、バイオプロセス工学

研究キーワード

• バイオセンサ、マリンバイオテクノロジー、Lab-On-a-Chip、微細藻類

研究テーマ

• 遺伝子計測、細胞解析用のバイオセンサの開発
  自 2002, 至 2004
• 海洋微細藻類を用いたバイオ燃料生産に関する研究
  自 9999

科学研究費助成事業

• 挑戦的研究（開拓）
  オルガネラプロファイリングによるがん細胞の悪性度評価法の開発
  自 2024年, 至 2024年
• 基盤研究(A)
  藻類オルガネラ工学による高付加価値化合物の選択的合成
  自 2024年, 至 2027年
• 基盤研究（C）
  微細藻類によるオメガ３脂肪酸の効率的生産に向けた人工染色体の構築
  自 2023年, 至 2023年
• 基盤研究(C)
  微細藻類によるオメガ３脂肪酸の効率的生産に向けた人工染色体の構築
  自 2022年, 至 2022年
• 基盤研究(B)
  藻類オルガネラ工学に基づく医薬品原料の多段階生合成プロセスの創成
  自 2021年, 至 2023年
• 基盤研究(B)
  マグネトソーム膜のin vivo改質による膜タンパク質の機能向上
  自 2020年, 至 2020年
• 基盤研究(B)
  マグネトソーム膜のin vivo改質による膜タンパク質の機能向上
  自 2019年, 至 2019年
• 基盤研究(B)
  マグネトソーム膜のin vivo改質による膜タンパク質の機能向上
  自 2018年, 至 2018年
• 基盤研究(B)
  微細藻類のオイルボディ工学による医薬品生産プロセスの開発
  自 2017年, 至 2019年
• 基盤研究(B)
  マグネトソーム膜のin vivo改質による膜タンパク質の機能向上
  自 2017年, 至 2017年
• 挑戦的萌芽研究
  オイルボディディスプレイ技術による有用物質の新規合成技術の開発
  自 2016年, 至 2017年
• 基盤研究(B)(一部基金)
  バイオシリカ工学に基づく有用珪藻の革新的な物質生産プロセスの創成
  自 2014年, 至 2016年
• 挑戦的萌芽研究
  単一細胞破砕に基づく高精度オルガネラ回収技術の開発
  自 2013年, 至 2014年
• 基盤研究(B)
  オイル高生産微細藻類スクリーニングに向けた高速イメージサイトメトリーの開発
  自 2011年, 至 2013年
• 萌芽研究
  オンチップ型フォトセンサアレイを用いた細胞プロファイリング技術の開発
  自 2008年, 至 2009年
• 若手研究(A)
  磁気ビーズを利用した膜活性ペプチドの二次構造網羅的解析技術の開発
  自 2005年, 至 2007年
• 若手研究(A)
  磁気ビーズを利用した膜活性ペプチドの二次構造網羅的解析技術の開発
  自 2005年, 至 2007年
• 特定領域研究(公募)
  有機無機複合型スピン分極ナノ粒子～マグネタイト微結晶の物性計測～
  自 2003年, 至 2006年
• 若手研究(B)
  膜貫通ペプチドを用いた膜融合型磁性担体へのタンパク質アセンブリング技術の開発
  自 2003年, 至 2004年
• 若手研究(B)
  膜貫通ペプチドを用いた膜融合型磁性担体へのタンパク質アセンブリング技術の開発
  自 2003年, 至 2004年

論文

• Establishment of a nitrate-reductase promoter-driven inducible expression system for metabolic engineering in the marine diatom Fistulifera solaris
  Tomoki Yamanaka, Takashi Yabuuchi, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Kosuke Kataoka, Tsuyoshi Tanaka
  Journal of Bioscience and Bioengineering
  Elsevier
  2025年07月07日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 140, 2, DOI(公開)(r-map), 73, 78
• Combined use of phosphorus containing calcium silicate and phosphate-solubilizing bacterium as a solid biofertilizer for sustainable soybean cultivation
  Akiko Hanada, Tomoaki Kasuga, Mana Iwamoto, Akane Mizusawa, Satoshi Murata, Tsuyoshi Aketo, Kazuya Hirata, Kosuke Kataoka, Atsushi Arakaki, Naoko Ohkama-Ohtsu, Tsuyoshi Tanaka
  Journal of Bioscience and Bioengineering
  Elsevier
  2025年07月10日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 140, 4, DOI(公開)(r-map), 211, 217
• Electroosmotic Flow-Based Nanoinjection Technique Using a Nanopipette for Green Microalgae
  Tsuyoshi Tanaka, Kaoruko Akasaka, Rein Yasui, Naoto Shinohara, Tomoko Yoshino, Daisuke Nojima, Makoto Mochizuki, Takatoshi Ohata, Fumitaka Kamachi, Tsuneji Sawai
  Marine Biotechnology
  Springer Nature
  2025年07月01日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 27, 4, DOI(公開)(r-map), 108
• Genetic Transformation of the Marine Oleaginous Microalga, Marinichlorella sp. NKG400014
  Ryota Kumakubo, Kento Sagawa, Tsuyoshi Tanaka
  Marine Biotechnology
  2025年06月05日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 27, 3, DOI(公開)(r-map), 91
• MS-DIAL 5 multimodal mass spectrometry data mining unveils lipidome complexities
  Takeda, Hiroaki; Matsuzawa, Yuki; Takeuchi, Manami; Takahashi, Mikiko; Nishida, Kozo; Harayama, Takeshi; Todoroki, Yoshimasa; Shimizu, Kuniyoshi; Sakamoto, Nami; Oka, Takaki; Maekawa, Masashi; Chung, Mi Hwa; Kurizaki, Yuto; Kiuchi, Saki; Tokiyoshi, Kanako; Buyantogtokh, Bujinlkham; Kurata, Misaki; Kvasnicka, Ales; Takeda, Ushio; Uchino, Haruki; Hasegawa, Mayu; Miyamoto, Junki; Tanabe, Kana; Takeda, Shigenori; Mori, Tetsuya; Kumakubo, Ryota; Tanaka, Tsuyoshi; Yoshino, Tomoko; Okamoto, Mami; Takahashi, Hidenori; Arita, Makoto; Tsugawa, Hiroshi
  NATURE COMMUNICATIONS
  NATURE PORTFOLIO
  Lipidomics and metabolomics communities comprise various informatics tools; however, software programs handling multimodal mass spectrometry (MS) data with structural annotations guided by the Lipidomics Standards Initiative are limited. Here, we provide MS-DIAL 5 for in-depth lipidome structural elucidation through electron-activated dissociation (EAD)-based tandem MS and determining their molecular localization through MS imaging (MSI) data using a species/tissue-specific lipidome database containing the predicted collision-cross section values. With the optimized EAD settings using 14 eV kinetic energy, the program correctly delineated lipid structures for 96.4% of authentic standards, among which 78.0% had the sn-, OH-, and/or C = C positions correctly assigned at concentrations exceeding 1 mu M. We showcased our workflow by annotating the sn- and double-bond positions of eye-specific phosphatidylcholines containing very-long-chain polyunsaturated fatty acids (VLC-PUFAs), characterized as PC n-3-VLC-PUFA/FA. Using MSI data from the eye and n-3-VLC-PUFA-supplemented HeLa cells, we identified glycerol 3-phosphate acyltransferase as an enzyme candidate responsible for incorporating n-3 VLC-PUFAs into the sn1 position of phospholipids in mammalian cells, which was confirmed using EAD-MS/MS and recombinant proteins in a cell-free system. Therefore, the MS-DIAL 5 environment, combined with optimized MS data acquisition methods, facilitates a better understanding of lipid structures and their localization, offering insights into lipid biology. Lipids are complex molecules crucial for life. The authors developed MS-DIAL 5, a tool that enhances in-depth structure elucidations and the spatial mapping of lipidome. Using advanced techniques, they uncovered new insights into the biosynthetic pathway of eye-specific phosphatidylcholines.
  2024年11月28日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 15, 1, DOI(公開)(r-map)
• PCR- and wash-free detection of serum miRNA via signaling probe hybridization
  Haruka Uno, Hiyori Takeuchi, Ishin Abe, Tomoko Yoshino, Tomoyuki Taguchi, Yuko Hirakawa, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnology and Bioengineering
  Wiley
  2024年10月13日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 122, 1, DOI(公開)(r-map), 159, 166
• Expansion of omega-3 polyunsaturated fatty acid metabolism of the oleaginous diatom Fistulifera solaris by genetic engineering
  Suhaimi, Noraiza; Kumakubo, Ryota; Yoshino, Tomoko; Maeda, Yoshiaki; Murata, Satoshi; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Omega-3 polyunsaturated fatty acids (PUFAs), such as eicosapentaenoic acid (EPA; C20:5n-3) and docosahexaenoic acid (DHA; C22:6n-3) are widely used as additives in fish feed in the aquaculture sector. To date, the supply of omega-3 PUFAs have heavily depended upon fish oil production. As the need for omega-3 PUFAs supply for the growing population increases, a more sustainable approach is required to keep up with the demand. The oleaginous diatom Fistulifera solaris is known to synthesize EPA with the highest level among autotrophically cultured microalgae, however, this species does not accumulate significant amounts of DHA, which, in some cases, is required in aquaculture rather than EPA. This is likely due to the lack of expression of essential enzymes namely A5 elongase (A5ELO) and A4 desaturase. In this study, we identified endogenous A5ELO genes in F. solaris and introduced recombinant expression cassettes harboring A5ELO into F. solaris through bacterial conjugation. As a result, it managed to induce the synthesis of docosapentaenoic acid (DPA; C22:5n-3), a direct precursor of DHA. This study paves the way for expanding our understanding of the omega-3 PUFAs pathway using endogenous genes in the oleaginous diatom. (c) 2024, The Society for Biotechnology, Japan. All rights are reserved, including those for text and data mining, AI training, and similar technologies.
  2024年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 138, 2, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 105, 110
• Anthocyanin glucosylation mediated by a glycoside hydrolase family 3 protein in purple carrot
  Koga, Shun-ya; Miyahara, Taira; Nishizaki, Yuzo; Tamura, Kotaro; Okamoto, Emi; Kawagishi, Hiroaki; Sakurai, Kaori; Kaneko, Yumika; Kumakubo, Ryota; Tanaka, Tsuyoshi; Ozeki, Yoshihiro; Sasaki, Nobuhiro
  PLANT JOURNAL
  WILEY
  Purple carrot accumulates anthocyanins modified with galactose, xylose, glucose, and sinapic acid. Most of the genes associated with anthocyanin biosynthesis have been identified, except for the glucosyltransferase genes involved in the step before the acylation in purple carrot. Anthocyanins are commonly glycosylated in reactions catalyzed by UDP-sugar-dependent glycosyltransferases (UGTs). Although many studies have been conducted on UGTs, the glucosylation of carrot anthocyanins remains unknown. Acyl-glucose-dependent glucosyltransferase activity modifying cyanidin 3-xylosylgalactoside was detected in the crude protein extract prepared from purple carrot cultured cells. In addition, the corresponding enzyme was purified. The cDNA encoding this glucosyltransferase was isolated based on the partial amino acid sequence of the purified protein. The recombinant protein produced in Nicotiana benthamiana leaves via agroinfiltration exhibited anthocyanin glucosyltransferase activity. This glucosyltransferase belongs to the glycoside hydrolase family 3 (GH3). The expression pattern of the gene encoding this GH3-type anthocyanin glucosyltransferase was consistent with anthocyanin accumulation in carrot tissues and cultured cells. Glucosylation of the purple carrot anthocyanin cyanidin 3-O-(2 ''-O-xylosyl)-(6 ''-O-sinapoylglucosyl)-galactoside is mediated by a glycoside hydrolase family 3 vacuolar enzyme that catalyzes a reaction that uses acyl-glucose as the glucosyl donor.
  2024年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 119, 4, 0960-7412, DOI(公開)(r-map), 1816, 1829
• Line image sensor-based colony fingerprinting system for rapid pathogenic bacteria identification
  Tago, Hikaru; Maeda, Yoshiaki; Tanaka, Yusuke; Kohketsu, Hiroya; Lim, Tae-Kyu; Harada, Manabu; Yoshino, Tomoko; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
  ELSEVIER ADVANCED TECHNOLOGY
  The rapid identification of pathogenic bacteria is crucial across various industries, including food or beverage manufacturing. Bacterial microcolony image-based classification has emerged as a promising approach to expedite identification, automate inspections, and reduce costs. However, conventional imaging methods have significant practical limitations, namely low throughput caused by the limited imaging range and slow imaging speed. To address these challenges, we developed an imaging system based on a line image sensor for rapid and wide-field imaging compared to existing colony imaging methods. This system can image a standard Petri dish (92 mm in diameter) completely within 22 s, successfully acquiring bacterial microcolony images. This process yielded a set of discrimination parameters termed as colony fingerprints, which were employed for machine learning. We demonstrated the performance of our system by identifying Staphylococcus aureus in food products using a machine learning model trained on a colony fingerprint dataset of 15 species from 9 genera, including foodborne pathogens. While conventional mass spectrometry-based methods require 24 h of incubation, our colony fingerprinting approach achieved 96% accuracy in just 10 h of incubation. Line image sensor offer high imaging speeds and scalability, allowing for swift and straightforward microbiological testing, eliminating the need for specialized expertise and overcoming the limitations of conventional methods. This innovation marks a transformative shift in industrial applications.
  2024年04月01日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 249, 0956-5663, DOI(公開)(r-map)
• Lipid droplets-vacuoles interaction promotes lipophagy in the oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Tanaka, Tsuyoshi; Moriya, Seiichiro; Nonoyama, Tomomi; Maeda, Yoshiaki; Kaha, Marshila; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Bowler, Chris
  ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
  ELSEVIER
  Autophagy is a highly conserved process for degrading intracellular materials in vacuoles or lysosomes, commonly found in a wide range of eukaryotes. Lipid droplets are intracellular organelles that store neutral lipids, and recent studies have shown that autophagy regulates lipid metabolism by degrading lipid droplets. While autophagy-mediated degradation of lipid droplets, called lipophagy, is recognized as one of the major lipid degradation mechanisms in eukaryotic cells, its characterization in microalgae remains incomplete. Our prior investigations established a potential connection between autophagy and lipid degradation on the oleaginous microalga (diatom) Fistulifera solaris, a candidate for microalgal biofuel production. Inhibition of lipophagy can be a promising strategy to enhance the oleaginous phenotype of this alga. However, the presence of lipophagy in this alga has not been demonstrated because the interaction between vacuoles and lipid droplets has not yet been observed. In this study, we investigated lipophagy in F. solaris by microscopy, transcriptomics, and biochemical assays. Fluorescence microscopy revealed increased vacuolar contact with lipid droplets under conditions promoting lipid degradation, and this process was hindered by autophagy inhibitors. Transmission electron microscopy showed direct fusion of vacuoles and lipid droplets, suggesting that F. solaris might have a novel type of microlipophagy. These data indicate that lipophagy may play an important role in lipid degradation in F. solaris. To our knowledge this study marks the first direct observation of lipophagy in diatoms, contributing to our understanding of lipid metabolism in this organism.
  2024年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 79, 2211-9264, DOI(公開)(r-map)
• 藻類から作るバイオ燃料
  村田 智志、 田中 剛
  化学と教育
  2024年, （MISC）総説・解説（学術雑誌）, 共同, 72, 726, DOI(公開)(r-map), 243, 246
• Lipid membrane modulated control of magnetic nanoparticles within bacterial systems
  Tomoe, Ryoto; Fujimoto, Kazushi; Tanaka, Tsuyoshi; Arakaki, Atsushi; Kisailus, David; Yoshino, Tomoko
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Bacterial magnetosomes synthesized by the magnetotactic bacterium Magnetospirillum magneticum are suitable for biomedical and biotechnological applications because of their high level of chemical purity of mineral with well-defined morphological features and a biocompatible lipid bilayer coating. However, utilizations of native magnetosomes are not sufficient for maximum effectiveness in many applications as the appropriate particle size differs. In this study, a method to control magnetosome particle size is developed for integration into targeted technological applications. The size and morphology of magnetosome crystals are highly regulated by the complex interactions of magnetosome synthesis-related genes; however, these interactions have not been fully elucidated. In contrast, previous studies have shown a positive correlation between vesicle and crystal sizes. Therefore, control of the magnetosome vesicle size is tuned by modifying the membrane lipid composition. Exogenous phospholipid synthesis pathways have been genetically introduced into M. magneticum. The experimental results show that these phospholipids altered the properties of the magnetosome membrane vesicles, which yielded larger magnetite crystal sizes. The genetic engineering approach presented in this study is shown to be useful for controlling magnetite crystal size without involving complex interactions of magnetosome synthesis-related genes.& COPY; 2023, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2023年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 136, 3, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 253, 260
• Functional analysis of the putative centromere sequences of marine oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Maeda, Yoshiaki; Nakamura, Mai; Watanabe, Kahori; Okamoto, Emi; Tanaka, Tsuyoshi
  ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
  ELSEVIER
  Trans-kingdom conjugation-based transformation with oriT-containing episomal plasmids is an emerging tech-nique to achieve genetic engineering in diatoms. The native centromeres lacking any consensus motifs and budding yeast-derived centromere/autonomous replication sequence accompanied by a histidine synthase gene (CEN6-ARSH4-HIS3) supported the plasmid maintenance in model diatoms. However, it remained elusive whether these host-vector systems are universally applicable in industrially important non-model diatom species. In this study, we found the consensus motifs in the putative centromeres of Fistulifera solaris; some exhibited characteristic dispersion patterns along the chromosomes. Furthermore, we investigated whether (1) oriT-con-taining plasmids could be transferred from the Escherichia coli strain S17-1 expressing tra genes to the oleaginous diatom F. solaris, and (2) the putative centromeres of F. solaris and yeast CEN6-ARSH4-HIS3 could support the episomal maintenance in F. solaris. As a result, transformant clones were successfully obtained through a drug-registrant selection process. PCR testing further confirmed the transfer of the plasmid sequences in the diatom. Some of the centromeres containing the consensus motifs marginally contributed to the transformation; however, the differences in terms of the transformation efficiency in the presence or absence of F. solaris-derived putative centromeres and yeast-derived CEN6-ARSH4-HIS3 were not statistically significant. The episome rescue exper-iment did not provide evidence that the transferred plasmids were maintained as episomes. These results suggest that these centromeric sequences might not be solely responsible for episomal maintenance in F. solaris.
  2023年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 74, 2211-9264, DOI(公開)(r-map)
• Characterization of oil body-associated proteins obtained from oil bodies with different sizes in oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Kaha, Marshila; Noda, Masayoshi; Maeda, Yoshiaki; Kaneko, Yumika; Yoshino, Tomoko; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Oil body-associated proteins from the oleaginous diatom Fistulifera solaris were identified by proteomic analysis of oil bodies of various sizes (small, middle, and large) by time-dependent culturing upon nutrient-starvation at 36, 96 and 168 h. This diatom strain has the capability to accumulate neutral lipids and triacylglycerol. Liquid chromatography -tandem mass spectrometry analysis revealed 662 proteins in all oil body sizes. Among these, 132 proteins were pre-dicted to be localized to the endoplasmic reticulum. Seventeen proteins that exhibited a positive correlation with gene expression and the oil body size were selected as novel candidates for oil body-associated proteins. Among the 17 protein candidates, two proteins encoded by fso:g8246 and fso:g10200 were confirmed to be localized on the surface of the oil body and endoplasmic reticulum. A protein encoded by fso:g2514, which is involved in sterol biosynthesis, was also identified. This protein was likely to localize to mitochondria; however, inhibitor assays suggested that it might play a role in lipid degradation. Our work provides new insights into the proteomics of microalgae and provides a valuable strategy for boosting lipid productivity in microalgae.(c) 2023, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2023年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 135, 5, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 359, 368
• Different Responses of Photosynthesis to Nitrogen Starvation Between Highly Oil-Accumulative Diatoms, Fistulifera solaris and Mayamaea sp. JPCC CTDA0820
  Nakayasu, Mana; Amano, Momoka; Tanaka, Tsuyoshi; Shimakawa, Ginga; Matsuda, Yusuke
  MARINE BIOTECHNOLOGY
  SPRINGER
  Highly oil-accumulative diatoms are expected to be a promising biomass for the production of biofuel. To harvest the diatom oils at high yields, it is critical to elucidate the relationship of oil accumulation with photosynthesis under fluctuating environmental conditions. Here, we characterized the physiological responses of the growth and photosynthesis in the mesophilic diatom Fistulifera solaris and the cold-tolerant one Mayamaea sp. JPCC CTDA0820 to nitrogen starvation, one of the most notable abiotic stresses, where most eukaryotic algae decrease their photosynthetic activity and accumulate oil in the cells. While F. solaris started showing growth retardation at NaNO3 levels less than 50% of a normal F/2 artificial seawater (ASW) medium, Mayamaea sp. sustained normal growth even at a NaNO3 level 10% of normal F/2ASW, indicating the sharp contrast of nitrogen requirement between these two diatom species. In the transition from 100 to 0% nitrogen conditions in the modified F/2ASW, F. solaris showed a clear suppression of chlorophyll (Chl)-based photosynthetic O-2 evolution rate and relative electron transport rate at photosystem II, which were negatively correlated to the capacity of non-photochemical quenching. Meanwhile, there was no change in these Chl-based parameters observed in nitrogen-starved Mayamaea sp. Instead, Mayamaea sp. showed a significant decrease in the Chl a amount per cells. These data suggested the occurrence of two types of photosynthetic responses to nitrogen starvation in oleaginous diatoms; that is, (1) suppression of photosynthetic activity per Chl with enhancing heat dissipation of excess light energy and (2) synchronous suppression of cellular photosynthetic activity with Chl amounts.
  2023年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 25, 2, 1436-2228, DOI(公開)(r-map), 272, 280
• Transcriptomic profiling of single circulating tumor cells provides insight into human metastatic gastric cancer
  Negishi, Ryo; Yamakawa, Hitomi; Kobayashi, Takeru; Horikawa, Mayuko; Shimoyama, Tatsu; Koizumi, Fumiaki; Sawada, Takeshi; Oboki, Keisuke; Omuro, Yasushi; Funasaka, Chikako; Kageyama, Akihiko; Kanemasa, Yusuke; Tanaka, Tsuyoshi; Matsunaga, Tadashi; Yoshino, Tomoko
  COMMUNICATIONS BIOLOGY
  NATURE PORTFOLIO
  Transcriptome analysis of circulating tumor cells (CTCs), which migrate into blood vessels from primary tumor tissues, at the single-cell level offers critical insights into the biology of metastasis and contributes to drug discovery. However, transcriptome analysis of single CTCs has only been reported for a limited number of cancer types, such as multiple myeloma, breast, hepatocellular, and prostate cancer. Herein, we report the transcriptome analysis of gastric cancer single-CTCs. We utilized an antigen-independent strategy for CTC isolation from metastatic gastric cancer patients involving a size-dependent recovery of CTCs and a single cell isolation technique. The transcriptomic profile of single-CTCs revealed that a majority of gastric CTCs had undergone epithelial-mesenchymal transition (EMT), and indicated the contribution of platelet adhesion toward EMT progression and acquisition of chemoresistance. Taken together, this study serves to employ CTC characterization to elucidate the mechanisms of chemoresistance and metastasis in gastric cancer. Ryo Negishi et al. utilize a size-dependent recovery method with gel-based cell manipulation to isolate single circulating tumor cells (CTCs) for transcriptomic analysis. They demonstrate the utility of this approach by analyzing the transcriptomic profile of CTCs from human gastric cancer patients.
  2022年01月11日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 5, 1, DOI(公開)(r-map)
• Performance evaluation of a high-throughput separation system for circulating tumor cells based on microcavity array
  Negishi, Ryo; Saito, Hyuga; Iwata, Reito; Tanaka, Tsuyoshi; Yoshino, Tomoko
  ENGINEERING IN LIFE SCIENCES
  WILEY
  Circulating tumor cells (CTCs) are widely known as useful biomarkers in the liquid biopsies of cancer patients. Although single-cell genetic analysis of CTCs is a promising diagnostic tool that can provide detailed clinical information for precision medicine, the capacity of single-CTC isolation for genetic analysis requires improvement. To overcome this problem, we previously developed a multiple single-cell encapsulation system for CTCs using hydrogel-encapsulation, which allowed for the high-throughput isolation of single CTCs. However, isolation of a single cell from adjacent cells remained difficult and often resulted in contamination by neighboring cells due to the limited resolution of the generated hydrogel. We developed a novel multiple single-cell encapsulation system equipped with a high magnification lens for high throughput and a more accurate single-cell encapsulation. The multiple single-cell encapsulation system has sufficient sensitivity to detect immune-stained CTCs, and could also generate a micro-scaled hydrogel that can isolate a single cell from adjacent cells within 10 mu m, with high efficiency. The proposed system enables high throughput and accurate single-cell manipulation and genome amplification without contamination from neighboring cells.
  2020年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 20, 11, 1618-0240, DOI(公開)(r-map), 485, 493
• Characterization of a novel marine unicellular alga, Pseudoneochloris sp. strain NKY372003 as a high carbohydrate producer
  Aketo, Tsuyoshi; Hashizume, Rina; Yabu, Yusuke; Hoshikawa, Yumiko; Nojima, Daisuke; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Takano, Hiroyuki; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Production of biofuels and fine chemicals from biomass-derived carbohydrates through biorefinery attracts much attention because it is recognized as an environmentally friendly process. Microalgae can serve as promising carbohydrate producers for biorefinery rather than woody and crop biomass due to high biomass productivity, high CO2 fixation, and no competition with food production. However, microalgae with high carbohydrate productivity have not been well investigated despite intensive studies of microalgal lipid production. In this study, the carbohydrate production of Pseudoneochloris sp. strain NKY372003 isolated as a high carbohydrate producer, was investigated. Cultivation conditions with various combinations of nutrient contents and photon flux density were examined to maximize the biomass and carbohydrate productivities. At the optimal condition, the biomass and carbohydrate production of this strain reached 8.11 +/- 0.37 g/L and 5.5 +/- 0.2 g/L, respectively. As far as we know, this is the highest carbohydrate production by microalgae among ever reported. Cell staining with Lugol's solution visualized intracellular starch granules. Because algal starch can be converted to biofuels and building blocks of fine chemicals, Pseudoneochloris sp. NKY372003 will be a promising candidate for production of fermentable carbohydrates towards biofuels and fine chemicals production. (C) 2020, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2020年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 129, 6, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 687, 692
• Selection and characterization of microalgae with potential for nutrient removal from municipal wastewater and simultaneous lipid production
  Aketo, Tsuyoshi; Hoshikawa, Yumiko; Nojima, Daisuke; Yabu, Yusuke; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Takano, Hiroyuki; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Wastewater treatment, along with the simultaneous production of valuable chemical compounds, including lipids by microalgae is a challenging but attractive study. Towards this goal, the candidate microalgae were selected from culture collections or isolated from wastewater in this study. The initial screening test using microalgae revealed that various eukaryotic as well as prokaryotic microalgae showed steady growth in municipal wastewater samples. Among them, Tetraselmis sp. NKG400013 and Parachlorella kessleri NKG021201 from culture collections, and Chloroidium saccharophilum NKH13 from the wastewater sample exhibited high biomass productivity. Furthermore, P. kessleri NKG021201 and C. saccharophilum NKH13 showed high lipid productivity (56 +/- 1 mg/L/day for NKG021201, 35 +/- 10 mg/L/day for NKH13). During this cultivation, 99% of nitrogen and 82% of phosphorous compounds were removed from the wastewater sample by the strain NKG021201. Analysis of fatty acid compositions of P. kessleri NKG021201 and C. saccharophilum NKH13 revealed that lipids derived from these microalgae were suitable for the application of bio-diesel fuels, indicating that these microalgae were promising for wastewater treatment and lipid production. (C) 2019, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2020年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 129, 5, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 565, 572
• Analysis of UV irradiation -induced cell settling of an oleaginous diatom, Fistulifera solaris , for efficient biomass recovery
  Arakaki, Atsushi; Matsumoto, Takuya; Shimura, Nobumitsu; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Kisailus, David; Tanaka, Tsuyoshi
  ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
  ELSEVIER
  2020年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 47, 2211-9264, DOI(公開)(r-map)
• Rapid discrimination of fungal species by the colony fingerprinting
  Maeda, Yoshiaki; Sugiyama, Yui; Lim, Tae-Kyu; Harada, Manabu; Yoshino, Tomoko; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
  ELSEVIER ADVANCED TECHNOLOGY
  The contamination of foods and beverages by fungi is a severe health hazard. The rapid identification of fungi species in contaminated goods is important to avoid further contamination. To this end, we developed a fungal discrimination method based on the bioimage informatics approach of colony fingerprinting. This method involves imaging and visualizing microbial colonies (referred to as colony fingerprints) using a lens-less imaging system. Subsequently, the quantitative image features were extracted as discriminative parameters and subjected to analysis using machine learning approaches. Colony fingerprinting has been previously found to be a promising approach to discriminate bacteria. In the present proof-of-concept study, we tested whether this method is also useful for fungal discrimination. As a result, 5 fungi belonging to the Aspergillus, Peniciliwn, Eurottum, Alternaria, and Fusarium genera were successfully discriminated based on the extracted parameters, including the number of hyphae and their branches, and their intensity distributions on the images. The discrimination of 6 closely-related Aspergillus spp. was also demonstrated using additional parameters. The cultivation time required to generate the fungal colonies with a sufficient size for colony fingerprinting was less than 48 h, shorter than those for other discrimination methods, including MALDI-TOF-MS. In addition, colony fingerprinting did not require any cumbersome pre-treatment steps prior to discrimination. Colony fingerprinting is promising for the rapid and easy discrimination of fungi for use in the ensuring the safety of food manufacturing.
  2019年12月15日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 146, 0956-5663, DOI(公開)(r-map)
• Proteomics analysis of lipid droplets indicates involvement of membrane trafficking proteins in lipid droplet breakdown in the oleaginous diatom Fistulifera solaris
  Nonoyama, Tomomi; Nojima, Daisuke; Maeda, Yoshiaki; Noda, Masayoshi; Yoshino, Tomoko; Matsumoto, Mitsufumi; Bowler, Chris; Tanaka, Tsuyoshi
  ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS
  ELSEVIER
  Microalgae store triacylglycerol (TAG) in a specialized intracellular compartment called the lipid droplet. Its dynamics are believed to be controlled by various lipid droplet-associated proteins, although studies of micro-algal lipid droplet-associated proteins are still limited. In the present study, proteomics analysis was carried out to identify novel lipid droplet-associated protein candidates in the oleaginous marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580. Lipid droplets were extracted from diatom cells, followed by washing with urea solution to decrease contaminants. Subsequently, proteins were identified from the urea-treated lipid droplet fraction. Comparisons between the present study and previous proteomic research on other microalgae revealed that the lipid droplet fraction extracted from diverse microalgae commonly contained membrane trafficking-related proteins such as vesicle coat proteins and heat shock proteins, some of which could potentially be involved in autophagy. Autophagy is known to degrade lipid droplets in other organisms (i.e. mammalian cells and yeasts), and this process is termed lipophagy. Thus, the membrane trafficking-related proteins which were detected from the proteome in this study might play a role in TAG hydrolysis via lipophagy. In order to confirm this hypothesis, we utilized inhibitors of membrane trafficking-related proteins and lipophagy. The addition of the inhibitors to F. solaris during lipid droplet breakdown suppressed TAG hydrolysis, supporting the idea that lipophagy may participate in TAG hydrolysis in F. solaris. The phenomenon was also observed in another model pennate diatom, Phaeodactylum tricornutum, implying that lipophagy-mediated lipid droplet breakdown could be a common feature, at least in pennate diatoms. These findings shed light on novel aspects of lipid metabolism in microalgae, and this can be applied to new approaches for increasing the oil productivity of biofuel production using microalgae in the future.
  2019年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 44, 2211-9264, DOI(公開)(r-map)
• Genome analysis and genetic transformation of a water surface-floating microalga Chlorococcum sp. FFG039
  Maeda, Yoshiaki; Nojima, Daisuke; Sakurai, Miki; Nomaguchi, Tatsuhiro; Ichikawa, Momoko; Ishizuka, Yuki; Tanaka, Tsuyoshi
  SCIENTIFIC REPORTS
  NATURE PUBLISHING GROUP
  Microalgal harvesting and dewatering are the main bottlenecks that need to be overcome to tap the potential of microalgae for production of valuable compounds. Water surface-floating microalgae form robust biofilms, float on the water surface along with gas bubbles entrapped under the biofilms, and have great potential to overcome these bottlenecks. However, little is known about the molecular mechanisms involved in the water surface-floating phenotype. In the present study, we analysed the genome sequence of a water surface-floating microalga Chlorococcum sp. FFG039, with a next generation sequencing technique to elucidate the underlying mechanisms. Comparative genomics study with Chlorococcum sp. FFG039 and other non-floating green microalgae revealed some of the unique gene families belonging to this floating microalga, which may be involved in biofilm formation. Furthermore, genetic transformation of this microalga was achieved with an electroporation method. The genome information and transformation techniques presented in this study will be useful to obtain molecular insights into the water surface-floating phenotype of Chlorococcum sp. FFG039.
  2019年08月01日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, 2045-2322, DOI(公開)(r-map)
• Metabolic Innovations Underpinning the Origin and Diversification of the Diatom Chloroplast
  Nonoyama, Tomomi; Kazamia, Elena; Nawaly, Hermanus; Gao, Xia; Tsuji, Yoshinori; Matsuda, Yusuke; Bowler, Chris; Tanaka, Tsuyoshi; Dorrell, Richard G.
  BIOMOLECULES
  MDPI
  Of all the eukaryotic algal groups, diatoms make the most substantial contributions to photosynthesis in the contemporary ocean. Understanding the biological innovations that have occurred in the diatom chloroplast may provide us with explanations to the ecological success of this lineage and clues as to how best to exploit the biology of these organisms for biotechnology. In this paper, we use multi-species transcriptome datasets to compare chloroplast metabolism pathways in diatoms to other algal lineages. We identify possible diatom-specific innovations in chloroplast metabolism, including the completion of tocopherol synthesis via a chloroplast-targeted tocopherol cyclase, a complete chloroplast ornithine cycle, and chloroplast-targeted proteins involved in iron acquisition and CO2 concentration not shared between diatoms and their closest relatives in the stramenopiles. We additionally present a detailed investigation of the chloroplast metabolism of the oil-producing diatom Fistulifera solaris, which is of industrial interest for biofuel production. These include modified amino acid and pyruvate hub metabolism that might enhance acetyl-coA production for chloroplast lipid biosynthesis and the presence of a chloroplast-localised squalene synthesis pathway unknown in other diatoms. Our data provides valuable insights into the biological adaptations underpinning an ecologically critical lineage, and how chloroplast metabolism can change even at a species level in extant algae.
  2019年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, 8, DOI(公開)(r-map)
• Taming chlorophylls by early eukaryotes underpinned algal interactions and the diversification of the eukaryotes on the oxygenated Earth
  Kashiyama, Yuichiro; Yokoyama, Akiko; Shiratori, Takashi; Hess, Sebastian; Not, Fabrice; Bachy, Charles; Gutierrez-Rodriguez, Andres; Kawahara, Jun; Suzaki, Toshinobu; Nakazawa, Masami; Ishikawa, Takahiro; Maruyama, Moe; Wang, Mengyun; Chen, Man; Gong, Yingchun; Seto, Kensuke; Kagami, Maiko; Hamamoto, Yoko; Honda, Daiske; Umetani, Takahiro; Shihongi, Akira; Kayama, Motoki; Matsuda, Toshiki; Taira, Junya; Yabuki, Akinori; Tsuchiya, Masashi; Hirakawa, Yoshihisa; Kawaguchi, Akane; Nomura, Mami; Nakamura, Atsushi; Namba, Noriaki; Matsumoto, Mitsufumi; Tanaka, Tsuyoshi; Yoshino, Tomoko; Higuchi, Rina; Yamamoto, Akihiro; Maruyama, Tadanobu; Yamaguchi, Aika; Uzuka, Akihiro; Miyagishima, Shinya; Tanifuji, Goro; Kawachi, Masanobu; Kinoshita, Yusuke; Tamiaki, Hitoshi
  ISME JOURNAL
  NATURE PUBLISHING GROUP
  Extant eukaryote ecology is primarily sustained by oxygenic photosynthesis, in which chlorophylls play essential roles. The exceptional photosensitivity of chlorophylls allows them to harvest solar energy for photosynthesis, but on the other hand, they also generate cytotoxic reactive oxygen species. A risk of such phototoxicity of the chlorophyll must become particularly prominent upon dynamic cellular interactions that potentially disrupt the mechanisms that are designed to quench photoexcited chlorophylls in the phototrophic cells. Extensive examination of a wide variety of phagotrophic, parasitic, and phototrophic microeukaryotes demonstrates that a catabolic process that converts chlorophylls into nonphotosensitive 13(2),17(3)-cyclopheophorbide enols (CPEs) is phylogenetically ubiquitous among extant eukaryotes. The accumulation of CPEs is identified in phagotrophic algivores belonging to virtually all major eukaryotic assemblages with the exception of Archaeplastida, in which no algivorous species have been reported. In addition, accumulation of CPEs is revealed to be common among phototrophic microeukaryotes (i.e., microalgae) along with dismantling of their secondary chloroplasts. Thus, we infer that CPE-accumulating chlorophyll catabolism (CACC) primarily evolved among algivorous microeukaryotes to detoxify chlorophylls in an early stage of their evolution. Subsequently, it also underpinned photosynthetic endosymbiosis by securing close interactions with photosynthetic machinery containing abundant chlorophylls, which led to the acquisition of secondary chloroplasts. Our results strongly suggest that CACC, which allowed the consumption of oxygenic primary producers, ultimately permitted the successful radiation of the eukaryotes throughout and after the late Proterozoic global oxygenation.
  2019年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 13, 8, 1751-7362, DOI(公開)(r-map), 1899, 1910
• Gel-based cell manipulation method for isolation and genotyping of single-adherent cells
  Negishi, Ryo; Iwata, Reito; Tanaka, Tsuyoshi; Kisailus, David; Maeda, Yoshiaki; Matsunaga, Tadashi; Yoshino, Tomoko
  ANALYST
  ROYAL SOC CHEMISTRY
  Genetic analysis of single-cells is widely recognized as a powerful tool for understanding cellular heterogeneity and obtaining genetic information from rare populations. Recently, many kinds of single-cell isolation systems have been developed to facilitate single-cell genetic analysis. However, these systems mainly target non-adherent cells or cells in a cell suspension. Thus, it is still challenging to isolate single-adherent cells of interest from a culture dish using a microscope. We had previously developed a single-cell isolation technique termed ”gel-based cell manipulation” (GCM). In GCM, single-cells could be visualized by photopolymerizable-hydrogel encapsulation that made it easier to isolate the single-cells. In this study, GCM-based isolation of single-adherent cancer cells from a culture dish was demonstrated. Single-adherent cells were encapsulated in a photopolymerizable hydrogel using a microscope and isolated with high efficiency. Furthermore, whole genome amplification and sequencing for the isolated single-adherent cell could be achieved. We propose that the GCM-based approach demonstrated in this study has the potential for efficient analysis of single-adherent cells at the genetic level.
  2019年02月07日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 144, 3, 0003-2654, DOI(公開)(r-map), 990, 996
• Colony Fingerprint-Based Discrimination of Staphylococcus species with Machine Learning Approaches
  Maeda, Yoshiaki; Sugiyama, Yui; Kogiso, Atsushi; Lim, Tae-Kyu; Harada, Manabu; Yoshino, Tomoko; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  SENSORS
  MDPI
  Detection and discrimination of bacteria are crucial in a wide range of industries, including clinical testing, and food and beverage production. Staphylococcus species cause various diseases, and are frequently detected in clinical specimens and food products. In particular, S. aureus is well known to be the most pathogenic species. Conventional phenotypic and genotypic methods for discrimination of Staphylococcus spp. are time-consuming and labor-intensive. To address this issue, in the present study, we applied a novel discrimination methodology called colony fingerprinting. Colony fingerprinting discriminates bacterial species based on the multivariate analysis of the images of microcolonies (referred to as colony fingerprints) with a size of up to 250 mu m in diameter. The colony fingerprints were obtained via a lens-less imaging system. Profiling of the colony fingerprints of five Staphylococcus spp. (S. aureus, S. epidermidis, S. haemolyticus, S. saprophyticus, and S. simulans) revealed that the central regions of the colony fingerprints showed species-specific patterns. We developed 14 discriminative parameters, some of which highlight the features of the central regions, and analyzed them by several machine learning approaches. As a result, artificial neural network (ANN), support vector machine (SVM), and random forest (RF) showed high performance for discrimination of theses bacteria. Bacterial discrimination by colony fingerprinting can be performed within 11 h, on average, and therefore can cut discrimination time in half compared to conventional methods. Moreover, we also successfully demonstrated discrimination of S. aureus in a mixed culture with Pseudomonas aeruginosa. These results suggest that colony fingerprinting is useful for discrimination of Staphylococcus spp.
  2018年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 18, 9, 1424-8220, DOI(公開)(r-map)
• High-Throughput Manipulation of Circulating Tumor Cells Using a Multiple Single-Cell Encapsulation System with a Digital Micromirror Device
  Negishi, Ryo; Takai, Kaori; Tanaka, Tsuyoshi; Matsunaga, Tadashi; Yoshino, Tomoko
  ANALYTICAL CHEMISTRY
  AMER CHEMICAL SOC
  Circulating tumor cells (CTCs) are potential precursors of metastatic cancer, and genomic information obtained from CTCs have the potential to provide new insights into the biology of cancer metastasis. We previously developed a technique for single-cell manipulation based on the encapsulation of a single cell in a photopolymerized hydrogel that can be used for subsequent genetic analysis. However, this technique has limitations in terms of throughput because light irradiation must be performed on each individual cell from the confocal laser-scanning microscopy. Here, we present a high-throughput cell manipulation technique using a multiple single-cell encapsulation system with a digital micromirror device. This system enables rapid cell imaging within a microcavity array, a microfilter for the recovery of CTCs from blood samples, as well as the simultaneous encapsulation of several CTCs with hydrogels photopolymerized using a multiple light-irradiation system. Furthermore, single-cell labeling using two differently shaped hydrogels was examined to distinguish between NCI-H1975 cells and A549 cells, demonstrating the utility of the system for single-cell gene mutation analysis. In addition to CTCs, our system can be widely applied for analyses of mammalian cells and microorganisms.
  2018年08月21日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 90, 16, 0003-2700, DOI(公開)(r-map), 9734, 9741
• Comprehensive analysis of triacylglycerol lipases in the oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 with transcriptomics under lipid degradation
  Nomaguchi, Tatsuhiro; Maeda, Yoshiaki; Liang, Yue; Yoshino, Tomoko; Asahi, Toru; Tanaka, Tsuyoshi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  Microalgal biofuels are desirable alternatives for traditional liquid fuels, but further improvements of productivity are necessary for microalgal biofuels to be economically feasible. As strategies for improving lipid productivity, repression of lipid degradation has a great potential because the lipid accumulation level is determined by a balance between lipid synthesis and degradation. However, studies of lipid degradation and its primary functioning enzyme triacylglycerol (TAG) lipases in microalgae are currently limited. In this study, we report the comprehensive analysis of TAG lipases in the oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580. First, we confirmed that TAGs in the lipid accumulation organelles, oil bodies, were degraded when the cells were transferred from the nutrient depleted conditions to nutrient replete condition. Further analysis revealed that, after eicosapentaenoic acid (C20:5n-3)-containing TAGs are were degraded, its molecular skeletons were likely to be recycled to produce glycolipids and phospholipids for chloroplast regeneration and cell growth, respectively. Next, we searched putative TAG lipase genes from the draft genome sequence of F. solaris, and discovered 42 candidates based on the amino acid sequence homology analysis. Subsequent transcriptome analysis revealed that 16 of the 42 lipase genes were up-regulated during lipid degradation. Among the up-regulated lipases, a number of enzymes were predicted to localize in endoplasmic reticulum which is closely associated to the lipid accumulation organelles, oil bodies. Our study provided new insights of lipid degradation in oleaginous microalgae, and putative TAG lipases which could be candidates for metabolic engineering in future study to improve microalgal lipid productivity. (C) 2018, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2018年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 126, 2, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 258, 265
• Integrated molecular analysis of the inactivation of a non-enveloped virus, feline calicivirus, by UV-C radiation
  Tanaka, Tsuyoshi; Nogariya, Osamu; Shionoiri, Nozomi; Maeda, Yoshiaki; Arakaki, Atsushi
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
  SOC BIOSCIENCE BIOENGINEERING JAPAN
  UV-C treatment has been shown to be a powerful way to inactivate non-enveloped viruses in water samples. However, little is known about how the viruses were inactivated by UV-C radiation. In this study, we investigated the inactivation mechanism of a single-stranded RNA (ssRNA) non-enveloped virus, feline calicivirus (FCV), as a surrogate for the human norovirus, using UV-C radiation with different wavelengths. Integrated molecular analyses using RT-qPCR, sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE), and mass spectrometry were employed to evaluate the extent of ssRNA genome and protein degradation. UV-C radiation of FCV efficiently impaired the infectivity of FCV in mammalian cells. We also identified degradation of the RNA genome, whose copy numbers decreased from 48% to 56% following UV255 or UV281 radiation. Significant degradation of capsid protein was not observed, whereas oxidation of amino acid residues in the major capsid protein VP-1 was determined. Our results suggest that damage to the RNA genome is primarily responsible for the observed decrease in FCV infectivity of CRFK cells. This study provides not only relevant baseline data but also an overview and possible mechanism for the disinfection of non-enveloped ssRNA viruses using UV-C radiation. (C) 2018, The Society for Biotechnology, Japan. All rights reserved.
  2018年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 126, 1, 1389-1723, DOI(公開)(r-map), 63, 68
• Homoeolog expression bias in allopolyploid oleaginous marine diatom Fistulifera solaris
  Nomaguchi, Tatsuhiro; Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Asahi, Toru; Tirichine, Leila; Bowler, Chris; Tanaka, Tsuyoshi
  BMC GENOMICS
  BMC
  Background: Allopolyploidy is a genomic structure wherein two or more sets of chromosomes derived from divergent parental species coexist within an organism. It is a prevalent genomic configuration in plants, as an important source of genetic variation, and also frequently confers environmental adaptability and increased crop productivity. We previously reported the oleaginous marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 to be a promising host for biofuel production and that its genome is allopolyploid, which had never previously been reported in eukaryotic microalgae. However, the study of allopolyploidy in F. solaris was hindered by the difficulty in classifying the homoeologous genes based on their progenitor origins, owing to the shortage of diatom genomic references. Results: In this study, the allopolyploid genome of F. solaris was tentatively classified into two pseudo-parental subgenomes using sequence analysis based on GC content and codon frequency in each homoeologous gene pair. This approach clearly separated the genome into two distinct fractions, subgenome Fso_h and Fso_l, which also showed the potency of codon usage analysis to differentiate the allopolyploid subgenome. Subsequent homoeolog expression bias analysis revealed that, although both subgenomes appear to contribute to global transcription, there were subgenomic preferences in approximately 61% of homoeologous gene pairs, and the majority of these genes showed continuous bias towards a specific subgenome during lipid accumulation. Additional promoter analysis indicated the possibility of promoter motifs involved in biased transcription of homoeologous genes. Among these subgenomic preferences, genes involved in lipid metabolic pathways showed interesting patterns in that biosynthetic and degradative pathways showed opposite subgenomic preferences, suggesting the possibility that the oleaginous characteristics of F. solaris derived from one of its progenitors. Conclusions: We report the detailed genomic structure and expression patterns in the allopolyploid eukaryotic microalga F. solaris. The allele-specific patterns reported may contribute to the oleaginous characteristics of F. solaris and also suggest the robust oleaginous characteristics of one of its progenitors. Our data reveal novel aspects of allopolyploidy in a diatom that is not only important for evolutionary studies but may also be advantageous for biofuel production in microalgae.
  2018年05月04日, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 19, 1471-2164, DOI(公開)(r-map)
• Biosynthesis of Thermoresponsive Magnetic Nanoparticles by Magnetosome Display
  Yoshino, Tomoko; Shimada, Takumi; Ito, Yasuhito; Honda, Toru; Maeda, Yoshiaki; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  BIOCONJUGATE CHEMISTRY
  AMER CHEMICAL SOC
  Thermoresponsive magnetic nanoparticles (MNPs) were synthesized using a magnetosome display system. An elastin-like polypeptide decamer of VPGVG (ELP10), which is hydrophobic above the transition temperature (T-t) and can form an insoluble aggregation, was immobilized on biogenic MNPs in the magnetotactic bacterium, Magnetospirillum magneticum AMB-1. It was suggested that hydrophobicity of the MNP surface increased at 60 degrees C compared with 20 degrees C by the immobilization of ELP10. Size distribution analysis indicated that the immobilization of ELP10 onto MNPs induced the increased hydrophobicity with increasing temperatures up to 60 degrees C, promoting aggregation of the particles by hydrophobic and magnetic interactions. These results suggest that the acceleration of magnetic collection at 60 degrees C was caused by particle aggregation promoted by hydrophobic interaction between ELP-MNPs. Furthermore, the immobilization of ELP on MNPs gave a quick magnetic collection at 60 degrees C by external magnetic field. The thermoresponsive properties will further expand the utility of biotechnological applications of biogenic MNPs.
  2018年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 29, 5, 1043-1802, DOI(公開)(r-map), 1756, 1762
• Marine microalgae for production of biofuels and chemicals
  Maeda, Yoshiaki; Yoshino, Tomoko; Matsunaga, Tadashi; Matsumoto, Mitsufumi; Tanaka, Tsuyoshi
  CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY
  CURRENT BIOLOGY LTD
  Marine microalgae are recognized as promising feedstocks for biofuels and chemicals owing to their higher growth rates than those of terrestrial crop plants. We aimed to summarize the production of biofuels and chemicals by marine microalgae and to discuss their advantages and potential from the aspect of bioprocess. The present circumstances of the microalgae industry were briefly described and large-scale industrial plants for microalgae production, where some marine microalgae are cultivated, were introduced. The advantages of marine microalgae in terms of water and land usage were also discussed. Finally, novel genome editing tools that could further exploit the potential of marine microalgae were reviewed. The present study provided comprehensive information regarding current biotechnology using marine microalgae.
  2018年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 50, 0958-1669, DOI(公開)(r-map), 111, 120
• Production of Eicosapentaenoic Acid by High Cell Density Cultivation of the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  Tsuyoshi Tanaka, Takashi Yabuuchi, Yoshiaki Maeda, Daisuke Nojima, Mitsufumi Matsumoto, Tomoko Yoshino
  Bioresour. Technol.
  2017年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 245, 567, 572
• UV-C Irradiation Accelerates Neutral Lipid Synthesis in the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  Atsushi Arakaki, Takuya Matsumoto, Takuma Tateishi, Mitsufumi Matsumoto, Daisuke Nojima, Yoshino Tomoko, Tsuyoshi Tanaka
  Bioresour. Technol.
  2017年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 245, 1520, 1526
• A Role for the Cell-Wall Protein Silacidin in Cell Size of the Diatom Thalassiosira pseudonana
  Amy Kirkham, Patrick Richthammer, Katrin Schmidt, Martin Wustman, Yoshiaki Maeda, Rene Hedrich, Eike Brunner, Karl-Heinz van Pee, Angela Falciatore, Tsuyoshi Tanaka, Thomas Mock
  ISME J.
  2017年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 11, 2452, 2464
• Production of omega 3 fatty acids in marine cyanobacterium Synechococcus sp strain NKBG 15041c via genetic engineering
  Yoshino, Tomoko; Kakunaka, Natsumi; Liang, Yue; Ito, Yasuhito; Maeda, Yoshiaki; Nomaguchi, Tatsuhiro; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  SPRINGER
  Omega-3 fatty acids (omega 3 FAs) have attracted attention because they have various health benefits for humans. Fish oils are currently major sources of omega 3 FAs, but a sustainable supply of omega 3 FAs based on fish oils is problematic because of the increasing demand. In this study, the production potential of a genetically engineered marine cyanobacterium, Synechococcus sp. strain NKBG 15041c, was examined as an alternative source of omega 3 FAs. A change in fatty acid composition of this cyanobacterium was successfully induced by the expression of a heterologous Delta 6-desaturase, and the transformants synthesized stearidonic acid, which the wild type cannot produce. As a result of optimization of culture conditions, maximal contents of stearidonic acid and total omega 3 FAs reached 12.2 +/- 2.4 and 118.1 +/- 3.5 mg/g, respectively. The maximal omega 3 FA productivity was 4.6 +/- 0.7 mg/(Lai...day). These are the highest values of the contents of stearidonic acid and omega 3 FAs in genetically engineered cyanobacteria reported thus far. Therefore, genetically engineered Synechococcus sp. strain NKBG 15041c may be a promising sustainable source of omega 3 fatty acids.
  2017年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 101, 18, 0175-7598, DOI(公開)(r-map), 6899, 6905
• Structure and properties of oil bodies in diatoms
  Maeda, Yoshiaki; Nojima, Daisuke; Yoshino, Tomoko; Tanaka, Tsuyoshi
  PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES
  ROYAL SOC
  Diatoms accumulate triacylglycerols in spherical organelles called oil bodies when exposed to nutrient deprivation conditions. Oil body biology in diatoms has attracted significant attention due to the complexity of the intracellular organelles and the unique combination of genes generated by the evolutionary history of secondary endosymbiosis. The demand for biofuel production has further increased the interest in and importance of a better understanding of oil body biology in diatoms, because it could provide targets for genetic engineering to further enhance their promising lipid accumulation. This review describes recent progress in studies of the structure and properties of diatom oil bodies. Firstly, the general features of diatom oil bodies are described, in particular, their number, size and morphology, as well as the quantity and quality of lipids they contain. Subsequently, the diatom oil body-associated proteins, which were recently discovered through oil body proteomics, are introduced. Then, the metabolic pathways responsible for the biogenesis and degradation of diatom oil bodies are summarized. During biogenesis and degradation, oil bodies interact with other organelles, including chloroplasts, the endoplasmic reticulum and mitochondria, suggesting their dynamic nature in response to environmental changes. Finally, the functions of oil bodies in diatoms are discussed. This article is part of the themed issue 'The peculiar carbon metabolism in diatoms'.
  2017年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 372, 1728, 0962-8436, DOI(公開)(r-map)
• Production of ω3 Fatty Acids in Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG 15041c via Genetic Engineering
  Tomoko Yoshino, Natsumi Kakunaka, Yue Liang, Yasuhito Ito, Yoshiaki Maeda, Tatsuhiro Nomaguchi, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Appl. Microbiol. Biotechnol.
  2017年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 101, 6899, 6905
• Utilization of Diatom Frustules for Thermal Management Applications
  Hirotaka Maeda, Mitsufumi Matsumoto, Yoshiaki Maeda, Yosuke Egashira, Tsuyoshi Tanaka, Toshihiro Kasuga
  J. Appl. Phycol.
  2017年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 29, 1907, 1911
• Rapid Imaging and Detection of Circulating Tumor Cells Using a Wide-Field Fluorescence Imaging System
  Tomoko Yoshino, Kaori Takai, Ryo Negishi, Tatsuya Saeki, Hisashige Kanbara, Yoshihito Kikuhara, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Anal. Chim. Acta
  2017年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 969, 1, 7
• Enhancement of Biomass and Lipid Productivities of Water Surface-Floating Microalgae by Chemical Mutagenesis
  Nojima, Daisuke; Ishizuka, Yuki; Muto, Masaki; Ujiro, Asuka; Kodama, Fumito; Yoshino, Tomoko; Maeda, Yoshiaki; Matsunaga, Tadashi; Tanaka, Tsuyoshi
  MARINE DRUGS
  MDPI AG
  Water surface-floating microalgae have great potential for biofuel applications due to the ease of the harvesting process, which is one of the most problematic steps in conventional microalgal biofuel production. We have collected promising water surface-floating microalgae and characterized their capacity for biomass and lipid production. In this study, we performed chemical mutagenesis of two water surface-floating microalgae to elevate productivity. Floating microalgal strains AVFF007 and FFG039 (tentatively identified as Botryosphaerella sp. and Chlorococcum sp., respectively) were exposed to ethyl methane sulfonate (EMS) or 1-methyl-3-nitro-1-nitrosoguanidine (MNNG), and pale green mutants (PMs) were obtained. The most promising FFG039 PM formed robust biofilms on the surface of the culture medium, similar to those formed by wild type strains, and it exhibited 1.7-fold and 1.9-fold higher biomass and lipid productivities than those of the wild type. This study indicates that the chemical mutation strategy improves the lipid productivity of water surface-floating microalgae without inhibiting biofilm formation and floating ability.
  2017年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 15, 6, 1660-3397, DOI(公開)(r-map)
• Lipid droplet-associated proteins in diverse microalgae revealed by proteomic analysis
  Daisuke Nojima, Tomomi Nonoyama, Tsuyoshi Tanaka
  Perspectives in Phycology
  2017年05月, 共同, 4, 25, 32
• Colony Fingerprint for Discrimination of Microbial Species based on Lensless Imaging of Microcolonies
  Yoshiaki Maeda, Hironori Dobashi, Yui Sugiyama, Tatsuya Saeki, Tae-kyu Lim, Manabu Harada, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  PLoS One
  2017年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, e0174723
• Enhanced NADPH Production in the Pentose Phosphate Pathway Accelerates Lipid Accumulation in the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  Kyoko Osada, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Daisuke Nojima, Chris Bowler, Tsuyoshi Tanaka
  Algal Res.
  2017年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 23, 126, 134
• Outdoor Cultivation of Marine Diatoms for Year-Round Production of Biofuels
  Mitsufumi Matsumoto, Daisuke Nojima, Tomomi Nonoyama, Kiichi Ikeda, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2017年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 15, 94
• Evaluation of cancer cell deformability by microcavity array
  Yoshino, Tomoko; Tanaka, Tsuyoshi; Nakamura, Seita; Negishi, Ryo; Shionoiri, Nozomi; Hosokawa, Masahito; Matsunaga, Tadashi
  ANALYTICAL BIOCHEMISTRY
  ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE
  A cell entrapment device consisting of a microcavity array was used to analyze the deformability of MCF-10 human breast epithelial and MCF-7 human breast cancer cell lines by confocal laser scanning microscopy. Entrapment of up to 8 x 10(3) cells was achieved within 3 min. Protrusions were formed at the bottom surface of the array with a pore size of 3 mu m. Protrusion length increased at higher filtration pressures and could be used to distinguish between MCF-7 and MCF-10 cells. These results indicate that our system is useful for high-throughput deformability analysis of cancer cells, which can provide insight into the mechanisms underlying tumor cell malignancy. (C) 2017 Elsevier Inc. All rights reserved.
  2017年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 520, 0003-2697, DOI(公開)(r-map), 16, 21
• Potential of Water Surface-Floating Microalgae for Biodiesel Production: Floating-Biomass and Lipid Productivities
  Masaki Muto, Daisuke Nojima, Liang Yue, Hideyuki Kanehara, Hideaki Naruse, Asuka Ujiro, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  J. Biosci. Bioeng.
  2017年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 123, 314, 318
• エリアイメージセンサの遺伝子・細胞診断への応用
  田中剛、小木曽淳
  化学工業
  2017年02月, 共同, 68, 2, 107, 112
• 海洋微細藻類によるグリーンオイル生産における屋外大量培養技術開
  松本光史、野島大祐、田中　剛
  バイオインダストリー
  2016年07月, 共同, 33, 7, 10, 17
• Manipulation of a Single Circulating Tumor Cell Using Visualization of Hydrogel Encapsulation toward Single-Cell Whole-Genome Amplification
  Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka, Seita Nakamura, Ryo Negishi, Masahito Hosokawa, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chem.
  2016年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 88, 7230, 7237
• Enhancement of Nutrient Recovery from Microalgae in Hydrothermal Liquefaction Using Activated Carbon
  Chihiro Fushimi, Mai Kakimura, Ryo Tomita, Akihito Umeda, Tsuyoshi Tanaka
  Fuel Process. Technol.
  2016年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 148, 282, 288
• Bacterial Inactivation by Applying an Alternating Electromagnetic Field Using PAMAM Dendron-modified Magnetic Nanoparticles
  Atsushi Arakaki, Mami Takahashi, Masahito Hosokawa, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Electrochemistry
  2016年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 84, 324, 327
• DNA recovery from a single bacterial cell using charge-reversible magnetic nanoparticles
  Yoshiaki Maeda, Takahiro Toyoda, Takeyuki Mogi, Tomoyuki Taguchi, Takeo Tanaami, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Colloids Surf. B: Biointerfaces.
  2016年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 139, 117, 122
• Peptide-mediated microalgae harvesting method for efficient biofuel production
  Yoshiaki Maeda, Takuma Tateishi, Yuta Niwa, Masaki Muto, Tomoko Yoshino, David Kisailus, Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnol. Biofuels
  2016年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, 10
• Stoichiometrically Controlled Immobilization of Multiple Enzymes on Magnetic Nanoparticles by the Magnetosome Display System for Efficient Cellulose Hydrolysis
  Toru Honda, Tsuyoshi Tanaka, Tomoko Yoshino
  Biomacromolecules
  2015年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 16, 3863, 3868
• Evaluation of a Microbial Sensor as a Tool for Antimicrobial Activity Test of Cosmetic Preservatives
  Hideyuki Gomyo, Masaki Ookawa, Kota Oshibuchi, Yuriko Sugamura, Masahito Hosokawa, Nozomi Shionoiri, Yoshiaki Maeda, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Biocontrol Sci.
  2015年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 20, 247, 253
• Dynamic Oil Body Generation in the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris in Response to Nutrient Limitation as Revealed by Morphological and Lipidomic Analysis
  Yue Liang, Kyoko Osada, Yoshihiko Sunaga, Tomoko Yoshino, Chris Bowler, Tsuyoshi Tanaka
  Algal Res.
  2015年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 359, 367
• ２次元フォトセンサを用いた遺伝子診断・細胞診断用バイオセンシングシステムの開発
  田中　剛
  化学センサ
  2015年06月, 共同, 31, 2, 54, 60
• DNA Recovery from a Single Bacterial Cell Based on Electrostatic Interaction Using Amine Dendron-modified Magnetic Nanoparticles
  Yoshiaki Maeda, Takahiro Toyoda, Masayoshi Tanaka, Takeyuki Mogi, Tomoyuki Taguchi, Takeo Tanaami, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Electrochim. Acta
  2015年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 168, 308, 312
• Development of the Automated Circulating Tumor Cell Recovery System with Microcavity Array
  Ryo Negishi, Masahito Hosokawa, Seita Nakamura, Hisashige Kanbara, Masafumi Kanetomo, Yoshihito Kikuhara, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Biosens. Bioelectron.
  2015年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 67, 438, 442
• Simple and Rapid CD4 Testing Based on Large-field Imaging System Composed of Microcavity Array and Two-dimensional Photosensor
  Tatsuya Saeki, Yuriko Sugamura, Masahito Hosokawa, Tomoko Yoshino, Tae-kyu Lim, Manabu Harada, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Biosens. Bioelectron.
  2015年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 67, 350, 355
• Novel Designs of Single-chain MHC I/peptide Complex for the Magnetosome Display System
  Toru Honda, Yoshiaki Maeda, Takayuki Yasuda, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Protein Eng. Des. Sel.
  2015年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 28, 53, 58
• Functional Expression of Full-Length TrkA in the Prokaryotic Host Magnetospirillum magneticum AMB-1 by Using a Magnetosome Display System
  Toru Honda, Takayuki Yasuda, Tsuyoshi Tanaka, Koji Hagiwara, Tohru Arai, Tomoko Yoshino
  Appl. Environ. Microbiol.
  2015年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 81, 1472, 1476
• Alkane Production by the Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. NKBG15041c Possessing the α-olefin Biosynthesis Pathway
  Tomoko Yoshino, Yue Liang, Daichi Arai, Yoshiaki Maeda, Toru Honda, Masaki Muto, Natsumi Kakunaka, Tsuyoshi Tanaka
  Appl. Microbiol. Biotechnol.
  2015年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 99, 1521, 1529
• Capsid Protein Oxidation in Feline Calicivirus Using an Electrochemical Inactivation Treatment
  Nozomi Shionoiri, Osamu Nogariya, Masayoshi, Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  J. Hazard. Mater.
  2015年02月, 研究論文（大学，研究機関紀要）, 共同, 283, 410, 415
• Oil Accumulation by the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris as Revealed by the Genome and Transcriptome
  Tsuyoshi Tanaka, Yoshiaki Maeda, Alaguraj Veluchamy, Michihiro Tanaka, Heni Abida, Eric Maréchal, Chris Bowler, Masaki Muto, Yoshihiko Sunaga, Masayoshi Tanaka, Tomoko Yoshino, Takeaki Taniguchi, Yorikane Fukuda, Michiko Nemoto, Mitsufumi Matsumoto, Pui Shan Wong, Sachiyo Aburatani, Wataru Fujibuchi
  Plant Cell
  2015年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 27, 162, 176
• Enhancement of Glycerol Metabolism in the Oleaginous Marine Diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 to Improve Triacylglycerol Productivity
  Masaki Muto, Masayoshi Tanaka, Yue Liang, Tomoko Yoshino, Mitsufumi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnol. Biofuels
  2015年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 8
• Chloroplast-Targeting Protein Expression in the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 toward Metabolic Engineering
  Yoshihiko Sunaga, Yoshiaki Maeda, Takashi Yabuuchi, Masaki Muto, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  J. Biosci. Bioeng.
  2015年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 119, 28, 34
• Inducible Expression System for the Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG 15041c
  Yoshiaki Maeda, Yasuhito Ito, Toru Honda, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Int. J. Hydrogen Energy
  2014年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 39, 19382, 19388
• 微細藻類を用いたバイオ燃料生産＜グリーンオイル一貫生産プロセスの構築＞
  松本光史、田中剛、野島大佑
  配管技術
  2014年10月, 共同, 56, 15, 20
• Morphological and Molecular Phylogenetic Analysis of the High-triglyceride Producing Marine Diatom, Fistulifera solaris sp. nov. (Bacillariophyceae)
  Mitsufumi Matsumoto, Shigeki Mayama, Michiko Nemoto, Yorikane Fukuda, Masaki Muto, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Phycol. Res.
  2014年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 62, 257, 268
• Profiling of Fatty Acid Methyl Esters from the Oleaginous Diatom Fistulifera sp. Strain JPCC DA0580 under Nutrition-Sufficient and-Deficient Conditions
  Yue Liang, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Mitsufumi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka
  J. Appl. Phycol.
  2014年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 26, 2295, 2302
• Tracking Difference in Gene Expression in a Time-course Experiment Using Gene Set Enrichment Analysis
  Pui Shan Wong, Michihiro Tanaka, Yoshihiko Sunaga, Masayoshi Tanaka, Takeaki Taniguchi, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka, Wataru Fujibuchi, Sachiyo Aburatani
  PLoS One
  2014年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, e107629
• In VivoLive Cell Imaging for the Quantitative Monitoring of Lipids by Using Raman Microspectroscopy
  Masahito Hosokawa, Masahiro Ando, Shoichiro Mukai, Kyoko Osada, Tomoko Yoshino, Hiro-o Hamaguchi, Tsuyoshi Tanaka
  Anal. Chem.
  2014年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 86, 8224, 8230
• Identification of a Frustule-Associated Protein of the Marine Pennate Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  Michiko Nemoto, Yoshiaki Maeda, Masaki Muto, Masayoshi Tanaka, Tomoko Yoshino Shigeki Mayama, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Genomics
  2014年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 6, 39, 44
• Draft Genome Sequence of Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG042902, the Strain Harboring a Homogeneous Plasmid Available for Metabolic Engineering
  Toru Honda, Yue Liang, Daichi Arai, Yasuhito Ito, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Genome Announc.
  2014年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 2, e00704, 14
• Oleosome-Associated Protein of the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris Contains an Endoplasmic Reticulum-Targeting Signal Sequence
  Yoshiaki Maeda, Yoshihiko Sunaga, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2014年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 3892, 3903
• Profiling of Polar Lipids in Marine Oleaginous Diatom Fistuliferasolaris JPCC DA0580: Prediction of the Potential Mechanism for Eicosapentaenoic Acid-incorporation into Triacylglycerol
  Yue Liang, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Mitsufumi Matsumoto, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2014年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 3218, 3230
• Seasonal Variation of Biomass and Oil Production of the Oleaginous Diatom Fistulifera sp. in Outdoor Vertical Bubble Column and Raceway-type Bioreactors
  Reiko Sato, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino and Tsuyoshi Tanaka, Mitsufumi Matsumoto
  J. Biosci. Bioeng.
  2014年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 117, 720, 724
• Digital Cell Counting Device Integrated with a Single-Cell Array
  Tatsuya Saeki, Masahito Hosokawa, Tae-kyu Lim, Manabu Harada, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  PLoS One
  2014年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, e89011
• Functional Expression of an scFv on Bacterial Magnetic particles by in Vitro Docking
  Yasuhiro Sugamata, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Biochem. Biophy. Res. Commun.
  2014年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 445, 1, 5
• 活性酸素発生によるウイルス不活化メカニズムの解析とウイルス感染価センシング技術の展望
  塩野入　望、田中　剛
  Chemical Sensors
  2014年01月, 共同, 30, 1, 8, 13
• 2030年への挑戦"藻類を燃料に
  田中剛、根本 理子、吉野知子
  太陽エネルギー
  2014年01月, 共同, 39, 27, 35
• Monitoring of Cellular Behaviors by Microcavity Array-Based Single-Cell Patterning
  Kyoko Osada, Masahito Hosokawa, Tomoko Yoshino and Tsuyoshi Tanaka
  Analyst
  2014年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 139, 425, 430
• Biosynthesis of Polyunsaturated Fatty Acids in the Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. Strain JPCC DA0580
  Yue Liang, Yoshiaki Maeda, Yoshihiko Sunaga, Masaki Muto, Mitsufumi Matsumoto, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  Mar. Drugs
  2013年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 11, 12, 5008, 5023
• 海洋微細藻類を用いた液体燃料生産技術の現状と今後の展望
  田中剛、田中祐圭、野島大佑
  クリーンエネルギー
  2013年11月, 共同, 22, 11, 37, 43
• Draft Genome Sequence of Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. Strain NKBG15041c
  Tomoko Yoshino, Toru Honda, Masayoshi Tanaka, Tsuyoshi Tanaka
  Genome Announc
  2013年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 1, e00954, 13
• Proteomics analysis of oil body-associated proteins in the oleaginous diatom
  Daisuke Nojima, Tomoko Yoshino, Yoshiaki Maeda, Masayoshi Tanaka, Michiko Nemoto, Tsuyoshi Tanaka
  J. Proteome Res.
  2013年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 12, 5293, 5301
• Electrochemical disinfection of fish pathogens in seawater without the production of a lethal concentration of chlorine using a flow reactor
  Tsuyoshi Tanaka, Mari Shimoda, Nozomi Shionoiri, Masahito Hosokawa, Tomoyuki Taguchi, Hitoshi Wake, Tadashi Matsunaga
  J. Biosci. Bioeng.
  2013年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 116, 480, 484
• Identification and Functional Analysis of Delta-9 Desaturase, a Key Enzyme in PUFA Synthesis, Isolated from the Oleaginous Diatom Fistulifera
  Masaki Muto, Chihiro Kubota, Masayoshi Tanaka, Akira Satoh, Mitsufumi Matsumoto, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka
  PLoS ONE
  2013年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 8, e73507
• Functional expression of thyroid-stimulating hormone receptor on nano-sized bacterial magnetic particles in Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Yasuhiro Sugamata, Ryo Uchiyama, Toru Honda, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Int J Mol Sci.
  2013年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 14, 14426, 14438
• Enhanced heterologous protein display on bacterial magnetic particles using a Lon protease deletion mutant in Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Yuka Kanetsuki, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  J. Biosci. Bioeng.
  2013年07月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 116, 65, 70
• Size-Based Isolation of Circulating Tumor Cells in Lung Cancer Patients Using a Microcavity Array System
  Masahito Hosokawa, Hirotsugu Kenmotsu, Yasuhiro Koh, Tomoko Yoshino, Takayuki Yoshikawa, Tateaki Naito, Toshiaki Takahashi, Haruyasu Murakami, Yukiko Nakamura, Asuka Tsuya, Takehito Shukuya, Akira Ono, Hiroaki Akamatsu, Reiko Watanabe, Sachiyo Ono, Keita Mori, Hisashige Kanbara, Ken Yamaguchi, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Nobuyuki Yamamoto
  PLoS ONE
  2013年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 8, e67466
• Microcavity Array System for Size-Based Enrichment of Circulating Tumor Cells from the Blood of Patients with Small-Cell Lung Cancer
  Masahito Hosokawa, Takayuki Yoshikawa, Ryo Negishi, Tomoko Yoshino, Yasuhiro Koh, Hirotsugu Kenmotsu, Tateaki Naito, Toshiaki Takahashi, Nobuyuki Yamamoto, Yoshihito Kikuhara, Hisashige Kanbara, Tsuyoshi Tanaka, Ken Yamaguchi, and Tadashi Matsunaga
  Anal. Chem.
  2013年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 85, 5692, 5698
• A process design and productivity evaluation for oil productionby indoor mass cultivation of a marine diatom, Fistulifera sp. JPCC DA0580
  Akira Satoh, Kyonosuke Ichii, Mitsufumi Matsumoto, Chihiro Kubota, Michiko Nemoto, Masayoshi Tanaka, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Bioresour. Technol.
  2013年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 137, 132, 138
• 海洋バイオマスからのバイオディーゼル生産
  田中剛、吉野知子、武藤正記
  化学と生物
  2013年03月, 共同, 51, 183, 188
• Establishment of a genetic transformation system for the marine pennate diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 - a high triglyceride producer
  Masaki Muto, Yorikane Fukuda, Michiko Nemoto, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Marine Biotech.
  2013年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 15, 48, 55
• Monitoring of Benzene-induced Hematotoxicity in Mice by Serial Leukocyte Counting Using a Microcavity Array
  Masahito Hosokawa, Marie Asami, Tomoko Yoshino, Noriyuki Tsujimura, Masayuki Takahashi, Satoshi Nakasono, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Biosens. Bioelectron
  2013年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 40, 110, 114
• Glycosylceramides from marine green microalga Tetraselmis sp.
  Atsushi Arakaki, Daisuke Iwama, Yue Liang, Nagisa Murakami, Masaharu Ishikura, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Phytochemistry
  2013年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 85, 107, 114
• 海洋微細藻類を用いた液体燃料生産技術の可能性と今後の展開
  田中祐圭、田中剛
  Journal of the Japan Institute of Energy
  2012年11月, 共同, 91, 1161, 1165
• Effective expression of human proteins on bacterial magneticparticles in an anchor gene deletion mutant of Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Yuka Kanetsuki, Masayoshi Tanaka, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Tomoko Yoshino
  Biochem. Biophys. Res. Commun.
  2012年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 426, 7, 11
• Assessment of the Anti-biofouling Potentials of a Copper Iiodide-doped Nylon Mesh
  Tetsuya Sato, Yoshie Fujimori, Tsuruo Nakayama, Yasuo Gotoh, Yoshihiko Sunaga, Michiko Nemoto, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Appl Microbiol. Biotechnol.
  2012年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 95, 1043, 1050
• Leukocyte Counting from a Small Amount of Whole Blood Using a Size-Controlled Microcavity Array
  Masahito Hosokawa, Marie Asami, Seita Nakamura, Tomoko Yoshino, Noriyuki Tsujimura, Masayuki Takahashi, Satoshi Nakasono, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Biotechnol. Bioeng.
  2012年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 109, 2017, 2024
• 海洋珪藻の次世代バイオ燃料への応用
  田中剛
  生物工学
  2012年07月, 単独, 90, 392, 395
• 微細藻類を用いたバイオ原料・燃料用オイル生産技術開発への挑戦
  松本光史、田中剛
  環境バイオテクノロジー学会誌
  2012年06月, 共同, 12, 9, 14
• Efficient DNA Release from PAMAM Dendrimer-modified Superparamagnetic Nanoparticles for DNA Recovery
  Atsushi Arakaki, Keiyu Shibata, Takeyuki Mogi, Masahito Hosokawa, Keiichi Hatakeyama, Hideyuki Gomyo, Tomoyuki Taguchi, Hitoshi Wake, Takeo Tanaami, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Polymer Journal
  2012年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 44, 672, 677
• Investigation of the Antiviral Properties of Copper Iiodide Nanoparticles against Feline Calicivirus
  Nozomi Shionoiri, Tetsuya Sato, Yoshie Fujimori, Tsuruo Nakayama, Michiko　Nemoto, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  J. Biosci. Bioeng.
  2012年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 113, 580, 586
• 藻類から得られるバイオ燃料の可能性と今後の課題
  田中剛、根本理子
  未来材料
  2012年03月, 共同, 12, 37, 43
• Prevention of Marine Biofouling on Nylon Mesh Doped with Silver Iodide
  Tetsuya Sato, Yoshie Fujimori, Tsuruo Nakayama,Yasuo Gotoh, Michiko Nemoto, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Colloids and Surfaces A:　Physicochem. Eng. Aspects
  2012年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 396, 41, 45
• Characterization of Magnetic Nanoparticles Modified with Thiol Functionalized PAMAM Dendron for DNA Recovery.
  Tsuyoshi Tanaka, Keiyu Shibata, Masahito Hosokawa , Keiichi Hatakeyama, Atsushi Arakaki, Hideyuki Gomyo, Takeyuki Mogi, Tomoyuki Taguchi, Hitoshi Wake, Takeo Tanaami, Tadashi Matsunaga
  J. Colloid Interface Sci
  2012年02月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 377, 469, 475
• Altererythrobacter ishigakiensis sp. nov.-An Astaxanthin-producing Bacterium Isolated from Marine Sediments.
  Mitsufumi Matsumoto, Daisuke Iwama, Atsushi Arakaki, Akira Tanaka, Tsuyoshi Tanaka, Hideaki Miyashita, Tadashi Matsunaga
  Int. J. Syst. Evol. Microbiol.
  2011年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 61, 2956, 2961
• Magnetic Bacterial Protein Mms6 Controls Morphology, Crystallinity and Magnetism of Cobalt-doped Magnetite Nanoparticles in Vitro
  Johanna M Galloway, Atsushi Arakaki, Fukashi Masuda, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga, Sarah S Staniland
  J. Mater. Chem.
  2011年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 21, 15244, 15254
• 海洋微細藻類を用いた液体燃料生産技術の可能性と今後の展開
  田中剛、武藤正記、松永是
  太陽エネルギー
  2011年09月, 共同, 37, 23, 28
• 次世代液体バイオ燃料開発に向けた海洋生物資源の活用
  田中剛、根本理子、松永是
  ケミカルエンジニアリング
  2011年09月, 共同, 56, 9, 713, 718
• High-throughput Pyrosequencing of the Chloroplast Genome of a Highly Neutral-lipid-producing Marine Pennate Diatom, Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  Tsuyoshi Tanaka, Yorikane Fukuda, Tomoko Yoshino, Yoshiaki Maeda, Masaki Muto, Mitsufumi Matsumoto, Shigeki Mayama, Tadashi Matsunaga
  Photosynth. Res.
  2011年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 109, 223, 229
• Real-time Detection of DNA Hybridization on Microarray Using a CCD-based Imaging System Equipped with a Rotated Microlens Array Disk
  Takeyuki Mogi, Keiichi Hatakeyama, Tomoyuki Taguchi, Hitoshi Wake, Takeo Tanaami, Masahito Hosokawa, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Biosens Bioelectron.
  2011年01月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 26, 1942, 1946
• High-content Analysis of Single Cells Directly Assembled on CMOS Sensor Based on Color Imaging
  Tsuyoshi Tanaka, Tatsuya Saeki, Yoshihiko Sunaga, Tadashi Matsunaga
  Biosens.Bioelectron.
  2010年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 26, 1460, 1465
• Single-cell Detection Using a Thin Film Transistor Photosensor with Micro-partitions
  Tsuyoshi Tanaka, Yoshihiko Sunaga, Keiichi Hatakeyama, Tadashi Matsunaga
  Lab. Chip
  2010年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 10, 3348, 3354
• Size-Selective Microcavity Array for Rapid and Efficient Detection of Circulating Tumor Cells
  Masahito Hosokawa, Taishi Hayata, Yorikane Fukuda, Atsushi Arakaki, Tomoko Yoshino, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chem.
  2010年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 82, 6629, 6635
• Marine Diatom, Navicula sp. Strain JPCC DA0580 and Marine Green Alga, Chlorella sp. Strain NKG400014 as Potential Sources for Biodiesel Production
  Mitsufumi Matsumoto, Hiroshi Sugiyama, Yoshiaki Maeda, Reiko Sato, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Appl. Biochem. Biotechnol.
  2010年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 161, 483, 490
• 磁性ビーズを利用した生体分子の分析技術
  田中剛、吉野知子、松永是
  ぶんせき
  2010年03月, 共同, 3, 133, 138
• Control of the Morphology and Size of Magnetite Particles with Peptides Mimicking the Mms6 Protein from Magnetotactic Bacteria
  Atsushi Arakaki, Fukashi Masuda, Yosuke Amemiya, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  J. Colloid Int. Sci.
  2010年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 343, 65, 70
• バイオナノ磁石の創製とバイオ分析への応用
  田中剛、松永是
  ナノ学会会報
  2010年02月, 共同, 8, 85, 89
• 海洋藻類の燃料生産への応用
  田中 剛、前田義昌、松永 是
  月刊 化学工業
  2010年02月, 共同, 61, 2, 34, 39
• Characterization of Marine Microalga, Scenedesmus sp. Strain JPCC GA0024 toward Biofuel Production
  Tadashi Matsunaga, Mitsufumi Matsumoto, Yoshiaki Maeda, Hiroshi Sugiyama, Reiko Sato, Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnol. Lett.
  2009年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 31, 1367, 1372
• On-chip Type Cation-Exchange Chromatography with Ferrocene-Labeled Anti-Hemoglobin Antibody and Electrochemical Detector for Determination of Hemoglobin A1c Level
  Tsuyoshi Tanaka, Kojiro Izawa, Mina Okochi, Tae-Kyu Lim, Shugo Watanabe, Manabu Harada, Tadashi Matsunaga
  Anal. Chim. Acta
  2009年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 638, 186, 190
• Microfluidic Device Using Chemiluminescence and a DNA-arrayed Thin Film Transistor Photosensor for Single Nucleotide Polymorphism Genotyping of PCR Amplicons from Whole Blood
  Keiichi Hatakeyama, Tsuyoshi Tanaka, Masahiro Sawaguchi, Akihito Iwadate, Yasushi Mizutani, Kazuhiro Sasaki, Naofumi Tateishi, Tadashi Matsunaga
  Lab Chip
  2009年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 9, 1052, 1058
• Contributions of Phosphate to DNA Adsorption/Desorption Behaviors on Aminosilane-Modified Magnetic Nanoparticles
  Tsuyoshi Tanaka, Ririko Sakai, Ryosuke Kobayashi, Keiichi Hatakeyama, Tadashi Matsunaga
  Langmuir
  2009年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 25, 2956, 2961
• Novel Method for Selection of Antimicrobial Peptides from a Phage Display Library by Use of Bacterial Magnetic Particles
  Tsuyoshi Tanaka, Yoriko Kokuryu, Tadashi Matsunaga
  Appl. Environ. Microbiol.
  2008年12月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 74, 7600, 7606
• Fabrication of Genetic Diagnostic Chip Using DNA-arrayed TFT Photosensor
  Keiichi Hatakeyama, Tsuyoshi Tanaka, Masahiro Sawaguchi, Akihito Iwadate, Yasushi Mizutani, Kazuhiro Sasaki, Naofumi Tateishi, Tadashi Matsunaga
  Electrochemistry
  2008年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 76, 573, 575
• High-Efficiency Single-Cell Entrapment and Fluorescence in Situ Hybridization Analysis Using a Poly(dimethylsiloxane) Microfluidic Device Integrated with a Black Poly(ethylene terephthalate) Micromesh
  Tadashi Matsunaga, Masahito Hosokawa, Atsushi Arakaki, Tomoyuki Taguchi, Tetsushi Mori, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama
  Analytical Chemistry
  2008年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 80, 5139, 5145
• A Novel Method for Selection of Antimicrobial Peptides from A Phage Display Library Using Bacterial Magnetic Particles
  Tsuyoshi Tanaka, Yoriko Kokuryu and Tadashi Matsunaga
  Applied Environmental Biotechnology
  2008年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, -, -
• 第2章　第3節　免疫センサとアフィニティーセンサ フロー型免疫センサチップ
  伊沢康二郎、田中　剛、松永　是
  バイオセンサ・ケミカルセンサ事典
  2007年08月, 共同, -, -, 205, 210
• Controlled formation of magnetite crystal by partial oxidation of ferrous hydroxide in the presence of recombinant magnetotactic bacterial protein Mms6.
  Amemiya Y, Arakaki A, Staniland SS, Tanaka T, Matsunaga T.
  Biomaterials
  2007年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, -, -
• Electrochemical detection of HbA1c using flow immunoassay system toward development of point of care testing device for diabetes markers
  Tsuyoshi Tanaka, Shoko Tsukube, Kojiro Izawa, Mina Okochi and Tadashi Matsunaga
  Biosensors & Bioelectronics
  2007年04月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 22, 9-10, 2051, 2056
• Origin of magnetosome membrane: Proteomic analysis of magnetosome membrane and comparison with cytoplasmic membrane
  Masayoshi Tanaka, Yoshiko Okamura, Atsushi Arakaki, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama and Tadashi Matsunaga
  Proteomics
  2006年10月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 6, 19, 5234–5247
• Oligonucleotide-arrayed TFT photosensor applicable for DNA chip technology.
  Tsuyoshi Tanaka, Keiichi Hatakeyama, Masahiro Sawaguchi, Akihito Iwadate, Yasushi Mizutani, Kazuhiro Sasaki, Naofumi Tateishi, Haruko Takeyama and Tadashi Matsunaga
  Biotechnology & Bioengineering
  2006年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 95, 1, 22, 28
• Automated DNA Extraction from Genetically Modified Maize Using Amine Modified Bacterial Magnetic Particles
  Hiroyuki Ota, Tae-Kyu Lim, Tsuyoshi Tanaka, Tomoko Yoshino, Manabu Harada, Haruko Takeyama and Tadashi Matsunaga
  Journal of Biotechnology
  2006年09月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 125, 3, 361, 368
• Capture and release of DNA using amino silane modified bacterial magnetic particles for an automated detection system of single nucleotide polymorphisms
  Takahito Nakagawa, Reisuke Hashimoto, Kohei Maruyama, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama and Tadashi Matsunaga
  Biotechnology & Bioengineering
  2006年08月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 94, 5, 862, 868
• Discrimination of DNA Mismatches by Direct Force Measurement for Identification of Tuna Species.
  Tsuyoshi Tanaka, Tomohito Sasaki, Yosuke Amemiya, Haruko Takeyama, Seinen Chow and Tadashi Matsunaga
  Analytica Chimica Acta
  2006年03月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 561, 150, 155
• 微生物が合成する機能性ナノ磁性粒子の創製とバイオ分野への応用
  松永　是、田中　剛
  工業材料
  2005年01月, 共同, 53, 2, 68, 71
• Novel detection system for biomolecules using nano-sized bacterial magnetic particles and magnetic force microscopy
  Yosuke Amemiya, Tsuyoshi Tanaka,, Brandon Yoza and Tadashi Matsunaga
  Journal of Biotechnology
  2005年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 120, 3, 308, 314
• Electrochemical probe for on-chip type flow immunoassay: Immunoglobulin G labeled with ferrocenecarboaldehyde
  Mina Okochi, Hiroko Ohta, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga
  Biotechnology & Bioengineering
  2005年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 90, 1, 14, 19
• Fabrication of Amino silane-Coated Microchip for DNA Extraction from Whole Blood
  Takahito Nakagawa, Tsuyoshi Tanaka, Niwa D, Tetsuya Osaka, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Journal of Biotechnology
  2005年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 116, 2, 105, 111
• Detection of biomolecular interaction between biotin and streptavidin on a self-assembled monolayer using magnetic nanoparticles
  Atsushi Arakaki, Shou Hideshima, Takahito Nakagawa, Daisuke Niwa, Tsuyoshi Tanaka, Tadashi Matsunaga and Tetsuya Osaka
  Biotechnology & Bioengineering
  2004年11月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 88, 4, 543, 546
• 「磁性ビーズを用いたバイオチップ」
  田中　剛、松永　是
  ”バイオチップの最新技術と応用”シーエムシー出版
  2004年06月, 共同, 9, 21
• Spontaneous Integration of Transmembrane Peptides into a Bacterial Magnetic Particle Membrane and Its Application to Display of Useful Proteins
  Tsuyoshi Tanaka, Hajime Takeda, Yoriko Kokuryu, Tadashi Matsunaga
  Analytical Chemistry
  2004年05月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 76, 3764, 3769
• Magnetic Cell Separation Using Antibody Binding With Protein A Expressed on Bacterial Magnetic Particles
  Motoki Kuhara, Haruko Takeyama, Tsuyoshi Tanaka and Tadashi Matsunaga
  Analytical Chemistry
  2004年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 76, 21, 6207, 6213
• Single Nucleotide Polymorphism Detection in Aldehyde Dehydrogenase 2 (ALDH2) Gene using Bacterial Magnetic Particles Based on Dissociation Curve Analysis
  Kohei Maruyama, Haruko Takeyama, Etsuo Nemoto, Tsuyoshi Tanaka, Kiyoshi Yoda and Tadashi Matsunaga
  Biotechnology & Bioengineering
  2004年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 87, 6, 687, 694
• 「細菌を利用したナノ磁気微粒子の生産」
  田中　剛、松永　是
  応用磁気
  2004年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 28, 5
• Biotechnological Application of Nano-Scale Engineered Bacterial Magnetic Particles
  Tadashi Matsunaga, Yoshiko Okamura and Tsuyoshi Tanaka
  Journal of Material Chemistry
  2004年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 14, 14, 2009, 2105
• Rapid and sensitive detection of 17β-estradiol in environmental water using automated immunoassay system with bacterial magnetic particles
  Tsuyoshi Tanaka, Hajime Takeda, Fumiko Ueki, Kimimichi Obata, Hideji Tajima, Haruko Takeyama, Yasuhiro Goda, Shigeru Fujimoto, Tadashi Matsunaga
  Journal of Biotechnology
  2004年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 182, 2, 153, 159
• 第５章　ナノバイオテクノロジーで広がるプロセスとデバイス 「1 バイオプロセスによるナノバイオミネラルの創製とその応用」
  松永　是、田中　剛
  ”ナノテクノロジーの最前線”シーエムシー出版
  2003年10月, 共同, 154, 161
• 「３．磁気ビーズを用いたセパレーション」特集バイオマテリアルとバイオセパレーション
  松永　是、田中　剛
  バイオマテリアル (生体材料)
  2003年01月, 共同, 21, 2, 113, 119
• 「磁性細菌の探索から網羅的解析へ」シリーズ：未知微生物の探索－共生から極限まで⑫
  松永　是、田中　剛
  バイオサイエンスとインダストリー
  2003年01月, 共同, 61, 9, 603, 606
• 動態制御工学とマイクロマシン、DDS
  松永　是、田中　剛
  Drug Delivery System
  2003年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 18, 1, 38, 44
• Characterization of Microbulbifer arenaceous sp. nov., a new endolithic bacterium isolated from the inside of red sandstone
  Tsuyoshi Tanaka, Liming Yan and J. Grant Burgess
  Current Microbiology
  2003年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 47, 5, 412, 416
• Development and Evaluation of Automated Workstation for Single Nucleotide Polymorphism Discrimination Using Bacterial Magnetic Particles
  Tsuyoshi Tanaka, Kohei Maruyama, Kiyoushi Yoda, Etsuo Nemoto, Yuuji Udagawa, Hideki Nakayama, Haruko Takeyama and Tadashi Matsunaga
  Biosensors & Bioelectronics
  2003年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 19, 4, 325, 330
• Single Nucleotide Polymorphism Genotyping of Aldehyde Dehydrogenase 2 Gene Using A Single Bacterial Magnetic Particle
  Yoshino Tomoko, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Biosensors & Bioelectronics
  2003年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 18, 5-6, 661, 666
• Single nucleotide mismatch analysis using oligonucleotide probes synthesized on bacterial magnetic particle
  Hiroyuki Ota, Atsushi Arakaki, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama, Tadashi Matsunaga
  Biomolecular Engineering
  2003年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 20, 4-6, 305, 309
• Fully Automated Immunoassay System of Endocrine Disrupting Chemicals Using Monoclonal Antibodies Chemically Conjugated to Bacterial Magnetic Particles
  Tadashi Matsunaga, Fumiko Ueki, Kimimichi Obata, Hideji Tajima, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama, Yasuhiro Goda, Shigeru Fujimoto
  Analytica Chimica Acta
  2003年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 475, 75, 83
• Physiological modelling of the response of Kocuria rosea TT1 exposed to changing water activity
  Phillip C. Wright and Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnology Letters
  2002年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 24, 8, 603, 609
• Cadmium Recovery by a Sulfate-Reducing Magnetotactic Bacterium, Desulfovibrio magneticus RS-1 Using Magnetic Separation
  Atsushi Arakaki, Haruko Takeyama, Tsuyoshi Tanaka and Tadashi Matsunaga
  Applied Biochemistry and Biotechnology
  2002年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 98-100, 833, 840
• Development of High-Performance and Rapid Immunoassay for Model Food Allergen Lysozyme Using Antibody-Conjugated Bacterial Magnetic Particles and Fully Automated System
  Reiko Sato, Haruko Takeyama, Tsuyoshi Tanaka and Tadashi Matsunaga
  Applied Biochemistry and Biotechnology
  2001年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 91-93, 109, 116
• Synthesis of Bacterial Magnetic Particles During Cell Cycle of Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Chen-Dong Yang, Haruko Takeyama, Tsuyoshi Tanaka, Aki Hasegawa and Tadashi Matsunaga
  Applied Biochemistry and Biotechnology
  2001年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 91-93, 155, 160
• Effects of Growth Medium Composition, Iron Sources and Atmospheric Oxygen Concentrations on Production of Luciferase-Bacterial Magnetic Particle Complex by a Recombinant Magnetospirillum magneticum AMB-1
  Chen-Dong Yang, Haruko Takeyama, Tsuyoshi Tanaka and Tadashi Matsunaga
  Enzyme and Microbial Technology
  2001年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 29(1), 13, 19
• Detection of HbA1c by Boronate Affinity Immunoassay Using Bacterial Magnetic Particles
  Tsuyoshi Tanaka and Tadashi Matsunaga
  Biosensors & Bioelectronoucs
  2001年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 16(9-12), 1089, 1094
• High-Pressure Adaptation by Salt Stress in A Moderately Halophilic Bacterium Obtained from Open Seawater
  Tsuyoshi Tanaka, J. Grant Burgess and Phillip Wright
  Applied Microbiology and Biotechnology
  2001年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 57(1-2), 200, 204
• A Fully Automated Chemiluminescence Immunoassay of Insulin Using Antibody-protein A-Bacterial Magnetic Particle Complexes
  Tsuyoshi Tanaka and Tadashi Matsunaga
  Analytical Chemistry
  2000年06月, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 72(15), 3518, 3522
• 磁性細菌におけるマグネタイト微粒子の形成機構
  海洋
  2000年, 研究論文（学術雑誌）, 32(6), 405, 411
• Production of Luciferase-Magnetic Particle Complex by Recombinant Magnetospirillum sp. AMB-1
  Tadashi Matsunaga, Hiromi Togo, Tomoko Kikuchi, Tsuyoshi Tanaka
  Biotechnology and Bioengineering
  2000年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 70(6), 704, 709
• Atomic Force Microscope Imaging of Escherichia coli Cell Using Anti-E. coli Antibody-Conjugated Probe (in Aqueous) Solutions
  Tsuyoshi Tanaka, Noriyuki Nakamura and Tadashi Matsunaga
  Electrochimica Acta
  1999年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 44, 3827, 3832
• Chemiluminescence Enzyme Immunoassay Using ProteinA-Bacterial Magnetite Complex
  Tadashi Matsunaga, Rika Sato, Shinji Kamiya, Tsuyoshi Tanaka, Haruko Takeyama
  Journal of Magnetism and Magnetic Materials
  1999年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 194, 126, 131
• 磁性細菌
  松永　是、田中　剛
  表面
  1998年01月, 共同, 36, 32, 38
• High-Resolution Magnetic Force Microscope Images of a Magnetic Particle Chain Extracted from Magnetic Bacteria AMB-1
  Hitoshi Suzuki, Tsuyoshi Tanaka, Tomohito Sasaki, Noriyuki Nakamura, Tadashi Matsunaga and Shinro Mashiko
  Japanese Journal of Applied Physics
  1998年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 37, L1343, L1345
• 磁性細菌粒子と筋収縮タンパク質を利用したナノアクチュエータ
  松永　是、田中　剛
  自動化技術
  1997年01月, 共同, 29, 4, 53, 58
• Magnetic Control of Bacterial Magnetite-Myosin Conjugate Movement on Actin Cables
  Tsuyoshi Tanaka, Hiromichi Yamasaki, Haruto Nakayama, Noriyuki Tsujimura, Noriyuki Nakamura, Tadashi Matsunaga
  Materials Science & Engineering C
  1997年, 研究論文（学術雑誌）, 共同, 5, 121, 124

著書

• 微生物を活用した有用物質の製造技術
  田中 剛、熊久保涼太
  第4章　第2節　海洋微細藻類を用いたバイオ燃料生産に向けた屋外大量培養プロセスの構築
  2023年
• 藻類による二酸化炭素回収・固定化と有用物質生産
  田中剛、安井零音
  第3章　第2節　効率的なCO2固定化・有用物質生産に向けた海洋微細藻類の分子育種技術
  CMC出版
  2025年
• Biological Magnetic Materials and Applications/Bioengineering and Biotechnological Applications of Bacterial Magnetic Particles
  Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga, Tsuyoshi Tanaka
  Springer
  2018年07月
• Biological Magnetic Materials and Applications
  Matsunaga, Tadashi, Tanaka, Tsuyoshi, Kisailus, David
  Springer
  2018年07月
• Marine OMICS: Principles and Applications/Lipidomics analysis of marine microalgae
  Tsuyoshi Tanaka, Yue Liang, Yoshiaki Maeda, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga
  CRC Press
  2016年08月
• バイオ水素とキャリア開発の最前線・バイオ水素研究の基盤
  松永是、田中剛
  シーエムシー出版
  2015年03月
• Handbook of Marine Biotechnology/Marine Microalgae
  Tsuyoshi Tanaka, Masaki Muto, Yue Liang, Tomoko Yoshino, Tadashi Matsunaga
  Springer
  2015年01月
• ヘルスケアとバイオ医療のための先端デバイス機器
  田中剛、松永是
  シーエムシー出版
  2009年05月
• Electrochemical Nanotechnologie
  T.Matsunaga, T.Tanaka
  Springer
  2009年01月
• ナノバイオ大事典・DNAチップ
  田中　剛、松永　是
  株式会社テクノシステム
  2007年01月
• ナノバイオ大事典・磁性細菌
  松永　是、田中　剛
  株式会社テクノシステム
  2007年01月

研究発表、招待講演等

• 脱炭素に向けた藻類のブルーカーボン･カーボンリサイクルへの応用
  日本化学連合企画シンポジウム　『海』　化学はどこに向かうのか　シリーズ第1回
  2025年04月28日, 口頭発表（招待・特別）
• バイオ燃料および有価物生産に向けた海洋微細藻類の分子育種
  日本農芸化学会2025年度札幌大会　分野融合連携(他学会連携)シンポジウム
  2025年03月06日, 口頭発表（招待・特別）
• 排水由来回収リンの再資源化と農業生産への利用可能性
  第4回循環型協生農業プラットフォーム社会連携アグリフォーラム　未来への挑戦･あふれる活力･輝く未来型農業
  2024年12月06日, 口頭発表（招待・特別）
• Metabolic engineering of marine oleaginous microalgae for biofuel and chemical production
  International CeBiTec Research Conference
  2024年09月17日, 口頭発表（招待・特別）
• コロニーフィンガープリントの機械学習に基づく真菌 Aspergillus 属の菌種判別法の開発
  2018年電気化学秋季大会
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• Modification of phospholipids composition of magnetosomes by employing phosphatidylcholine synthase in magnetotactic bacteria
  The 6th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
  2018年09月, ポスター発表
• Functional Expression of Transmembrane Receptors on Magnetic Nanoparticles Through a Magnetosome-display System
  The 6th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
  2018年09月, ポスター発表
• Bioengineering of Magnetic Nanoparticles Produced by Magnetospirillum magneticum AMB-1 for Extensive Applications
  The 6th International Meeting on Magnetotactic Bacteria
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• シグナリングアレイ方式のDNAチップを用いた微生物ゲノムDNAの検出
  第12回バイオ関連化学シンポジウム
  2018年09月, ポスター発表
• MCA/GCM法を用いた転移性がん患者由来血中循環腫瘍細胞の単一細胞遺伝子発現解析
  第12回バイオ関連化学シンポジウム
  2018年09月, ポスター発表
• 血中循環腫瘍細胞の遺伝子解析に向けたハイスループット単一細胞分離システムの開発
  第12回バイオ関連化学シンポジウム
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• Gel-based cell manipulation法に基づく環境微生物の単一細胞解析技術の開発
  第70回 日本生物工学会大会
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変による高付加価値脂肪酸の効率的生産
  第70回 日本生物工学会大会
  2018年09月, 口頭発表（一般）
• Process design for the mass production of biofuels from the marine oleaginous diatom Fistulifera solaris with the use of wastewater as nutrients
  The 8th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2018年06月, ポスター発表
• Improvement of valuable fatty acid production in the marine oleaginous diatom Fistrulifera solaris
  The 8th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2018年06月, ポスター発表
• 海洋珪藻における脂肪酸生産の「鍵」酵素
  第20回マリンバイオテクノロジー学会
  2018年05月, シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変に基づくプロスタグランジンの高効率生産
  第20回マリンバイオテクノロジー学会
  2018年05月, 口頭発表（一般）
• 珪藻細胞内におけるトリアシルグリセロールの凝固挙動の解析
  第20回マリンバイオテクノロジー学会
  2018年05月, ポスター発表
• オートファジー阻害剤を用いた珪藻オイルボディ形成への影響評価
  第20回マリンバイオテクノロジー学会
  2018年05月, ポスター発表
• 磁性細菌 Magnetospirillum magneticum におけるホスファチジルコリン合成酵素の発現による磁気微粒子の膜改変
  日本化学会第98春季年会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris におけるシクロオキシゲナーゼ発現によるプロスタグランジンの生物
  日本化学会第98春季年会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• 微生物ゲノムDNAの検出に向けたシグナリングアレイの開発
  第85回電気化学会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• コロニーフィンガープリントの機械学習に基づく真正細菌の高精度判別
  第85回電気化学会
  2018年03月, 口頭発表（一般）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris における高付加価値脂肪酸の生産向上
  第4回分子珪藻研究会
  2017年12月, 口頭発表（一般）
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変によるプロスタグランジンの生産
  第4回分子珪藻研究会
  2017年12月, 口頭発表（一般）
• 病原性微生物の新規バイオイメージ診断法の開発
  第53回　学際領域セミナー 医薬工連携：隠れたニーズとシーズを探る
  2017年11月, 口頭発表（招待・特別）
• Techniques for Genomic and Morphological Characterization of Environmental Microbes at Single-Cell Level via Gel-based Cell Manipulation
  IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions 2017
  2017年11月, ポスター発表
• In vivo Modification of Membrane Composition of Magnetosomes via Expression of Phosphatidylcholine Synthase in Magnetotactic Bacteria
  IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions 2017
  2017年11月, ポスター発表
• レンズレスイメージングに基づく血中循環腫瘍細胞の培養モニタリングシステムの開発
  第62回化学センサ研究発表会
  2017年09月11日, その他
• 血中循環腫瘍細胞の遺伝子変異検出に向けたハイスループット単一細胞単離システムの構築
  第62回化学センサ研究発表会
  2017年09月11日, その他
• Hydrogel-based cell manipulation 法に基づくゲノム解析技術の開発
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• 海洋珪藻 Fistulifera solaris JPCC DA0580 株を用いた CRISPR/Cas9 法によるゲノム編集技術の確立
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• ホスファチジルコリン合成酵素の発現による磁性細菌 Magnetospirillum magneticumAMB-1の磁気微粒子膜の組成改変
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• 磁性細菌 Magnetospirillum magneticum AMB-1 を用いたポリヒドロキシブタン酸の生産 と磁気回収の検討
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月08日, ポスター発表
• 脂質高蓄積珪藻 Fistulifera solaris の代謝改変によるプロスタグランジンの高効率生産
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月07日, ポスター発表
• 細胞高集積化デバイスを用いたがん細胞分泌タンパク質のシングルセル解析
  第11回バイオ関連化学シンポジウム-第32回生体機能関連化学シンポジウム、第20回バイオテクノロジー部会シンポジウム-
  2017年09月07日, その他
• バイオ燃料生産への利用に向けた水面浮遊性微細藻類におけるオイル生産性向上
  第69回 日本生物工学会大会
  2017年09月, ポスター発表
• Microcavity array方式に基づく血中循環腫瘍細胞の迅速な遺伝子発現解析
  第69回 日本生物工学会大会
  2017年09月, ポスター発表
• 細胞高集積化デバイスを用いた単一がん細胞からの分泌タンパク質の免疫測定
  第69回 日本生物工学会大会
  2017年09月, ポスター発表
• Genetic engineering of marine oleaginous diatoms for improved biofuel production
  The 73rd Fujihara Seminar International Conference “Molecular Life of Diatoms”
  2017年07月12日, 口頭発表（一般）
• Functional analysis of microalgal oil body-associated proteins identified from oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580
  The 73rd Fujihara Seminar International Conference “Molecular Life of Diatoms”
  2017年07月11日, ポスター発表
• Homoeolog expression bias in allopolyploid oleaginous marine diatom Fistulifera solaris
  The 73rd Fujihara Seminar International Conference “Molecular Life of Diatoms”
  2017年07月10日, その他
• Eicosapentaenoic acid production from oleaginous microalga Fistulifera solaris by high cell density cultivation
  7th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2017年06月21日, ポスター発表
• Evaluation of the potential of water surface-floating microalgae for biofuel production
  7th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2017年06月19日, その他
• 海洋珪藻 Fistulifera solarisの高密度培養による多価不飽和脂肪酸生産
  第19回マリンバイオテクノロジー学会
  2017年06月04日, その他
• 紫外線照射によるFistulifera solarisのオイル蓄積挙動の解析
  第19回マリンバイオテクノロジー学会
  2017年06月03日, ポスター発表
• 海洋珪藻のメタボリックエンジニアリングによる効率的バイオ燃料生産プロセスの創生
  第19回マリンバイオテクノロジー学会
  2017年06月03日, 口頭発表（招待・特別）
• Genome editing of marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 using CRISPR/Cas9 system
  The 11th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2017年05月23日, その他
• Identification and functional analysis of oil body-associated proteins of oleaginous diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580
  The 11th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2017年05月23日, その他
• Biased contribution of the homoeologous subgenomes to lipid metabolisms in the marine allodiploid diatom Fistulifera solaris
  The 11th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2017年05月23日, その他
• Potential of marine oleaginous diatom for biomass, biofuel and biochemical production
  The 11th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2017年05月23日, 口頭発表（招待・特別）
• 光硬化性ハイドロゲルを利用した単一微生物の単離・培養法の開発
  化学とマイクロ・ナノシステム学会第35回研究会
  2017年05月23日, ポスター発表
• 単一細胞の高効率分離を目指したマルチ光照射システムの構築
  化学とマイクロ・ナノシステム学会第35回研究会
  2017年05月23日, ポスター発表
• マイクロキャビティアレイ方式に基づく血中循環腫瘍細胞の自動回収・培養技術の開発
  化学とマイクロ・ナノシステム学会第35回研究会
  2017年05月22日, ポスター発表
• コロニーフィンガープリントに基づく簡易・迅速な黄色ブドウ球菌の判別
  電気化学会第84回大会
  2017年03月27日, その他
• シグナリングアレイプローブを用いた病原性微生物の簡易遺伝子検出法の開発
  電気化学会第84回大会
  2017年03月27日, その他
• 磁性粒子上へのセルラーゼ複合体共局在によるセルロース分解能の向上
  日本化学会 第97春季年会
  2017年03月18日, その他
• 海洋性珪藻Fistulifera solaris におけるω3 desaturase の強発現によるエイコサペンタエン酸 (EPA)の高生産
  日本化学会 第97春季年会
  2017年03月18日, その他
• Development of single-cell genetic analysis system for circulating tumor cells based on microcavity array
  日本化学会 第97春季年会
  2017年03月18日, その他
• Fabrication of a single-cell gel manipulation system based on multiple light illumination
  International Conference on Single Cell Research 2016
  2016年11月17日, ポスター発表
• Hydrogel-based single-cell manipulation towards genetic analysis of single circulating tumor cell
  International Conference on Single Cell Research 2016
  2016年11月17日, ポスター発表
• 水面浮遊性微細藻類FFG039株における遺伝子組換え技術の確立
  第68回 日本生物工学会大会
  2016年09月30日, ポスター発表
• 都市排水を利用した微細藻類のバイオ燃料生産に向けた新規候補株の探索
  第68回 日本生物工学会大会
  2016年09月30日, ポスター発表
• オイル高蓄積海洋珪藻Fistulifera solarisにおけるオイルボディタンパク質の解析
  第68回 日本生物工学会大会
  2016年09月30日, ポスター発表
• マルチ光照射システムを用いた単一細胞のゲルマニピュレーション技術の開発
  第10回バイオ関連化学シンポジウム
  2016年09月08日, ポスター発表
• レンズレスイメージングにより取得したコロニーフィンガープリントに基づくStaphyrococcus族の菌種判別
  第10回バイオ関連化学シンポジウム
  2016年09月08日, その他
• 単一細胞高集積化デバイス上におけるがん細胞分泌タンパク質の免疫測定法の開発
  第10回バイオ関連化学シンポジウム
  2016年09月07日, ポスター発表
• Bioproduction of prostaglandins in the marine diatom Fistulifera solaris expressing cyclooxygenase
  Malaysia-Japan Joint international
  2016年09月06日, その他
• Metabolic Analysis of Fatty Alcohol in a Marine Cyanobacterium Synechococcus sp. NKBG 15041c
  Malaysia-Japan Joint international
  2016年09月06日, その他
• EXPLORATION OF COLD TOLERANT FACTORS IN OLEAGINOUS DIATOM MAYAMAEA SP. JPCC CTDA0820 BY ANALYZING DRAFT GENOME
  11th International Marine Biotechnology Conference
  2016年08月31日, ポスター発表
• CHARACTERIZATION OF A WATER-SURFACE FLOATING GREEN MICROALGA TOWARD BIOFUEL PRODUCTION
  11th International Marine Biotechnology Conference
  2016年08月31日, ポスター発表
• BIOFUEL PRODUCTION BY MARINE DIATOMS: APPROACH BY GENETIC MANIPULATION
  11th International Marine Biotechnology Conference
  2016年08月30日, 口頭発表（招待・特別）
• Nutrient removal and oil production by an oleaginous microalga, chlorella sp. NKG 021201 using municipal wastewater
  6th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2016年06月28日, ポスター発表
• Characterization of the psychrotolerant and oleaginous diatom, Mayamaea sp. JPCC CTDA0820 towards biodiesel fuel production in cool climates in Japan
  6th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2016年06月27日, ポスター発表
• Genetic engineering strategy for enhanced biodiesel fuel production with an oleaginous diatom Fistulifera solaris
  6th International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2016年06月27日, ポスター発表
• オイル高蓄積耐冷性珪藻Mayamaea属JPCCCTDA0820株の培養特性評価及びその関連因子の解析
  第18回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2016年05月29日, その他
• シクロオキシゲナーゼ発現海洋珪藻Fistulifera solarisにおけるプロスタグランジンの生産
  第18回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2016年05月29日, その他
• 海洋珪藻のバイオシリカ工学に基づくバイオプロセス創成
  第18回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2016年05月29日, 口頭発表（招待・特別）
• Colony fingerprinting toward rapid detection and classification of microbial species
  BIOSENSORS2016
  2016年05月25日, ポスター発表
• マイクロコロニーのレンズレスイメージングに基づく簡易・迅速な菌種判別法の開発
  電気化学会第83回大会
  2016年03月29日, その他
• 単一細胞解析に向けた光硬化性ハイドロゲルを利用した細胞単離方法の開発
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• 機能性ペプチドをディスプレイした珪藻珪殻上における無機ナノ結晶の合成
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• 自己抗体計測に向けた甲状腺刺激ホルモン受容体-ナノ磁性粒子複合体の開発
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• Single Bacterial Cell Detection based on the Efficient DNA Recovery Technique with Charge-reversible Magnetic Nanoparticles
  日本化学会 第96春季年会
  2016年03月24日, その他
• Cell-surface display of interactive proteins on the oleaginous diatom Fistulifera solaris for biomass harvesting
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Dynamic oil body generation in the marine oleaginous diatom Fistrulifera solaris JPCC DA0580 following in response to nutrient limitation revealed by morphological and lipidomic analysis
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Characterization of the cold-tolerant oleaginous diatom, Mayamaea sp. JPCC CTDA0820 as potential source for biodiesel production
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Alkane production by genetically engineered marine cyanobacterium Synechococcus sp. NKBG 15041c
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Proteome analysis of the oil body-associated proteins in the marine oleaginous diatom Fistrulifera solaris JPCC DA0580
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Enhancement of biomass productivity in marine oleaginous diatom Fistulifera solaris by silencing of fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein gene
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月19日, ポスター発表
• Rapid circulating tumor cell detection based on wide-field fluorescent imaging system using 2D photosensor
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月18日, ポスター発表
• Single cancer cell isolation on the microcavity array platform using photopolymerizable hydrogel
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月18日, ポスター発表
• Enhanced lipid production in the oleaginous diatom Fistulifera solaris by metabolic engineering
  THE INTERNATIONAL CHEMICAL CONGRESS OF PACIFIC BASIN SOCIETIES 2015
  2015年12月18日, 口頭発表（招待・特別）
• High Throughput Single-Cells Analysis based on Lens-Less Imaging & Cell Microarray
  11th Asian Conference on Chemical Sensors
  2015年11月16日, 口頭発表（招待・特別）
• Rapid identification of bacterial microcolonies based on lens-less imaging
  11th Asian Conference on Chemical Sensors
  2015年11月16日, ポスター発表
• マグネトソームディスプレイによる磁性粒子上へのセルラーゼ複合体の固定化制御
  第67回　日本生物工学大会
  2015年10月27日, ポスター発表
• 混合栄養培養による耐冷性珪藻Mayamaea属のオイル生産性の向上
  第67回　日本生物工学大会
  2015年10月26日, ポスター発表
• 単一細胞高集積化デバイスを用いた細胞外分泌性サイトカインの免疫測定技術の開発
  第67回　日本生物工学大会
  2015年10月26日, ポスター発表
• ２次元フォトセンサを用いた遺伝子診断・細胞診断用バイオセンシングシステムの開発
  第59回化学センサ研究発表会
  2015年09月11日, 口頭発表（招待・特別）
• 血中循環腫瘍細胞の迅速かつ高精度検出に向けた広視野一括撮像システムの構築
  第59回化学センサ研究発表会
  2015年09月11日, その他
• 光硬化性ハイドロゲルを利用した単一細胞ソーティング技術の開発
  第9回バイオ関連化学シンポジウム
  2015年09月11日, ポスター発表
• 表面機能化珪藻の珪殻における酸化チタンの合成
  第9回バイオ関連化学シンポジウム
  2015年09月11日, ポスター発表
• DEPOSITION OF TITANIUM OXIDE ON DIATOM FRUSTULES FOR CREATION OF BIOCATALYTIC MATERIALS
  Molecular Life of Diatoms 2015
  2015年07月07日, ポスター発表
• DYNAMIC OIL BODY GENERATION IN THE MARINE OLEAGINOUS DIATOM FISTRULIFERA SOLARIS FOLLOWING NUTRIENT-LIMITATION REVEALED BY MORPHOLOGICAL AND LIPIDOMIC ANALYSIS
  Molecular Life of Diatoms 2015
  2015年07月07日, その他
• Cell surface　display　of　heterologous　protein　onto　the　surface　of　Fistulifera　solaris　for　the　recovery　of　cells
  5th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2015年06月09日, ポスター発表
• Screening of highly lipid-producing microlagae with potential for biofuel produation using municipal wastewater
  5th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2015年06月09日, ポスター発表
• Molecular insights into　oil　accumulation　in　the　oleaginous　diatom　Fistulifera　solaris　as　revealed　by　the　multi-omics　approach
  5th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2015年06月08日, その他
• 脂質高蓄積海洋珪藻Fistulifera solaris JPCC DA0580の異質倍数性の解析
  第17回 マリンバイオテクノロジー学会大会
  2015年05月31日, 口頭発表（招待・特別）
• 海洋藍藻Synechococcus sp. NKBG 15041c株へのアルカン合成関連遺伝子の導入とアルカン合成に関わる脂肪族化合物の解析
  第17回 マリンバイオテクノロジー学会大会
  2015年05月30日, ポスター発表
• Genetic Transformation System for an Oleaginous and Cold-tolerant Diatom, Mayamaea sp. JPCC CTDA0820
  第17回 マリンバイオテクノロジー学会大会
  2015年05月30日, ポスター発表
• ２次元フォトセンサを利用した新たなバイオ分析手法の確立
  JBAバイオセミナー
  2015年05月11日, 口頭発表（招待・特別）
• Imaging analysis of biomolecules in a living microalga cell using confocal Raman microspectroscopy
  日本化学会 第95回春季年会
  2015年03月28日, その他
• リガンドハンティングに向けた神経成長因子受容体-ナノ磁性粒子の開発
  日本化学会 第95回春季年会
  2015年03月27日, その他
• 表面修飾磁性ナノ粒子を用いた核酸抽出法による微生物１菌体検出技術の確立
  日本化学会 第95回春季年会
  2015年03月26日, その他
• 単一細胞高集積化デバイスを用いた細胞外分泌性分子検出技術の開発
  電気化学会 第82回大会
  2015年03月17日, 口頭発表（一般）
• 遺伝子組換え藻類によるバイオ燃料生産に関する研究・生産の現状と課題
  第３回生物多様性影響評価検討ワーキング・グループ会合
  2014年12月08日, 口頭発表（招待・特別）
• Biofuel Production from the Floating Microalgal Biofilm: an Easy Method to Harvest the Microalgal Biomass
  3rd Asia-Oceania Algae Innovation Summit
  2014年11月19日, ポスター発表
• High Rate of Oil Accumulation by the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris and Its Biological Mechanisms Revealed with the Proteomic Analysis
  3rd Asia-Oceania Algae Innovation Summit
  2014年11月18日, 口頭発表（招待・特別）
• Isolation of Psychrophilic and Cold-Tolerant Diatoms for Stable Biodiesel Production
  3rd Asia-Oceania Algae Innovation Summit
  2014年11月18日, ポスター発表
• Rate-Limiting Factors of Lipid Accumulation in the Oleaginous Diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 as Revealed by the Transcriptome Analysis
  3rd Asia-Oceania Algae Innovation Summit
  2014年11月18日, ポスター発表
• Electrochemical inactivation of bacteria and viruses and the elucidation of action mechanisms
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月08日, 口頭発表（招待・特別）
• Incorporation of titanium into the diatom cell wall towards biosynthesis of photocatalytic materials
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Effects of electrochemical treatment on the inactivation of feline calicivirus, a surrogate for norovirus
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Efficient DNA extraction from a single bacterial cell based on electrostatic interaction using polyamidoamine dendrimer-modified magnetic nanoparticles
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Investigation of the wide-field fluorescent imaging system using a 2D photosensor toward rapid detection of circulating tumor cells
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• A simple method for single cell manipulation using photopolymerizable hydrogel and microcavity array
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• Surface modification of magnetic nanoparticles using designed polypeptides towards biomedical applications
  10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies
  2014年11月06日, ポスター発表
• 2次元フォトセンサを用いたマイクロコロニー形成モニタリング法の開発
  2014年電気化学秋季大会
  2014年09月28日, その他
• Polyamidoamineデンドリマー修飾磁性ナノ粒子を用いた核酸抽出技術によるⅠ菌体レベルからの微生物検出
  2014年電気化学秋季大会
  2014年09月28日, その他
• オイル高蓄積珪藻Fistulifera solaris JPCC DA0580株のオイルボディのプロテオーム解析
  第8回バイオ関連化学シンポジウム
  2014年09月13日, その他
• in vitro docking法による単鎖抗体の磁性細菌粒子上への機能発現
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月11日, ポスター発表
• Lipid profiling of an EPA producing oleaginous marine diatom Fistulifera solaris JPCC DA0580 to predict the EPA incorporation into glycerolipid
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月11日, ポスター発表
• オイル高蓄積珪藻Fistulifera solaris JPCC DA0580株の遺伝子サイレンシング技術の確立
  第8回バイオ関連化学シンポジウム
  2014年09月11日, ポスター発表
• 耐冷性珪藻Mayamaea属JPCC CTDA0820株の高密度培養条件の検討
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月10日, ポスター発表
• オイル高生産微生物藻類Fistulifera solaris JPCC DA0580株のglycerol資化能の向上
  第66回日本生物工学大会
  2014年09月09日, ポスター発表
• Lipid compositional analysis of marine diatom Fistulifera solaris strain JPCC DA0580 using Raman microspectroscopy
  The Second Taiwan International Symposium on Raman Spectroscopy
  2014年06月23日, ポスター発表
• Identification of novel oleosome-associated proteins from the olegainous diatom Fistulifera sp. JPCC DA0580
  4th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2014年06月17日, その他
• Understanding of the Eicosapentaenoic Acid (EPA) synthesis and its incorporation into Triacylglycerol (TAG) in marine oleaginous diatom Fistulifera sp. JPCC DA0580
  4th International Conference on Algal Biomass, Biofuels & Bioproducts
  2014年06月16日, ポスター発表
• 栄養枯渇条件下におけるFistulifera solarisのトランスクリプトーム解析
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年06月01日, その他
• 油脂高蓄積珪藻からの新規珪殻タンパク質の同定
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年06月01日, その他
• 油脂高蓄積珪藻の葉緑体への外来タンパク質輸送技術の確立
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年05月31日, ポスター発表
• 海洋藍藻Synechococcus sp. NKBG 15041c株におけるテトラサイクリン発現誘導システムの構築
  第16回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2014年05月31日, ポスター発表
• Rapid CD4+ cell counting based on single image capture using a microcavity array
  24th Anniversary World Congress on Biosensors
  2014年05月29日, ポスター発表
• Development of automated microcavity array system toward isolation and detection of circulating tumor cells
  24th Anniversary World Congress on Biosensors
  2014年05月29日, ポスター発表
• Microcavity array 方式による血中循環腫瘍細胞自動回収装置の開発
  電気化学会第81回大会
  2014年03月29日, その他
• 二次元フォトセンサを利用した広視野細胞蛍光イメージングシステムの開発
  電気化学会第81回大会
  2014年03月29日, その他
• Environmental microbiology based on bioelectrochemistry
  Electrochemical Conference on Energy & Environment (ECEE 2014)
  2014年03月14日, 口頭発表（招待・特別）
• Metabolic engineering of the diatom for enhanced biofuel production
  Cyanofactory Workshop
  2014年03月07日, 口頭発表（招待・特別）
• Whole genomic analysis and metabolic engineering of oleaginous diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  International Conference on Bio/Mimetic Solar Energy Conversion 2013
  2013年11月23日, 口頭発表（招待・特別）
• Engineering marine diatom Fistulifera sp. JPCC DA0580 toward biodiesel fuel production
  International Symposium on Microalgal Biofuels and Bioproducts
  2013年11月21日, ポスター発表
• 液体燃料製造に向けた海洋バイオマス技術の動向と展望
  第2回ネオ・エネルギー技術シンポジウム次世代エネルギー／エネルギー高度利用
  2013年11月17日, 口頭発表（招待・特別）
• Modification of fatty acid composition by gene silencing of Δ9 desaturase in oleaginous diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  10th International Marine Biotechnology Conference
  2013年11月12日, ポスター発表
• Time-lapse analysis of oleaginous diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 during the triglyceride accumulation using single-cell patterning
  10th International Marine Biotechnology Conference
  2013年11月12日, ポスター発表
• Functional analysis of a key enzyme in PUFA synthesis, Δ9 desaturase, identified from the oleaginous diatom Fistulifera
  10th International Marine Biotechnology Conference
  2013年11月12日, その他
• Metabolic engineering of marine oleaginous diatom towards biofuel production
  10th International Marine Biotechnology Conference
  2013年11月12日, 口頭発表（招待・特別）
• Multi-omics analysis of oleaginous marine diatom
  The 1st Korea-Japan Microalgae Symposium
  2013年10月10日, 口頭発表（招待・特別）
• Polyamidoamineデンドリマー修飾磁性ナノ粒子を用いた1菌体レベルからのDNA回収技術の開発
  2013年電気化学秋季大会
  2013年09月27日, その他
• Microcavity arrayを用いたshadow imagingに基づく細胞カウンターの開発
  2013年電気化学秋季大会
  2013年09月27日, その他
• Global lipidomic analysis for high neutral lipids and EPA producing marine diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 toward the understanding of lipid metabolism under nutrition depletion
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月20日, ポスター発表
• in silicoスクリーニングによるFistuliferasp.からの新規珪殻タンパク質の探索
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月20日, ポスター発表
• 顕微ラマン分光法による海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株の脂質解析
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月19日, ポスター発表
• Microcavity array 技術に基づく血中循環がん細胞自動回収装置の開発
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月19日, ポスター発表
• 温度応答性MHC分子-ナノ磁性粒子複合体を用いたペプチドプールからのがん抗原ペプチドのスクリーニング
  第65回日本生物工学会大会
  2013年09月18日, ポスター発表
• MICROCAVITY ARRAY SYSTEM FOR SIZE-BASED ENRICHMENT OF CIRCULATING TUMOR CELLS FROM SMALL CELL LUNG CANCER PATIENTS
  Fronties of Single Cell Analysis
  2013年09月06日, ポスター発表
• 液体燃料製造に向けた海洋バイオマス利用の研究と開発
  第８回再生可能エネルギー世界展示会
  2013年07月24日, 口頭発表（招待・特別）
• 微細藻類の代謝改変によるバイオ燃料生産への挑戦
  生物工学フォーラム
  2013年07月19日, 口頭発表（招待・特別）
• Multi-omics approach for the elucidation of triacylglycerol (TAG)-accumulation mechanism in the oleaginous diatom Fistulifdera sp.
  EMBO Workshop on The molecular life of diatoms
  2013年06月27日, 口頭発表（招待・特別）
• Discovery of novel proteins localized on　oil bodies of the oleaginous diatom Fistulifera sp.
  EMBO Workshop on The molecular life of diatoms
  2013年06月25日, ポスター発表
• 代謝改変に基づく海洋珪藻Fistulifera属のバイオ燃料生産性の向上
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月02日, 口頭発表（招待・特別）
• 単一細胞パターニングによる海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株のオイル蓄積過程のタイムラプス解析
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月01日, ポスター発表
• 分子育種による海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株のグリセロール資化能の向上
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月01日, その他
• 海洋珪藻Fistulifera.sp JPCC DA0580株の油滴局在タンパク質の分離と同定
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月01日, その他
• 顕微ラマン分光法による海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580 株の脂質イメージング解析
  第15回マリンバイオテクノロジー学会
  2013年06月01日, その他
• オンチップ型微生物センサを用いた細胞毒性評価システムの開発
  電気化学会第80回大会
  2013年03月31日, その他
• ネコカリシウイルスの電気化学的不活化
  電気化学会第80回大会
  2013年03月30日, その他
• 磁性細菌粒子上への抗原ペプチド-MHC class I融合タンパク質の機能発現と細胞分離への応用
  日本化学会第93春季年会
  2013年03月25日, その他
• 磁性細菌粒子上への抗原ペプチド-MHC class I融合タンパク質の機能発現と細胞分離への応用
  日本化学会第93春季年会
  2013年03月25日, その他
• 磁性細菌Magnetospirillum magneticum AMB-1プロテアーゼ欠損株を用いた外来タンパク質高発現磁性粒子の開発
  日本化学会第93春季年会
  2013年03月25日, その他
• 高オイル生産海洋珪藻 Fistulifera sp. JPCC DA0580 株におけるΔ9 desaturase 遺伝子の機能解析
  日本化学会第93春季年会
  2013年03月25日, その他
• 海洋微細藻類の高層化培養によるバイオディーゼル生産
  「二酸化炭素排出抑制に資する革新的技術の創出」研究領域 第四回公開シンポジウム
  2013年01月25日, ポスター発表
• Multiple omics analysis of the oleaginous marine diatom for oil production
  3rd Asian Symposium on Innovative Bio-production, Singapore (i-Bio S)
  2013年01月22日, 口頭発表（招待・特別）
• 我が国の藻類バイオ燃料の創成技術
  第22回インテリジェント材料／システム　シンポジウム
  2013年01月08日, 口頭発表（招待・特別）
• 2030年への挑戦　次世代産業技術 ～藻類を燃料に～
  太陽光化学部会第4回研究講演会
  2012年12月03日, 口頭発表（招待・特別）
• Microcavity Array-Based Living Cell Patterning for Tracking Cellular Behavior at the Single-Cell Level
  International Joint Symposium on Single-Cell Analysis
  2012年11月, ポスター発表
• Seita NAKAMURA, Masahito HOSOKAWA, Tsuyoshi TANAKA, Atsushi ARAKAKI, Tadashi MATSUNAGA, Tomoko YOSHINO
  International Joint Symposium on Single-Cell Analysis
  2012年11月, ポスター発表
• Desulfovibrio magneticus RS-1株への磁気微粒子の形態制御に関与するMagnetospirillum magneticum AMB-1株由来mms6 遺伝子の導入
  第64回日本生物工学会大会
  2012年10月26日, その他
• がん抗原ペプチド探索の効率化に向けた温度応答性MHC分子-ナノ磁性粒子複合体の開発
  第64回日本生物工学会大会
  2012年10月26日, その他
• アルカン合成関連遺伝子の導入による海洋藍藻Synechococcus sp. NKBG 15041c株の炭化水素の生産
  第64回日本生物工学会大会
  2012年10月24日, その他
• 海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株からの効率的な油滴分画法の確立及び油滴局在タンパク質の解析
  第64回日本生物工学会大会
  2012年10月24日, その他
• Development of cell analysis method by using CMOS sensor for high-throughput blood cell profiling
  PRiME 2012
  2012年10月09日, ポスター発表
• Evaluation of electrochemical disinfection of feline calicivirus in aqueous conditions
  PRiME 2012
  2012年10月09日, その他
• Development of high-throughput toxicity assay system integrated with a chemical gradient generator
  PRiME 2012
  2012年10月09日, ポスター発表
• DNAマイクロアレイを用いた製薬環境分離細菌の検出
  第6回バイオ関連化学シンポジウム
  2012年09月06日, ポスター発表
• Microcavity arrayを用いたがん細胞変形能の網羅的計測
  第6回バイオ関連化学シンポジウム
  2012年09月06日, ポスター発表
• 抗原特異的T細胞の磁気分離に向けた単鎖MHC class I 発現ナノ磁性粒子の開発
  第6回バイオ関連化学シンポジウム
  2012年09月06日, ポスター発表
• Isolation and Functional Analysis of Novel Desaturases Involved in Triglyceride Biosynthesis from Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. Strain JPCC DA0580
  The ９ｔｈ　Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2012年07月16日, その他
• Comprehensive Gene Expression Analysis during Triglyceride Accumulation in Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580
  The ９ｔｈ　Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2012年07月16日, その他
• Hydrocarbon Production in Synechococcus sp. Strain NKBG 15041c through the Expression of Heterogeneous Alkane Synthesis Genes
  The ９ｔｈ　Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2012年07月14日, ポスター発表
• Phylogenetic Classification of Closely Relative Green Algae Based on the Intron Sequences within the 18S Ribosomal DNA
  The ９ｔｈ　Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
  2012年07月13日, ポスター発表
• Establishment of Gene Transfoemation Technique of Marine Pennate Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 for Effective Biodiesel Production
  American Society for Microbiology 112th General Meeting
  2012年06月19日, ポスター発表
• Membranous Structure Regulation Protein of Bacterial Organelle for Nano-sized Iron Oxide Biomineralization
  American Society for Microbiology 112th General Meeting
  2012年06月17日, その他
• Transcriptomic Analysis of the Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA0580 toward Biodiesel Production
  The 2nd International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2012年06月12日, 口頭発表（招待・特別）
• Transcriptomic Analysis of the Oleaginous Marine Diatom Fistulifera sp. strain JPCC DA 0580 toward Biodiesel Production
  The 2nd International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts
  2012年06月12日, その他
• 微生物によるバイオミネラル/バイオ燃料の創製
  第27回日本生体磁気学会大会
  2012年06月01日, 口頭発表（招待・特別）
• Development of Microcavity Array System for Enumeration of Circulating Tumor Cells from Whole Blood
  Biosensors 2012
  2012年05月18日, ポスター発表
• A microfluidic system with elastic enclosure and squeezing rollers for a nucleic acid analysis
  Biosensors 2012
  2012年05月17日, ポスター発表
• Development of Thermoresponsive MHC Molecule-conjugated Magnetic Particles for Screening of Cancer Antigen Peptides
  The 2012 MRS Spring Meeting
  2012年04月10日, ポスター発表
• Development of microcavity array system for size- and deformability-based isolation of circulating tumor cells
  AACR Annual Meeting 2012
  2012年04月02日, ポスター発表
• 活性酸素種を利用したネコカリシウイルスの不活化の解析
  電気化学会第79回大会
  2012年03月30日, その他
• 細胞集積化基板を用いた浮遊細胞のタイムラプス解析
  日本化学会第９２春季年会
  2012年03月28日, その他
• 海洋微細藻類由来の新規 glycosylceramides の単離と構造同定
  日本化学会第９２春季年会
  2012年03月27日, その他
• RNA-seqに基づく海洋珪藻Fistulifera sp. solaris株のオイル蓄積機構の解析
  日本化学会第９２春季年会
  2012年03月27日, その他
• アミノ基修飾磁性ナノ粒子の局所加熱を用いた微生物不活化法の開発
  電気化学会第79回大会
  2012年03月20日, その他
• がん抗原ペプチド探索に向けたMHC分子発現磁性細菌粒子の開発
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月27日, その他
• 海洋珪藻 Fistulifera sp. JPCC DA0580株における油滴局在タンパク質のプロテオーム解析
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月27日, その他
• 磁性細菌粒子の形態制御タンパク質の鉄イオンとの相互作用に伴う構造変化
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月27日, その他
• ゲルマイクロドロップ (GMD) を用いた外分泌性リパーゼの高速スクリーニング法の開発
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月26日, その他
• 遺伝子融合技術によるナノ磁性粒子表面の機能創生と応用展開
  第63回日本生物工学会大会
  2011年09月26日, 口頭発表（一般）
• 発現誘導システムを用いた磁性細菌粒子上への甲状腺刺激ホルモン受容体のディスプレイ
  第5回バイオ関連化学シンポジウム
  2011年09月13日, ポスター発表
• Inactivation of feline calicivirus using copper compound nanoparticles
  62nd Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry in Niigata, Japan
  2011年09月12日, ポスター発表
• Development of influenza virus gene detection technique based on localized heating of magnetic nanoparticles
  62nd Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry in Niigata, Japan
  2011年09月12日, ポスター発表
• Development of cell counting system based on CMOS sensor integrated with microcavity array
  62nd Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry in Niigata, Japan
  2011年09月12日, ポスター発表
• 単一浮遊細胞の経時観察に向けた細胞捕捉基板の開発
  第5回バイオ関連化学シンポジウム
  2011年09月12日, ポスター発表
• Microcavity arrayを用いた微量血液からの白血球ポピュレーション解析技術の確立
  第5回バイオ関連化学シンポジウム
  2011年09月12日, その他
• 一価銅化合物を用いたネコカリシウイルス不活化機構の解析
  2011年電気化学秋季大会
  2011年09月11日, その他
• Microcavity arrayを搭載した二次元フォトセンサを用いた細胞解析システムの高精度化
  2011年電気化学秋季大会
  2011年09月11日, その他
• 磁気微粒子の局所加熱による微生物の不活化条件の検討
  2011年電気化学秋季大会
  2011年09月09日, その他
• 脂肪酸組成改変に向けた海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株の形質株の形質転換法の確立
  第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2011年05月29日, その他
• デジタル遺伝子発現解析に基づく海洋珪藻Fistulifera sp. JPCC DA0580株のmRNA動態解析
  第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2011年05月29日, その他
• フイルム培養に向けた海洋付着珪藻の探索及びキャラクタリゼーション
  第14回マリンバイオテクノロジー学会大会
  2011年05月28日, ポスター発表
• 二次元フォトセンサとマイクロ流体デバイスの統合による細胞解析システムの開発
  電気化学会第78回大会
  2011年03月29日, その他
• 細胞集積化技術を用いたイヌ血液からの腫瘍細胞検出
  電気化学会第78回大会
  2011年03月29日, その他
• 銅化合物ナノ粒子を用いたネコカリシウイルスの不活化
  日本化学会第91春季年会
  2011年03月26日, その他
• HIGH-THROUGHPUT PROFILING OF CELL POPULATION BASED ON LARGE-FIELD IMAGING BY CMOS SENSOR
  The 5th International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
  2011年03月04日, ポスター発表
• High throughput cell profiling using CMOS sensor based on lens-less imaging
  2010環太平洋国際化学会議
  2010年12月18日, ポスター発表
• GENOME ANALYSIS OF MARINE PENNATE DIATOM STRAIN JPCC DA0580 AS A HIGH-TRIGLYCERIDE PRODUCER
  9th International Marine Biotechnology Coference (IMBC 2010)
  2010年10月10日, その他
• ESTABLISHMENT OF GENETIC TRANSFORMATION TECHNIQUE FOR MARINE DIATOM STRAIN JPCC DA0580
  9th International Marine Biotechnology Coference (IMBC 2010)
  2010年10月09日, その他
• アスタキサンチン合成海洋細菌の分離とキャラクタリゼーション
  第４回バイオ関連化学シンポジウム
  2010年09月26日, ポスター発表
• 磁性ナノ粒子の局所加熱に基づいた遺伝子検出技術の高感度化
  2010年　電気化学秋季大会
  2010年09月03日, その他
• 2次元フォセンサアレイの白血球機能解析への応用
  2010年　電気化学秋季大会
  2010年09月02日, その他
• 循環腫瘍細胞の迅速検出に向けたマイクロデバイスの開発
  2010年　電気化学秋季大会
  2010年09月02日, その他
• Prediction of metabolic pathways in marine pennate diatom strain JPCC DA0580 based on genome analysis
  The VIIth International Symposium on Inorganic Carbon Utilization by Aquatic Photosynthetic Organisms
  2010年08月31日, 口頭発表（一般）
• Development of on-chip cytometer for single cell analysis using two-dimensional photosensor
  BIOSENSORS2010
  2010年05月28日, ポスター発表
• Real-time imaging of DNA hybridization on microarray using CCD system with microlens array disk
  BIOSENSORS2010
  2010年05月28日, ポスター発表
• Comprehensive analysis of leukocyte cell surface antigens and cell morphology using microfluidic two-dimensional photosensor
  BIOSENSORS2010
  2010年05月26日, ポスター発表
• 磁性ナノ粒子の局所加熱に基づく高効率核酸抽出法の開発
  電気化学会第77回大会
  2010年03月29日, その他
• CMOSセンサを用いた細胞集団のデジタルイメージ解析
  日本化学会第90春季年会(2010)
  2010年03月27日, その他
• トリグリセリドを産生する海産珪藻類の探索
  日本藻類学会第34回大会つくば２０１０
  2010年03月21日, 口頭発表（招待・特別）
• 機能性磁気微粒子のナノ医用工学アプリケーション
  第9回研究交流フォーラム
  2010年03月11日, 口頭発表（招待・特別）
• Development of highly efficient cell entrapment microfluidic chamber fabricated on photosensor array
  Asia Pacific Biochemical Engineering Conference
  2009年11月25日, ポスター発表
• アミンデンドリマー修飾磁性粒子を用いた核酸抽出の効率化
  第24回生体機能関連化学シンポジウム，第12回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2009年09月15日, ポスター発表
• Microcavity arrayを用いた血液からのcirculating tumor cells検出技術の開発
  第24回生体機能関連化学シンポジウム，第12回バイオテクノロジー部会シンポジウム
  2009年09月15日, ポスター発表
• Convergent法を用いた核酸抽出用のアミンデンドリマー修飾磁気微粒子の作製
  2009年電気化学秋季大会
  2009年09月10日, その他
• コンタクトフォトイメージに基づく細胞の特異的検出技術の開発
  2009年電気化学秋季大会
  2009年09月10日, その他
• Microcavity arrayを用いた血液からの希少細胞検出技術の開発
  2009年電気化学秋季大会
  2009年09月10日, その他
• 金属ヨウ化物を利用した生物付着抑制繊維の開発
  2009年電気化学秋季大会
  2009年09月10日, その他
• コンタクトフォトイメージングによる単一細胞解析システムの構築
  2009年電気化学秋季大会
  2009年09月10日, その他
• エネルギー生産に向けた中性脂質産生海洋微細藻類の探索
  第十二回マリンバイオテクノロジー学会
  2009年05月30日, その他
• 海洋細菌JPCCMB0017株の色素増強変異株の解析
  第十二回マリンバイオテクノロジー学会
  2009年05月30日, ポスター発表
• Microfluidic Device using Chemiluminescence and Oligonucleotide-arrayed Thin Film Transistor Photosensor for DNA Sensing
  215th ECS Meeting
  2009年05月26日, ポスター発表
• Digital Cell Counting Using Photosensor Array Integrated with Microfluidic Chamber
  215th ECS Meeting
  2009年05月26日, その他
• Characterization of marine microalga, Scenedesmsus sp. strain JPCC GA0024 toward biofuel production
  31st Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals
  2009年05月, ポスター発表
• コンタクトフォトイメージングによるオンチップ型サイトメーターの開発
  電気化学会第77回大会
  2009年03月31日, その他
• Locked Nucleic Acid (LNA)と指紋認証デバイスを用いた遺伝子診断技術の開発
  2009年（春）電気化学会第76回大会
  2009年03月31日, 口頭発表（一般）
• フォトセンサアレイ上へのマイクロパーティションの構築と細胞のデジタルカウントへの応用
  日本化学会第89春季年会
  2009年03月29日, ポスター発表
• DNA-Arrayed TFT Photosensor for DNA Chip Technology
  PRiME2008 [Pacific RIM Meeting on Electrochemical and Solid-state Science]
  2008年10月16日, その他
• 指紋認証デバイスを利用したバイオセンサの開発
  第４６回化学センサ研究発表会
  2008年09月04日, その他
• Molecular engineering and morphological control of biogenic magnetite particles obtained from magnetotactic bacteria
  16th International Conference on Biomagnetism (Biomag2008)
  2008年08月28日, その他
• 指紋認証デバイスを用いたオンチップ型遺伝子検出用マイクロデバイスの開発
  電気化学第75回大会
  2008年03月30日, その他
• 遺伝子検査用POCバイオセンサの開発
  電気化学会75回大会
  2008年03月29日, 口頭発表（招待・特別）
• Bio-Inspired Crystal Growth of Nano-Sized Magnetite
  7th Pacific Rim Conferenceon Ceramic and Glass Technology
  2007年11月13日, その他
• DNA固定化TFTフォトセンサを用いた オンチップ型遺伝子検出用マイクロデバイスの開発
  2007年電気化学秋季大会
  2007年09月20日, その他
• アミノシラン修飾磁性細菌粒子を用いた高収率な核酸抽出技術の開発
  2007年電気化学秋季大会
  2007年09月20日, その他
• 磁性細菌が生合成するマグネタイトナノ結晶の形成制御機構
  分子研研究会「金属と分子集合」—新領域創成をめざして—
  2007年06月02日, 口頭発表（一般）
• 生物ナノ磁石の生成機構解析とその応用
  分子研研究会「生細胞の分子科学 」
  2007年05月22日, 口頭発表（一般）
• アミンデンドリマー修飾磁性粒子を用いた種子からのＤＮＡ抽出法の改良
  電気化学会第74回大会
  2007年03月30日, その他
• オンチップイオン交換クロマトグラフィーに基づくHbA1cセンサの開発
  電気化学会第74回大会
  2007年03月29日, その他
• バイオナノマグネタイトの細胞医療応用に向けた実用化研究
  生物工学会産学連携シンポジウム
  2007年02月08日, 口頭発表（招待・特別）
• On-chip typed electrochemical device for the detection of HbA1c using ferrocene-labeled with IgG
  The 9nd World Congress On Biosensors
  2006年05月11日, 口頭発表（一般）
• オンチップ型電気化学測定デバイスを用いた糖尿病マーカータンパク質の測定
  電気化学会春季大会
  2006年04月01日, 口頭発表（一般）
• 磁性細菌粒子を用いた膜結合ペプチドのスクリーニング及び抗菌活性評価
  日本化学会
  2006年03月30日, 口頭発表（一般）
• Characterization of Nano-Sized Magnetite Obtained from Magnetic Bacteria
  6th Symposium on Application of Molecular Spins: from Nanomagnets to Biological Spin Systems
  2006年03月14日, 口頭発表（一般）
• Fully Automated SNP Detection System Using Bacterial Magnetite
  International Workshop HITS 2006
  2006年01月27日, 口頭発表（一般）
• A novel capturing method for Cryptosporidium parvum using micro-well array with anti-C. parvum antibody
  The 56th Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry
  2005年09月30日, 口頭発表（一般）
• Electrochemical detection of diabetes markers using on-chip typed device
  The 56th Annual Meeting of the International Society of Electrochemistry
  2005年09月29日, 口頭発表（一般）
• バイオマグネタイトへの分子アセンブリング
  第20回日本生体磁気学会大会
  2005年07月22日, 口頭発表（一般）
• タンパク発現ナノ磁気微粒子による自動免疫測定
  免疫化学測定法研究会・第１０回（2005年）学術集会
  2005年07月01日, 口頭発表（一般）
• バイオマグネタイトの磁気的挙動の解析
  分子スピン：ナノ磁石から生体スピン系まで
  2005年07月, ポスター発表
• 糖尿病マーカータンパク質の電気化学的検出方法を利用したPoint of care (POC) 検査デバイスの構築
  電気化学会春季大会
  2005年04月01日, 口頭発表（一般）
• 磁性細菌が合成するバイオマグネタイトのキャラクタリゼーション
  第３回「分子スピン」シンポジウム
  2005年01月08日, 口頭発表（一般）
• Molecular Engineered Bacterial Magnetite And The Application
  International Conference on Molecular-Based Magnets (ICMM) 2004
  2004年10月05日, 口頭発表（招待・特別）
• 磁性細菌のマグネタイト結晶形成制御因子の解析
  第53回高分子討論会
  2004年09月15日, 口頭発表（一般）
• Molecular Assembling on Nano-Scale Engineered Magnetite Using Amphiphilic Peptide
  2004 Gorden Research Conference on Biomineralization
  2004年08月11日, ポスター発表
• Construction of On-Chip Type Microchip System for DNA Sensing
  10th International Meeting on Chemical Sensors
  2004年07月, 口頭発表（一般）
• アスタキサンチン合成海洋バクテリアのスクリーニングと そのキャラクタリゼーション
  マリンバイオテクノロジー学会２００４
  2004年06月, 口頭発表（一般）
• 磁性バイオコンジュゲートのアッセンブリー技術の構築
  第２回ナノテクノロジー総合シンポジウム
  2004年03月17日, 口頭発表（一般）
• ポイントケア対応医療診断チップの開発
  早大・農工大・産総研および静岡がんセンター研究交流会
  2004年01月20日, 口頭発表（一般）
• Development of chemiluminescence immunoassay system using proteinA-bacterial magnetic particle complexes by recombinant Magnetospirillum magneticum AMB-1
  2000年08月, その他
• マグロボットを用いた糖尿病マーカー測定システムの構築
  2000年03月29日, その他
• Use of bacterial magnetic particles for MFM imaging of recording Media
  1999年07月, その他
• 磁気力顕微鏡による磁性細菌粒子の磁場反転像の観察
  1998年10月, その他
• DNA固定化磁性細菌粒子を用いた、病原性微生物 Legionella pneumophila の特異的検出
  1998年09月29日, その他
• プロテインA-磁性細菌粒子複合体を用いた免疫微量分析法の確立
  1998年09月29日, その他
• Atomic force microscope imaging of individual antigen/antibody interaction in aqueous solutions
  1998年09月, その他
• Fully automated sandwich immunoassay of insulin using bacterial magnetic particles and Mag robot
  1998年06月, その他
• Chemiluminescence enzyme immunoassay using proteinA bacterial magnetite complex
  1998年05月, その他
• 磁気力顕微鏡による磁性細菌粒子の磁場反転像の観察
  1998年04月, その他
• 抗原抗体反応を利用した生体分子のナノサイズパターンのイメージング
  1998年03月, その他
• 磁気力顕微鏡を用いた磁性細菌粒子の磁場像の観察
  1997年09月, その他
• Detection of magnetic bacteria from deep-sea sediments using PCR with magA primers
  1997年05月, その他
• Development of nano-sized actuator using myosin-bacterial magnetic particle conjugate and actin cable on Chara
  1996年11月, その他
• AFMを用いた微生物の特異的検出
  1996年09月, その他
• ミオシン修飾磁性細菌粒子及びアクチンケーブルを用いた磁器制御可能なナノアクチュエーターの構築
  1996年03月, その他
• Development of nano-actuator using a bacterial magnetic particle coated with myosin and actin cables on Chara
  1996年03月, その他
• ミオシン固定化磁性細菌粒子の外部磁場による運動制御
  1995年06月, その他

外部研究資金等

• バイオマスエネルギー技術研究開発／戦略的次世代バイオマスエネルギー利用技術開発事業（次世代技術開発）／好冷性微細藻類を活用したグリーンオイル一貫生産プロセスの構築
  受託研究, 自 2016年04月01日, 至 2017年02月28日
• バイオマスエネルギー技術研究開発／戦略的次世代バイオマスエネルギー利用技術開発事業（次世代技術開発）／好冷性微細藻類を活用したグリーンオイル一貫生産プロセスの構築
  受託研究, 自 2015年04月01日, 至 2016年03月31日
• 微細藻類のゲノミクス解析及び変異体作出
  受託研究, 自 2014年04月01日, 至 2015年03月31日
• バイオマスエネルギー技術研究開発／戦略的次世代バイオマスエネルギー利用技術開発事業（次世代技術開発）／好冷性微細藻類を活用したグリーンオイル一貫生産プロセスの構築
  受託研究, 自 2014年04月01日, 至 2015年03月20日
• バイオマスエネルギー技術研究開発／戦略的次世代バイオマスエネルギー利用技術開発事業（次世代技術開発）／好冷性微細藻類を活用したグリーンオイル一貫生産プロセスの構築
  受託研究, 自 2013年08月06日, 至 2014年03月31日
• 微細藻類のゲノミクス解析及び変異体作出
  受託研究, 自 2013年04月01日, 至 2014年03月31日
• 微細藻類のゲノミクス解析及び変異体作出
  受託研究, 自 2012年04月01日, 至 2013年03月31日
• 集束イオンビームによるナノニードル加工条件の検討
  受託研究, 自 2011年10月01日, 至 2012年03月31日
• 微細藻類のゲノミクス解析及び変異体作出
  受託研究, 自 2011年04月01日, 至 2012年03月31日
• 微細藻類のゲノミクス解析及び変異体作出
  受託研究, 自 2010年04月01日, 至 2011年03月31日
• SNP検査による祖先ルーツ解析用チップの開発
  受託研究, 自 2009年10月07日, 至 2010年03月31日
• 微細藻類のゲノミクス解析及び変異体作出
  受託研究, 自 2009年10月01日, 至 2010年03月31日
• デジタルイメージ計測に基づく細胞解析装置の実用化開発
  共同研究, 自 2009年04月01日, 至 2012年03月20日
• デジタルイメージ計測に基づく細胞解析装置の実用化開発
  共同研究, 自 2009年04月01日, 至 2011年03月20日
• ナノ磁性粒子を利用したPCR-free遺伝子検出法の開発
  受託研究, 自 2008年06月17日, 至 2009年03月31日
• 生物種の同定、分類をシステマチックに実施する方法の開発
  共同研究, 自 2008年04月01日, 至 2009年03月31日
• 疾患に係る遺伝子・タンパクを簡便に測定できる方法の開発
  共同研究, 自 2007年04月01日, 至 2008年03月31日
• グラフト共重合セルロース系基体による微生物の除菌・静菌作用の機構解明、及び除菌・静菌システム開発
  共同研究, 自 2006年11月30日, 至 2007年03月31日
• マイクロビーズチップを用いた極微量RNAの分離技術の開発
  受託研究, 自 2006年09月01日, 至 2007年02月28日
• 多項目糖尿病マーカーを指標としたポイントケア対応オンチップ型デバイスの開発
  共同研究, 自 2005年04月01日, 至 2006年03月31日
• 多項目糖尿病マーカーを指標としたポイントケア対応オンチップ型デバイスの開発
  共同研究, 自 2004年04月01日, 至 2005年03月20日
• 多項目診断マーカーを指標としたポイントオブケア対応オンチップ型デバイスの開発
  共同研究, 自 0000年, 至 0000年

委員歴

• 公益社団法人電気化学会　化学センサ研究会
  役員(副編集委員長)
  自 2017, 至 2019
• 一般財団法人バイオインダストリー協会
  「バイオサイエンスとインダストリー」誌編集委員会　幹事委員
  自 201604, 至 201803
• Elsevier B.V.
  Associate Editor for “Algal Research”
  自 2016, 至 2019

メディア報道

• 油放出する藻類　開発…バイオ燃料　低コスト化期待　大成建設など
  バイオ燃料に関する、田中剛・東京農工大教授（応用微生物学）のコメントが掲載される。
  読売新聞
  自 2023年04月24日, 至 2023年04月24日
• 油放出する藻類　開発バイオ燃料 低コスト化期待大成建設など
  バイオ燃料に関する、田中剛・東京農工大教授（応用微生物学）のコメントが掲載される。
  読売新聞
  自 2023年04月24日, 至 2023年04月24日

所属学協会

• マリンバイオテクノロジー学会
• 日本分子生物学会
• 日本生物工学会
• 日本化学会
• Japanese Society for Marine Biotechnology
• The Molecular Biology Society of Japan
• The Society of Fermentation Technology, Japan
• The Chemical Society of Japan

受賞

• マリンバイオテクノロジー学会
  マリンバイオテクノロジー学会　令和4年度論文賞
  Chromosome Scale Genome Assembly of the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris
  マリンバイオテクノロジー学会論文賞は、各年度に発行された学会誌 Marine Biotechnology 誌（No.1～6）に掲載されたものの中で優れた論文に対して授与される賞で、論文「Chromosome Scale Genome Assembly of the Marine Oleaginous Diatom Fistulifera solaris」が選ばれ、受賞した。
  2023年03月14日
• 日本化学会
  日本化学会優秀講演賞
  磁性細菌粒子を用いた膜結合ペプチドのスクリーニング及び抗菌活性評価
  2006年05月
• マリンバイオテクノロジー学会
  第６回マリンバイオテクノロジー学会大会 ポスタープレゼンテーション 最優秀賞
  2002年